Группа Ju-88 во время вылета на боевую разведку уничтожила русский пароход «Луга» тоннажем 2329 брт. 19 июня она повредила советский эсминец «Сердитый», который впоследствии был затоплен собственным экипажем.
Эсминец «Карл Маркс» 8 августа был сильно поврежден прямым попаданием. Спустя четыре дня он был взорван.
Когда Таллин очистили от русских, а 28 и 29 августа оттуда ушел русский флот, в атаку вылетели все боеспособные самолеты KGr.806. К ним присоединилась 2./KG77, которая тоже летала на Ju-88. В этих налетах были потоплены: ледокол «Кришьянис Вальдемарс», транспорты «Скрунда», «Лейк Люцерн» и «Атис Кронсвальдс», а кроме того, штабной корабль «Вирония», который, однако, был только поврежден, но потом наткнулся на мину и затонул.
29 августа этими же авиачастями был совершен второй налет на русский конвой. В этот раз было потоплено два транспорта и учебный корабль «Ленинградсовет». Еще три судна и среди них плавучий док «Серп и молот» были настолько сильно повреждены бомбами, что им пришлось выброситься на берег.
Последовали и другие операции по постановке мин, на этот раз в районе Повенец на Беломорканале. Шлюзы этого канала подверглись бомбардировкам 15 июля,28 августа и 5 сентября. Попадания бомб выводили их на время из строя.
1 августа в состав Fliegerf"uhrer Ostsee включили самолеты 1./BFGr.196. 15 сентября добавили KGr.506, также оснащенную Ju-88. Однако 27 октября 1941 г. главное командование люфтваффе распустило штаб Fliegerf"uhrer Ostsee. KGr.806 направили в Италию и придали KG54 в качестве третьей группы. KGr.506 вновь была переброшена на Запад и передана 3-му воздушному флоту. 2. и 3./Aufkl.Gr.125(See) после перевооружения на Ar-196 и Bv-138 были отправлены на Черное море.
StG2 оберст-лейтенанта Динорта, которая действовала на северном фланге и пыталась уничтожить советский флот на Балтике, в мае 1941 г. успешно воевала против британского флота в районе острова Крит и изгнала его из этого морского театра. Теперь этой эскадре предстояло напасть на советский флот, стоявший в Кронштадте, и уничтожить его. Необходимо было парализовать морские силы русских и заставить их прекратить охоту на немецкие корабли, перевозившие в Германию шведскую руду.
С аэродрома Тырково 23 сентября 1941 г. вылетели I. и III./StG2. Было 8.45, когда в воздух поднялись первые машины и выстроились в боевой порядок. Полет на Кронштадт проходил в составе эскадрилий. Русские открыли огонь из приблизительно 600 зенитных орудий. Густая завеса из стали разорвала небо на две части. «Штуки» летели на высоте около 5000 м, что позволило снизить прицельность и эффективность зенитного огня. Правда, и пикировать на цель с такой высоты было труднее. Но «Штуки» переворачивались через крыло, похожее на крыло чайки, и, включив сирены, обрушивались на порт. Они уверенно устремлялись на плюющиеся огнем громады кораблей. На высоте 1200 м они сбрасывали свои бомбы, тут же взмывали вверх и, отвернув в сторону, улетали прочь.
В первом же налете бомбы попали в линкор «Марат». По палубе огромного корабля распространялось пламя. «Марату» был нанесен серьезный ущерб.
Но линкор не был потоплен. Одна из следующих машин с пилотом обер-лейтенантом Гансом Ульрихом Руделем, командиром 9./StG2, атаковала его во второй волне. Далее приведем написанный им позднее отчет, который поможет нам получить представление о том, что творилось во время налета: