После Октябрьской революции Уборевич организовывал красногвардейские отряды в Бессарабии. В январе-феврале 1918 года командовал революционным полком в боях против румын и австрийцев. Был ранен, попал в плен, но бежал. С августа командовал Котласской тяжелой гаубичной батареей, с сентября — Нижне-Двинской бригадой, с декабря по сентябрь 1919-го — 18-й стрелковой дивизией 6-й армии, преграждавшей путь к Вологде. Был награжден орденом Красного Знамени.
С октября 1919 года Иероним Петрович командовал 14-й армией и Ударной группой Южного фронта, которая совместно с 13-й армией Геккера нанесла тяжелое поражение Добровольческой армии под Орлом и Кромами, участвовала в освобождении Курска, Харькова, Полтавы, Херсона, Николаева и Одессы.
По случаю одержанных побед состоялся грандиозный кутеж, эхо которого отозвалось в Москве. Ленин по этому поводу отправил письмо члену реввоенсовета Орджоникидзе:
«Т. Серго! Получил сообщение, что Вы и командарм 14 пьянствовали и гуляли с бабами неделю… Скандал и позор! А я-то вас направо-налево всем нахваливал!! И Троцкому доложено… Ответьте тот час: 1) Кто вам дал вино? 2) Давно ли в РВС 14 у вас пьянство? С кем еще пили и гуляли? 3) Тоже — бабы?… 5) Командарм 14 — пьяница? Неисправим?»…
Товарищ Серго собутыльников не сдал и даже обиделся: ну, отметили, делов-то. В марте-апреле 1920 года, в ходе разгрома белогвардейцев в районах Екатеринодара и Новороссийска, Уборевич командовал 9-й армией Кавказского фронта. За умелое руководство войсками был награжден Почетным революционным оружием. В апреле-июле снова командовал 14-й армией в войне с Польшей, в июле — ноябре руководил боевыми действиями войск сдерживавшей врангелевцев 13-й армии. За бои в районе Бердянск-Мелитополь получил второй орден Красного Знамени. Снова принял 14-ю армию, воевал в Украине с «буржуазно-националистическими бандами», т.е. с крестьянами, которым почему-то не нравились большевики.
В январе-апреле 1921 года, будучи помощником командующего вооруженными силами Украины и Крыма, Иероним Петрович занимался ликвидацией «Гуляй-полевской свободной народной анархической республики» атамана Нестора Махно. С конца апреля при подавлении Тамбовского мятежа был заместителем Тухачевского. Командовал сводной группой из двух кавалерийских бригад и броневого отряда. Летом в качестве командующий войсками Минской губернии громил контрреволюцию в Белоруссии. Как видим, таким образом, это был отменный каратель.
С августа 1921 года командовал 5-й армией и войсками Восточно-Сибирского военного округа. В августе 1922 года Уборевич сменил Блюхера на посту военного министра ДВР и главнокомандующего Народно-революционной армией. Под его руководством была разработана и проведена Приморская операция, завершившаяся взятием Владивостока и отмеченная третьим орденом Красного Знамени. После чего вновь принял 5-ю армию. С ноября 1924 года являлся заместителем командующего и начальником штаба Украинского военного округа.
В 1925 году Уборевича назначили командующим войсками Северо-Кавказского округа, где снова подняли головы «чеченские бандиты». Новый командующий, используя свой богатый опыт борьбы с народом в различных регионах страны, за короткий срок подготовил и провел военную операцию по «разоружению населения Чеченской автономной области».
Согласно инструкции Уборевича, войска Красной Армии окружали чеченские аулы и предлагали в срок не более двух часов сдать все имеющиеся оружие. В случае невыполнения требований населенные пункты обстреливались артиллерией и авиацией до полной капитуляции противника. После чего сотрудники ОГПУ производило изъятие «порочного и бандитского элемента».
Операция началась 25 августа и продолжалась две недели. Артиллерийскому и ружейно-пулеметному обстрелу подвергся 101 населенный пункт, воздушной бомбардировке — 16 аулов, были взорваны 119 домов, арестованы более 300 человек, изъято свыше 25 тысяч винтовок, 4 тысяч револьверов и около 80 тысяч патронов.
В 1927–1928 годы Иероним Петрович учился военному делу в Германии, после чего сменил Ворошилова на посту командующего войсками Московского округа. В 1930–1931 годы был заместителем председателя Реввоенсовета СССР и начальником вооружения РККА. Наконец, в 1931 году принял Белорусский военный округ.
По отзывам сослуживцев, Уборевич любил практическую работу в войсках, в нем была своего рода «военная косточка».