4 ноября 1966 года по инициативе Насера Египет и Сирия заключили Пакт о совместной обороне, согласно которому одна из сторон должна была оказывать помощь другой в случае нарушения ее границ. Пакт носил явную антиизраильскую направленность, поскольку Сирия и Египет могли совместно обороняться только от Израиля, с другими государствами у них общих границ не было. Заключению пакта предшествовало повышение террористической активности ФАТХ. После взрывов в пригороде Иерусалима, а также у поселка Шаар-ха-Голан в Иорданской долине и на израильско-иорданской границе, израильтяне 13 ноября 1966 года провели операцию возмездия, уничтожив поселение на Западном берегу реки Иордан, служившее базой ФАТХ. Совет Безопасности ООН в очередной раз осудил «агрессивные» действия Израиля, не вдаваясь в причины, побудившие израильтян вторгнуться на иорданскую территорию. А в самой Иордании прошли демонстраций протеста против правящей хашимитской династии, не способной защитить страну от «сионистской агрессии». Заодно критиковали и Насера за неоказание Иордании военной поддержки. Но Насер не собирался распылять свои силы. Он не стал направлять войска даже в Сирию, с которой был заключен пакт, а ограничился отправкой военных миссий, которые должны были оказывать сирийцам консультативную помощь.
Война, оказавшаяся шестидневной
7 апреля 1967 года с сирийской территории был обстрелян израильский трактор, находившийся в демилитаризованной зоне. Ответный огонь израильтян привел к авиационному налету, который ВВС Израиля отразили, сбив шесть сирийских истребителей («МиГ-21» советского производства). На суше же произошло танковое столкновение, иначе говоря, пограничный инцидент едва не перерос в «полноценную» войну. Но ситуация была близка к открытым военным действиям – террористические рейды ФАТХ происходили все чаще, а от Советского Союза последовало грозное предостережение в адрес израильтян, которые своими действиями «ставили под угрозу существование своего государства». 11 мая израильское правительство проинформировало Совет Безопасности ООН о том, что в случае продолжения сирийских провокаций Израиль сочтет возможным воспользоваться своим законным правом на самооборону.
На юге события развивались не менее настораживающе, чем на севере и востоке. 17 мая 1967 года Насер потребовал от ООН немедленно вывести свои войска из сектора Газа, а когда это требование было принято, то потребовал убрать гарнизон ООН из Шарм-эш-Шейха. Одновременно с выводом международных миротворческих сил происходило сосредоточение египетских дивизий на Синайском полуострове. 18 мая по каирскому радио, вещавшему на весь арабский мир, было заявлено: «С сегодняшнего дня более не существует международных сил, защищающих Израиль. Мы больше не будем проявлять сдержанность. Мы не станем обращаться в ООН с жалобами на Израиль. Единственным методом в отношении Израиля будет тотальная война, результатом которой станет уничтожение сионистского государства». Министр обороны Сирии Хафез Асад, ставший в 1971 году президентом, поддержал это заявление, заявив, что «сирийская армия держит палец на спусковом крючке». 22 мая в Красное море вошли две египетские подводные лодки, четыре ракетных катера и один эсминец, после чего Насер объявил о возобновлении блокады Эйлатского залива. В Египте, Сирии, Иордании, Ираке и ряде других арабских стран шла мобилизация, всеобщая и частичная.
В Израиле с 16 мая тоже шла мобилизация. Ставка, как и прежде, делалась на упреждающие удары. Этому способствовала позиция Советского Союза, который запретил Египту и Сирии начинать военные действия первыми, поскольку нужно было выставить Израиль агрессором. Но прежде израильское правительство попыталось решить проблему дипломатическим путем, рассчитывая на вмешательство США, Великобритании и Франции. Однако к 1 июня стало ясно, что мировым державам не удастся урегулировать кризис (собственно, никто этим особо заниматься и не пытался).
Премьер-министр Леви Эшколь, занимавший также пост министра обороны, 1 июня передал руководство военным ведомством Моше Даяну, бывшему на тот момент депутатом Кнессета. «В данный момент мы находимся в положении людей, которые, с одной стороны, немного запоздали, а с другой – немного поторопились, – сказал Даян на первом же заседании кабинета министров. – Мы немного запоздали ответить силовыми мерами на закрытие [Эйлатского] пролива и немного поторопились с окончательными выводами относительно результатов дипломатических попыток». Это заявление попало в газеты и было истолковано как неготовность Израиля к войне в ближайшее время. Однако же, утром 4 июня, на следующем заседании кабинета министров было принято окончательное решение о начале военных действий.