А 16 мая 1883 г. французский адмирал Пьер Галибер без объявления войны бомбардировал Маджунгу. Затем он двинулся к Таматаве, где от имени французского правительства вручил требование уступить Франции треть территории Имерины. Не дожидаясь ответа, Пьер бомбардировал все крупные населенные пункты северо-восточного побережья. Поведение адмирала вызвало возмущение даже в самой Франции. Командир французского корабля доносил: «Адмирал Галибер приказал мне следовать вдоль берега до залива Диего-Суарес и причинить как можно больше вреда. Я сжег все, что мог…» В декабре 1885 г. был заключен мир, причем Франция сохранила контроль над северо-западной частью острова.
В 1886 г. в Мозамбикском проливе северо-западнее Мадагаскара Франция захватила острова Гранд-Комор, Мохели и Анжуан, присоединив, таким образом, к своим владениям всю группу Коморских островов. В 1890 г. была заключена англо-французская конвенция о разделе Тропической Африки и островов Индийского океана. Согласившись на включение ряда территорий Западной Африки и Занзибара в английскую сферу влияния, правительство Франции получило свободу рук на Мадагаскаре, который Великобритания признала французским протекторатом.
В конце 1894 г. после ряда провокационных инцидентов французский резидент Лемир де Вилер направил правительству королевы ультиматум с требованием фактического подчинения французам всей страны. 30 октября 1894 г. королева Ранавалуна III в своей речи так определила содержание этого документа и реакцию правительства Мадагаскара: «Прежде они добивались одной трети нашей земли, и, так как мы отказали, началась война. Сейчас они хотят получить весь Мадагаскар. Они хотят управлять всем островом. Я отказала! И я предупреждаю об этом тебя, народ!»
27 ноября 1894 г. палата депутатов Франции вотировала на войну против Мадагаскара кредиты в 65 млн. франков – в несколько раз больше, чем на любую из экспедиций, когда-либо предпринятых в Тропической Африке.
Любопытно, что британские и другие европейские военные советники немедленно покинули остров.
В феврале 1895 г. 15-тысячный французский корпус высадился близ города Маджунга. В его составе было 5 тысяч французских солдат и 10 тысяч колониальных войск. Отряд генерала Дюшена двинулся к столице. Плохо вооруженная и экипированная малагасийская армия с боями отступала. Но опасность иностранного порабощения придала силы малагасийским воинам. Поэтому путь от Маджунги до Тананариве, который французы рассчитывали пройти триумфальным маршем, затянулся на семь месяцев. За это время малагасийская армия дала французам пять больших и жестоких сражений. Самой мощной и кровопролитной была битва при Царасаутре 29 июня 1895 г.
В конце сентября 1895 г. отряд генерала Дюшена подошел к Тананариве и начал его бомбардировку. Правительство не сумело организовать защиту города, и Тананариве был сдан без боя. Тогда народ, увидев врага у стен города, сам начал строить баррикады, оказывая ожесточенное сопротивление на улицах города. Однако, хоть уличные бои еще продолжались, королева 1 октября подписала договор о протекторате.
15 октября 1895 г. премьер-министр Райнилайаривуни был сослан в одно из своих поместий, а оттуда – в Алжир.
Лишь после окончания боевых действия французское военное министерство опубликовало заниженные цифры потерь. Согласно ему погибло 5700 французских солдат, причем около 90% потерь были санитарными – от тропической лихорадки, брюшного тифа и дизентерии.
Стоит отметить, что Париж не удовлетворился заключением договора о протекторате. Французские олигархи мечтали о полном захвате острова. Договор от 1 октября 1895 г. не только никогда не был ратифицирован, он никогда не был представлен палатам, а уже в декабре того же года правительство Франции передало управление Мадагаскаром из министерства иностранных дел в министерство колоний. В июне 1896 г. французский парламент принял закон, объявивший Мадагаскар и зависимые от него острова французской колонией. Закон был обнародован 6 августа того же года.
В конце 1895 г. основная часть экспедиционного корпуса отправилась в метрополию. На Мадагаскаре осталось около 4,5 тысячи войск, которые дислоцировались большей частью в Тананариве и приморских городах: Таматаве, Диего-Суаресе, Мажунга и др. С помощью этих войск, а также королевской администрации французы установили контроль над областями, населенными мерина, бецилеу, бецимизарака, антанкарана и частично сакалава.
В договоре имелись и другие статьи, сильно ущемлявшие суверенитет правительства Мадагаскара. Так, французы были подсудны лишь французским законам, споры между ними и малагасийцами решал резидент в присутствии малагасийского судьи, французские подданные получали право наибольшего благоприятствования и право долгосрочной (а точнее – бессрочной) аренды земель острова. Франция получала стратегическую базу Диего-Суарес и огромную контрибуцию в 10 млн. франков, вплоть до выплаты которой французы оккупировали порт Таматаве.
Поведение французов вызвало ненависть у большинства местного населения. Началась партизанская война.