Не оскудевала любовь отца Философа к людям, но возгоралась все более и более. Вторично взялся он за строительство храма во имя преподобного Серафима. Вновь удалось ему найти благодетелей, архитектора и строителей. В кратчайшие сроки были доставлены необходимые материалы, и уже 1 октября 1912 года батюшка Философ вместе с настоятелем сгоревшей церкви отцом Борисом Клеандровым освятил место для воздвижения нового храма, 21 ноября были подняты кресты, 6 декабря – колокола. 30 декабря был освящен престол воссозданного храма. Чин освящения храма и Божественную литургию в нем совершил епископ Гдовский Вениамин (Казанский), в сослужении протоиерея Философа Орнатского и других пастырей, при большом стечении молящихся.
2 ноября 1912 года почил о Господе высокопреосвященный митрополит Антоний (Вадковский). Именным Высочайшим Указом от 23 ноября на вдовствующую кафедру митрополитом Санкт-Петербургским и Ладожским был назначен высокопреосвященный Владимир (Богоявленский), митрополит Московский и Коломенский. Это был ревностный архипастырь и вдохновенный проповедник, давний член Общества распространения религиозно-нравственного просвещения. Он же и стал покровителем Общества, в котором к 1913 году было 14 почетных членов, 90 пожизненных, 212 членов-деятелей, 140 членов Религиозно-просветительного Союза, 210 членов Христианского содружества учащейся молодежи, 48 студентов-проповедников, 313 членов-соревнователей и около 300 участников церковно-народных хоров. В таком составе Общество существовало до 1918 года. В конце 1912 года в число членов-деятелей Общества вошли высокопреосвященный Арсений (Стадницкий), архиепископ Новгородский и Старорусский, и ректор Новгородской Духовной семинарии, архимандрит Алексий (Симанский), впоследствии – Святейший Патриарх Московский и всея Руси.
Таким образом, в Обществе, руководимом отцом Философом Орнатским, подвизались три церковных деятеля, которые затем поочередно были Святейшими Патриархами, Предстоятелями Русской Православной Церкви – Василий (Беллавин), Сергий (Страгородский) и Алексий (Симанский). Школу живого пастырского слова прошли в Обществе распространения религиозно-нравственного просвещения десятки митрополитов, архиепископов и епископов, служивших в разных концах России и за рубежом.
Благие деяния отца Философа не давали покоя врагу спасения рода человеческого. Удары, которые наносил сей противник петербургскому пастырю, порою бывали очень чувствительными. По распоряжению управляющего Экспедицией Заготовления Государственных Бумаг Н. И. Тавилдарова 1 августа 1912 года отец Философ без всяких на то оснований был освобожден от должности заведующего Технической Школой при Экспедиции (139). Эта Школа, в которой учащиеся получали среднее образование и специальность, была поистине детищем отца Философа. Его стараниями она зародилась, его стараниями она была доведена до образцового состояния. По адресам, полученным батюшкой в день 25-летия его пастырского служения, видно, с какими неподдельными чувствами благодарности, уважения и любви относились к нему преподаватели, сотрудники и учащиеся Школы.
Решение тайного советника Тавилдарова имело последствия не только нравственного характера. Потеря должности заведующего Технической Школой отцом Философом резко ухудшила материальное положение семьи Орнатских, где к тому времени было уже десять детей – в 1905 году у отца Философа и Елены Николаевны родился сын Александр, в 1908 году – Константин.