Во время ремонта «Миоко» и «Хагуро» 5-ю эскадру 25 ноября 1943 года принял контр-адмирал Синтаро Насимото. 16 декабря крейсера вышли из Сасебо в Куре, а оттуда 23-го направилась в Трук, в лагуне которого стали на якорь 29 декабря. Там они находились до 10 февраля и только «Миоко» с 2 по 5 января перевозил войска в Кавьенг.
«Атаго», «Тёкай», «Миоко» и «Хагуро» вышли из Трука 10 февраля перед самым налетом американской палубной авиации и 13-го прибыли в Палау - новую операционную базу Объединенного Флота, расположенную почти на той же широте, но втрое ближе к Филиппинам. Там они простояли в готовности до 29 марта, но 5-я эскадра выходила в море с 9 по 22 марта для эскортирования танкеров «Осе» (бывший голландский «Женота») и «Иро» в Баликпапан (12-13 марта) и Таракан (14-20-го).
«Такао» вышел из Йокосуки 29 января после ремонта повреждений, но на пути в Трук эскортировал поврежденный авианосец «Уньо» назад в Йокосуку. Снова вышел в море 15 февраля и 20-го прибыл на Палау.
Пять тяжелых крейсеров 4-й и 5-й эскадр 4 марта вошли в состав вновь сформированного Первого Мобильного Флота. Все его корабли 29 марта из-за угрозы атак самолетов авианосцев противника 29 марта вышли с островов Палау и с 1 по 4 апреля сосредоточились в бухте Давао на Филиппинах, а 9-го прибыли на Линга Роудз. 1 мая к ним присоединился «Майя», который после реконструкции в крейсер ПВО вышел из Куре 21 апреля вместе с отремонтированным «Ямато», зайдя по пути в Манилу.
«Могами», стоявший на ремонте в Куре 1 января 1944 года был выведен из состава 7-й эскадры и причислен к 1-му Флоту. Но после упразднения 8-й эскадры в 7- ю вошли «Тоне» и «Тикума». 1 февраля 7-я эскадра («Кумано» и «Судзуя») вышла из Трука и 4-го прибыла на Палау, оставаясь там в готовности до 16-го, когда вышла на Линга Роудз (там 21-го). 1 марта вместе с реорганизацией Объединенного Флота в Первый Мобильный Флот (командующий вице-адмирал Джисабуро Одзава) 7-я эскадра была переведена из 3-го Флота, в составе которого теперь оставались только авианосцы, во 2-й. 20 марта командующего 7-й эскадрой контр- адмирала Нисимуру сменил контр-адмирал Кадзутака Сираиси. В Линга крейсера тренировались и прошли вторую военную модернизацию; в это время (с 24 марта по 7 апреля) флагманом вместо «Кумано» был «Тикума». «Могами», закончивший 17 февраля ремонт и модернизацию, 8 марта вышел из Куре со снабжением для армии, которое выгрузил в Сингапуре 15-го, а на следующий день перешел в Линга.
Флагман 16-й эскадры (Флот Юго-Западного района) «Аоба» с 25 февраля действовал из Сингапура и совершил несколько транспортных рейсов в Голландскую Индию и на южные Филиппины.
27 февраля из Сингапура для нарушения судоходства союзников в Индийском океане вышло соединение контр-адмирала Наомаза Саконджу в составе «Тоне» (флагман), «Тикума» и «Аоба». 9 марта «Тоне» к югу от Кокосовых островов в точке с координатами 20°32' ю.ш. 87°10' в.д. потопил британский пароход «Бехар» (1940 г., 7840 гр. Т, собственность Хейн Стимшип Компани). Но тот успел подать предупреждающий сигнал и операцию пришлось отменить. Крейсера зашли в Батавию (15-19 марта) и 25-го вернулись в Сингапур.
2 апреля «Аоба» вышел из Сингапура со снабжением в Баликпапан (выгрузка 4 и 5-го) и Таракан (9 и 10-го), вернувшись 14-го через Баликпапан (11-го). 15-19 апреля он перевозил торпеды из Сингапура в Пенанг, оставаясь там до 18-го. 20 апреля он снова вышел из Сингапура со снабжением в Давао, подобрав по пути уцелевших членов экипажа эсминца «Амагири», погибшего на мине 23 апреля. Высадив моряков в Таракане 24-го, 27- го он прибыл в залив Давао, а на следующий день ушел в Таракан, где стоял в готовности с 29 апреля по 13 мая. Между 13 и 27 мая «Аоба», действуя из Таракана, совершил транспортные рейсы в Давао (14-19 мая) и бухту Соронг (20-24 мая). Он вышел из Таракана 30 мая для участия в транспортной операции “KON” Сакусен. Будучи отозванным 31-го в Замбоанга, он 1 июня прибыл в Давао, на следующий день вышел в Соронг (4-5-го), затем в Амбон (8-9-го) и Батджен (11-14 июня). После отмены операции “KON” Сакусен «Аоба» вернулся в Сингапур 2 июля через Бангка Роудз, остров Целебес (18-25 июня) и Макассар (27-28 июня). 2-25 июля крейсер прошел докование и модернизацию в Сингапуре, 25 июля вышел на Линга Роудз, где простоял в готовности и учениях до 21 октября.
После объявления о начале операции “A Go ” Сакусен 3 мая Первый Мобильный Флот получил приказ сосредоточиться на острове Тави-Тави. 4-я (4 крейсера), 7- я (4 крейсера) эскадры и «Могами» вышли с Линга Роудз 11 мая, 5-я эскадра (2 крейсера) - на следующий день. 14-го и 15-го они прибыли в бухту Тави-Тави. С 15 по 17 мая 7-я эскадра ходила на заправку в Таракан. 30 мая 5-я эскадра вышла для прикрытия подвоза подкреплений на остров Биак (операция “KON”), прибыв на следующий день в Давао. Первый раз она выходила на прикрытие конвоя “KON №1” 2 июня, но 5-го вернулась; второй раз вышла 7-го и 11-го прибыла в Батджен на острове Халмахера.