Читаем Кто мы и как сюда попали. Древняя ДНК и новая наука о человеческом прошлом полностью

Рисунок 1. Контуры на панели 1а взяты из: L. L. Cavalli-Sforza, P. Menozzi, A. Piazza “Demic Expansions and Human Evolution”, Science 259 (1993): 639–646. Контуры на панели 1б являются интерполяцией численных оценок с илл. 3 в книге: W. Haak et al. “Massive Migration from the Steppe Was a Source for Indo-European Languages in Europe”, Nature 522 (2015): 207–211. Интерполяция выполнена с использованием программы POPSutilities.R из работы: F. Jay et al. “Forecasting Changes in Population Genetic Structure of Alpine Plants in Response to Global Warming, Molecular Ecology (2012): 2354–2368 с параметрами, обоснованными в работе: O. François “Running Structure-like Population Genetic Analyses with R”, June 2016, http:// membres-timc.imag.fr/Olivier.Francois/tutoRstructure.pdf.

Рисунок 2. График показывает данные по 3748 образцам, находящимся во внутренней базе данных моей лаборатории к ноябрю 2017 года; после этого момента данные не добавлялись.

Рисунок 4.

Число генеалогических предков, которые внесли свою часть в наследие конкретного сегодняшнего человека, получено с помощью модельных симуляций Грэмом Купом, и результаты переданы автору. Методика симуляций описана в работе: G. Coop “How Many Genetic Ancestors Do I Have”, gcbias blog, November 11, 2013, https://gcbias.org/2013/11/11/how-does-your-number-of-genetic-ancestors-grow-back-over-time/.

Рисунок 5. По числу мутаций, различающихся в сегменте геномов, полученных от отца и от матери, можно оценить, как далеко во времени отстоит общий предок, давший отцу и матери этот конкретный сегмент. Панель 2 показывает оценки времени существования последнего общего предка 250 геномных пар неафриканцев (сплошная линия) и 44 геномные пары индивидов южнее Сахары; для каждой пары время усреднялось по сегментам геномов, с одинаковым сдвигом рамки. Данные оценки опубликованы в: S. Mallick et al. “The Simons Genome Diversity Project: 300 Genomes from 142 Diverse Populations”, Nature 538 (2016): 201–206. Панель 3 показывает максимальные оценки для каждого сегмента 229 геномных пар, данные из той же публикации.

Рисунок 6. Примерное распространение неандертальцев, как показано на илл. 1 в: J. Krause et al. “Neanderthals in Central Asia and Siberia”, Nature 449 (2007): 902–904.

Рисунок 7.

Расчет общих мутаций основан на сравнении французов, южноафриканцев и неандертальцев в таблице S48 в: Supplementary Online Materials, R. E. Green et al. “A Draft Sequence of the Neandertal Genome”, Science 328 (2010): 710–722.

Рисунок 8. Иллюстрация выполнена по илл. 2 в: Q. Fu et al. “An Early Modern Human from Romania with a Recent Neanderthal Ancestor”, Nature 524 (2015): 216–219.

Рисунок 9.

Иллюстрация выполнена по данным илл. 2. в: Q. Fu et al. “The Genetic History of Ice Age Europe”, Nature 534 (2016): 200–205.

Рисунок 10. Эта круговая диаграмма построена по колонкам AJ и AK в Supplementary Table 2 из: S. Mallick et al. “The Simons Genome Diversity Project: 300 Genomes from 142 Diverse Populations”, Nature 538 (2016): 201–206. Каждая популяция отображается как усреднение по выборке индивидов. Пропорция архаичного наследия посчитана как доля от его максимального значения из всех популяций. Значения меньше 0,03 приравнены к 0, а больше 0,97 – к 1. Из всех проанализированных популяций показаны 47, таким образом, подчеркнуто географическое покрытие и уменьшен визуальный шум.

Рисунок 13.

Иллюстрация миграций в Европе дана по: Q. Fu et al. “The Genetic History of Ice Age Europe”, Nature 534 (2016): 200–205. Распространение льда наложено на карту в соответствии с прорисовками в: “Extent of Ice Sheets in Europe”, Map. Encyclopaedia Britannica Online, https://www.britannica.com/place/Scandinavian-Ice-Sheet?oasmId=54573.

Рисунок 14. Панель (а) дана по илл 4. из: Extended Data в W. Haak et al. “Massive Migration from the Steppe Was a Source for Indo-European Lan guages in Europe”, Nature 522 (2015): 207–211. Панель (б) и врезка на рисунке представлена с разрешения: D. W. Anthony и D. Ringe: Fig. 1 и Fig. 2, “The Indo-European Homeland from Linguistic and Archaeological Perspec tives,” Annual Review of Linguistics 1 (2015): 199–219.

Рисунок 15. Графики на всех трех панелях построены на основе анализа главных компонент по илл. 1b в: I. Lazaridis et al. “Genetic Origins of the Minoans and Mycenaeans”, Nature 548 (2017): 214–218.

