Весь мир был возмущен вероломством Нидерландов. В конце июля 1947 г. спешно собрался Совет Безопасности ООН для рассмотрения жалобы РИ на голландскую агрессию. Показательно, что он заслушал представителя Республики Индонезии Шарира, но отказал в этом посланцам марионеточных «штатов». СБ ООН потребовал немедленного прекращения огня. Вместе с тем предложения СССР добиться отвода враждующих сторон на исходные рубежи и обратиться к предусмотренному лингаджатским соглашением международному арбитражу в составе комиссии из представителей всех стран–членов Совета Безопасности были дважды отклонены голосами представителей колониальных держав и США. Вместо этого была принята резолюция о создании Комиссии добрых услуг (КДУ) с наблюдательными функциями. Голландия избрала в КДУ представителя колониальной Бельгии, РИ — Австралии, а двое избранных делегатов — представителя США Грехема.
Под нажимом СБ ООН 4 августа правительства Республики и Нидерландов отдали приказ о прекращении огня. Но взаимное ожесточение было столь велико, что война продолжалась. Так, 10 ноября голландская армия оккупировала весь Мадура. Стойкое сопротивление РИ, реакция СБ ООН и международная изоляция заставили Гаагу согласиться на перемирие с Джокьякартой. Но в качестве условия голландцы требовали признания демаркационным рубежом так называемой «линии фан Моока», которая соединяла вершины танковых клиньев, глубоко вонзившихся в территорию РИ, и вывода частей Республики из промежутков между клиньями — «карманов». Это означало, что за РИ оставалась лишь треть ареала Явы и около трех четвертей Суматры. Правительство РИ отказалось, в свою очередь потребовав возвращения оккупированных территорий. Переговоры зашли в тупик.
Несмотря на крайнюю занятость военными и дипломатическими делами, правительство Шарифуддина предприняло ряд мер по улучшению положения трудящихся. Наиболее низкооплачиваемым категориям рабочих была повышена заработная плата. Впервые разработанное трудовое законодательство предусматривало введение рабочей инспекции, семичасового рабочего дня, системы отпусков, компенсации за производственные травмы и т. п. Было положено начало государственному кредитованию мелкокрестьянских хозяйств. И хотя за семь месяцев своего правления кабинет Шарифуддина не все сумел претворить в жизнь, ни одно правительство РИ не сделало для трудящихся большего. Кроме того, Шарифуддин, сохранивший за собой пост министра обороны, разработал план реорганизации ТНИ, предусматривавший усиление ее монолитности, подъем дисциплины и политработу в частях. Обстоятельства и сопротивление верхушки ТНИ помешали премьеру–коммунисту осуществить эти планы.
В декабре 1947 г., не добившись перемирия на своих условиях, голландцы оказались вынуждены вернуться к столу переговоров при посредничестве КДУ. При этом они держались агрессивно, угрожая новым походом на Республику и одновременно создавая новые штаты; два из них — Мадуру и Восточную Суматру — на отторгнутых ими территориях РИ. Не доверяя НИКА, республиканцы отказались прибыть для переговоров в Джакарту. По инициативе КДУ встреча состоялась на борту военного транспорта США «Рéнвилл» в Джакартском заливе. 17 января 1948 г. там было подписано так называемое Рéнвиллское соглашение. Оно предусматривало прекращение огня, признание Республикой «линии фан Моока», вывод из «карманов» почти сорока тысяч бойцов ТНИ. Пункт о совместной жандармерии был снят, однако не предусматривался и отвод голландских войск. Было подтверждено решение — до 1 января. 1949 г. создать федерацию СШИ, а затем унию. Имелись и новые моменты. Так, впредь до создания СШИ фиксировался суверенитет Нидерландов над всей Индонезией; на территориях Явы, Суматры, Мадуры предусматривалось провести плебисциты под наблюдением КДУ, чтобы определить, желают ли они остаться в составе РИ или образовать «самостоятельные» штаты; последним была открыта возможность остаться вне СШИ, установив с этой федерацией и с Голландией особые отношения. Три последних пункта, играющих на руку раскольническим действиям НИКА, были навязаны Шарифуддину КДУ, особенно ее американским председателем, гарантировавшим взамен от имени США сохранение государственной самостоятельности РИ. Сильное давление Грехем оказал и на голландцев, доведя до них опасения госдепартамента США, как бы срыв соглашения не привел к «коммунистической революции» в Индонезии.
Правительство Шарифуддина рассматривало соглашение как временное средство политического урегулирования. Оно было уверено, что плебисцит, проводись он объективно, восстановит территорию Республики в прежних размерах. Напротив, отказ подписать это крайне непопулярное соглашение означал бы не только новый военный натиск голландцев, но, по заявлению Грехема, также устранение от участия в урегулировании конфликта как КДУ, так и США и СБ ООН.