При формальном равноправии отделов некоторые направления развивались быстрее, образуя сначала филиалы ОКБ-1, затем — самостоятельные организации.
После создания первой ядерной ракеты Р-5 и начала разработки двухступенчатой пакетной ракеты Р-7 в общей структуре отрасли выделились, как принципиально важные, организационные связи в треугольнике ОКБ-
1 — НИИ-456 (двигатели) — НИИ-885 (электрика). Возникла необходимость в создании отдельного испытательного полигона, подчинённого Министерству обороны.
Важным обстоятельством, несколько упрощающим работу НИИ-88 и всего Комитета № 2, была возможность использования на первом этапе работ немецкого опыта по созданию ракеты А-4 (Фау-2). В ядерном проекте аналогичную роль играли данные, предоставленные научно-технической разведкой.
Роль этих сведений необходимо очень точно представлять. Конечно, не могло быть и речи о точном копировании немецких или американских разработок. Например, немцы использовали в ракете А-4 86 марок стали, 59 марок цветных металлов и 87 видов неметаллов. Советская промышленность могла предложить соответственно — 32, 21 и 48. Рулевые машины, изготовленные опытным заводом НИИ-88 «точно по немецким чертежам», не удовлетворяли ни одному требованию ни по статическим, ни по динамическим характеристикам и, кроме того, были негерметичны. В ядерной области, где требования к точности были ещё выше, технологическое отставание выглядело ещё значительнее.
Зарубежный опыт, однако, играл существенную роль в решении административных проблем. Было известно, что ядерную бомбу или управляемую баллистическую ракету сделать в принципе можно, и это имело огромное значение на стадии принятия управленческого решения. Кроме того, учёные и конструкторы точно знали, что стоящая перед ними задача имеет решение.
Как следствие, базовым процессом в советских оборонных мегапроектах было не познание, но управление, прежде всего управление технологиями. Основной задачей был подъём технологической культуры производства, причём за три-пять лет следовало ликвидировать пятидесяти-, семидесятилетнее отставание. Этого можно было достичь исключительно административными методами.
Главным ресурсом системы в решении данной задачи были «красные директора» — опытные управленцы, прошедшие индустриализацию и Отечественную войну, компетентные, жёсткие и успешные.
Понятно, что мегапроекты (прежде всего, атомные) широко использовали административные возможности для привлечения мало— и среднеквалифицированного человеческого капитала.