Генетический детектив. От исследования рибосомы к Нобелевской премии

Захватывающая история об открытии молекул в XVIII и XIX веках изложена в книге Джона Букингема Chasing the Molecule.

Лоуренс Брэгг сам написал отличную научно-популярную статью о кристаллографии X-ray Crystallography (Scientific American, 1968).

Оскорбительное письмо Генри Армстронга было опубликовано в выпуске журнала Nature в 1927 году.

Воспоминания Дж. Д. Бернала и Дороти Ходжкин взяты из двух отличных биографий: Эндрю Брауна (J. D. Bernal: The Sage of Science (2005)) и Джорджины Ферри (Dorothy Hodgkin: A Life

(1998)).

Две очень понятные статьи о том, как преодолевалась проблема с фазами в белковой кристаллографии: Макс Перуц The Hemoglobin Molecule (Scientific American, 1964) и https://www. nobelprize.org/prizes/chemistry/1962/perspectives/.

ГЛАВА 4

Проблему кристаллизации мембранных белков решил Хартмут Михель, которому удалось растворить их при помощи специальных составов, а затем кристаллизовать. В 1988 году он был удостоен Нобелевской премии совместно с Хансом Дайзенхофером и Робертом Хубером за расшифровку структуры первого мембранного белка.

Найджел Анвин лично рассказал мне о своих ранних работах. Также именно он сообщил мне о визите Байерса в LMB.

Мой рассказ о том, как зачиналось исследование рибосом в Берлине, приведенный в этой главе, составлен по электронной переписке с Бригиттой Виттман-Либольд и Фолькером Эрдманом. Кроме того, я подробно поговорил на эту тему с Эрдманном и законспектировал его слова, надеюсь, что точно. Наконец, несколько лет назад я также поговорил об этом с Кнутом Нирхаусом, ведущим химиком-рибосомщиком из Института Виттмана; Нирхаус умер два года назад.

Эпизод с Парадисом известен мне в изложении Уэйна Хендриксона и других, приведенном в письме True identity of a diffraction pattern attributed to valyl tRNA

(Nature, 1983). Ответ Парадиса был опубликован далее, и этот эпизод подробно рассматривался; в частности, там упоминается о его отъезде из Кингс-Колледжа и о прибытии в Свободный Университет Берлина. Недавно Уэйн Хендриксон написал мне электронное сообщение, в котором полностью подтвердил свой анализ.

Боб Флеттерик по электронной почте рассказал мне, как почти отправился в Виттмановский институт работать над рибосомами; позже он узнал лично от Ады Йонат, что его гумбольдтская стипендия была передана ей.

Некоторые факты о ранних годах Ады Йонат приведены в ее автобиографическом эссе по адресу https://www.nobelprize. org/prizes/chemistry/2009/yonath/biographical/.

История о советских работах по кристаллизации рибосомы известна мне от Марии Гарбер, изложившей ее в нескольких электронных письмах. Дополнительную информацию мне сообщили Марат Юсупов и Александр Спирин.

ГЛАВА 6

Подробности о ранних годах Гарри Ноллера можно прочитать в его очень доступном и увлекательном автобиографическом эссе By Ribosome Possessed

(Journal of Biological Chemistry, 2013). Этот материал также доступен в интернете по адресу http://www.jbc.org/content/288/34/24872.short.

ГЛАВА 7

Рассказ о зарождении криокристаллографии, приведенный в этой главе, написан по обширной электронной переписке с Хоконом Хопом и Джоэлом Сассманом. Последние данные также подтверждены Леемором Джошуа-Тором.

ГЛАВА 8

В статье, написаной для симпозиума в Виктории группой Ады (A Milestone in Ribosomal Crystallography: The Construction of Preliminary Electron Density Maps at Intermediate Resolution (Biochemistry and Cell Biology

, 1995) было сказано, что кристаллы 30S обладают симметрией P42(1)2, а не P4(1)2(1)2, как на самом деле; позже второй вариант был подтвержден и моей группой, и группой Ады. Отличие таково: в первом случае четыре молекулы словно разложены по углам квадратного стола, а во втором – на винтовой лестнице.

Что касается субъединицы 50S: в прорывной статье A 9 Å Resolution X-ray Crystallographic Map of the Large Ribosomal Subunit (Cell, 1998) йельская группа утверждала: «Напротив, рисунок, полученный на всех наших рентгенографических картах, не походил на опубликованную ранее рентгеновскую карту плотности большой рибосомной субъединицы H. marismortui, номинально имевшую разрешение 7 ангстрем. Кроме того, описанное здесь расположение субъединиц в единичном кристалле также не соответствует тому, которое выводится в вышеуказанном исследовании по карте, составленной методом Ванга (Schluenzen et.al., 1995)».

ГЛАВА 15

Мнение Крика о том, что Нобелевская премия – это лотерея, хорошо сформулировано в этом видеоинтервью: https:// www.webofstories.com/play/francis.crick/75.

ГЛАВА 21