Связанные с войной налоговые обременения создавали все больше политических проблем. Испания была самой большой империей в Западной Европе, но ее финансовая, политическая и военная системы не отвечали требованиям военного времени. Попытка в 1624 году создать Вооруженный союз, для того чтобы регионы Испании поставляли войска в соответствии со своими размерами и численностью населения, была отвергнута Каталонией, а в 1627 году правительство обанкротилось. В 1637 году попытки повысить налоги в Португалии привели к восстанию. Кризис, вызванный непомерными расходами и попытками переложить это бремя на чужие плечи, привел в 1640 году к восстанию каталонцев. В этом же году произошло еще одно успешное восстание в Португалии, а в 1641 году в Андалусии возник заговор, целью которого была, вероятно, попытка отделиться и сделать своим королем герцога Медины Сидонию либо попытка свергнуть Оливареса. В 1648 году похожий заговор возник в Арагоне. У Франции, в свою очередь, была своя проблема – Фронда: с 1648 по 1652 год она боролась с чередой смут. Каждая из воюющих сторон стремилась использовать внутренние беспорядки соперницы: так, Франция послала свои войска в Каталонию и использовала вспыхнувшее там восстание, чтобы захватить расположенную посередине провинцию Руссильон – ее столица Перпиньян пала в 1642 году. Кризис и вызванное им общественное недовольство подтолкнули Филиппа IV к разрыву с Оливаресом в 1643 году. Граф-герцог оставил свой пост крайне неохотно. Его сменил племянник, дон Луис де Аро, маркиз Карпио, который был главным министром до своей смерти в 1661 году.
Фронда оказалась полезной для Испании, поскольку дала возможность отвоевать Каталонию. Барселона была возвращены в 1652 году после четырнадцати месяцев осады – голод значительно сократил население города, и без того ослабленное чумой. По условиям Пиренейского мира (1659), подписанного после поражения Испании в битве при Дюнах (она же битва при Дюнкерке, 1658), Франция получила Руссильон и Артуа, а также дочь Филиппа IV в жены молодому Людовику XIV. Этот шаг дал Людовику право претендовать на долю в испанском наследстве. Две державы возобновляли военные действия в 1667–1668, 1673–1678, 1683–1684 и 1689–1697 годах. Испания потеряла значительную часть бургундского наследства, в частности Франш-Конте, который был захвачен французами в 1674 году и окончательно сдан в 1678 году. Однако в 1697 году Людовик вернул Испании Барселону, которую захватил ранее в этом же году.
Далеко не такими обнадеживающими были отношения с Португалией, которой удалось добиться окончательной независимости в войне 1640–1668 годов. Португальцы воспользовались тем, что испанцы в 1640–1652 годах сосредоточились на каталонцах. В 1657–1659 и снова в 1660-х годах, когда обе стороны собрали крупные силы, Испания не смогла отвоевать Португалию. До конца 1650-х годов война представляла собой, по сути, серию мелких набегов и грабежей. В 1657–1659 годах Испании, продолжавшей бороться с Францией и ее новым союзником Англией, не хватало солдат. Правительство пыталось задействовать разные системы набора войск, но в основном полагалось на контрактную систему, где формирование военных подразделений шло на платной основе. Сменявшие друг друга политические и военные кризисы, рост задолженности Испании и большие людские потери существенно ослабили эту систему. Расходы на формирование контрактных войск быстро росли, выводить на поле боя достаточно сил становилось все труднее. К тому же Португалию поддерживала Франция.
В 1663 году Филипп IV, помирившись со всеми, кроме Португалии, сконцентрировал против нее все свои силы и завербовал всех, кого удалось найти, включая набранных в тюрьмах преступников – только для того, чтобы потерпеть поражение при Амейшьяле. Португальцев вовремя поддержали английские войска, присланные Карлом II – он был женат на португальской принцессе. Поражение при Вильявисьосе два года спустя положило конец надеждам на завоевание Португалии.
Теперь к расходам на завоевательную политику добавились расходы на оборону. В период личной унии Португалии и Испании (1580–1640) необходимости в пограничных крепостях не было, и к 1640 году большинство старых укреплений полностью обветшало. И вот, в 1710 году, после тридцати с лишним лет упорной работы Сьюдад-Родриго стал одним из самых хорошо укрепленных городов в Испании. До этого в 1688 году на французского посла произвела большое впечатление мощная и современная цитадель в Памплоне. В последние десятилетия века не возникало восстаний, способных сравниться с теми, которые бушевали в середине столетия. Вдобавок кортесы Кастилии, часто обращавшиеся к королю с жалобами в первой половине столетия, в 1665 году были фактически распущены и, следовательно, больше не могли служить местом сбора недовольных.