Рисунок 16. Круговая диаграмма построена по 180 образцам индивидов, принадлежащих к культуре колоколовидных кубков, чью ДНК удалось прочитать с достаточным разрешением для определения уровня степного наследия. Индивидуальные образцы сгруппированы по странам, где они были найдены. Данные взяты из ревизованной версии: I. Olalde et al. “The Beaker Phenom enon and the Genomic Transformation of Northwest Europe”, bioRxiv (2017): doi.org/10.1101/135962.

Перейти на страницу:

Все книги серии Книжные проекты Дмитрия Зимина

Достаточно ли мы умны, чтобы судить об уме животных?
Достаточно ли мы умны, чтобы судить об уме животных?

В течение большей части прошедшего столетия наука была чрезмерно осторожна и скептична в отношении интеллекта животных. Исследователи поведения животных либо не задумывались об их интеллекте, либо отвергали само это понятие. Большинство обходило эту тему стороной. Но времена меняются. Не проходит и недели, как появляются новые сообщения о сложности познавательных процессов у животных, часто сопровождающиеся видеоматериалами в Интернете в качестве подтверждения.Какие способы коммуникации практикуют животные и есть ли у них подобие речи? Могут ли животные узнавать себя в зеркале? Свойственны ли животным дружба и душевная привязанность? Ведут ли они войны и мирные переговоры? В книге читатели узнают ответы на эти вопросы, а также, например, что крысы могут сожалеть о принятых ими решениях, воро́ны изготавливают инструменты, осьминоги узнают человеческие лица, а специальные нейроны позволяют обезьянам учиться на ошибках друг друга. Ученые открыто говорят о культуре животных, их способности к сопереживанию и дружбе. Запретных тем больше не существует, в том числе и в области разума, который раньше считался исключительной принадлежностью человека.Автор рассказывает об истории этологии, о жестоких спорах с бихевиористами, а главное — об огромной экспериментальной работе и наблюдениях за естественным поведением животных. Анализируя пути становления мыслительных процессов в ходе эволюционной истории различных видов, Франс де Вааль убедительно показывает, что человек в этом ряду — лишь одно из многих мыслящих существ.* * *Эта книга издана в рамках программы «Книжные проекты Дмитрия Зимина» и продолжает серию «Библиотека фонда «Династия». Дмитрий Борисович Зимин — основатель компании «Вымпелком» (Beeline), фонда некоммерческих программ «Династия» и фонда «Московское время».Программа «Книжные проекты Дмитрия Зимина» объединяет три проекта, хорошо знакомые читательской аудитории: издание научно-популярных переводных книг «Библиотека фонда «Династия», издательское направление фонда «Московское время» и премию в области русскоязычной научно-популярной литературы «Просветитель».

Франс де Вааль

Биология, биофизика, биохимия / Педагогика / Образование и наука
Скептик. Рациональный взгляд на мир
Скептик. Рациональный взгляд на мир

Идея писать о науке для широкой публики возникла у Шермера после прочтения статей эволюционного биолога и палеонтолога Стивена Гулда, который считал, что «захватывающая действительность природы не должна исключаться из сферы литературных усилий».В книге 75 увлекательных и остроумных статей, из которых читатель узнает о проницательности Дарвина, о том, чем голые факты отличаются от научных, о том, почему высадка американцев на Луну все-таки состоялась, отчего умные люди верят в глупости и даже образование их не спасает, и почему вода из-под крана ничуть не хуже той, что в бутылках.Наука, скептицизм, инопланетяне и НЛО, альтернативная медицина, человеческая природа и эволюция – это далеко не весь перечень тем, о которых написал главный американский скептик. Майкл Шермер призывает читателя сохранять рациональный взгляд на мир, учит анализировать факты и скептически относиться ко всему, что кажется очевидным.

Майкл Брант Шермер

Зарубежная образовательная литература, зарубежная прикладная, научно-популярная литература
Записки примата: Необычайная жизнь ученого среди павианов
Записки примата: Необычайная жизнь ученого среди павианов

Эта книга — воспоминания о более чем двадцати годах знакомства известного приматолога Роберта Сапольски с Восточной Африкой. Будучи совсем еще молодым ученым, автор впервые приехал в заповедник в Кении с намерением проверить на диких павианах свои догадки о природе стресса у людей, что не удивительно, учитывая, насколько похожи приматы на людей в своих биологических и психологических реакциях. Собственно, и себя самого Сапольски не отделяет от своих подопечных — подопытных животных, что очевидно уже из названия книги. И это придает повествованию особое обаяние и мощь. Вместе с автором, давшим своим любимцам библейские имена, мы узнаем об их жизни, страданиях, любви, соперничестве, борьбе за власть, болезнях и смерти. Не менее яркие персонажи книги — местные жители: фермеры, егеря, мелкие начальники и простые работяги. За два десятилетия в Африке Сапольски переживает и собственные опасные приключения, и трагедии друзей, и смены политических режимов — и пишет об этом так, что чувствуешь себя почти участником событий.

Роберт Сапольски

Биографии и Мемуары / Научная литература / Прочая научная литература / Образование и наука

Похожие книги

12 недель в году
12 недель в году

Многие из нас четко знают, чего хотят. Это отражается в наших планах – как личных, так и планах компаний. Проблема чаще всего заключается не в планировании, а в исполнении запланированного. Для уменьшения разрыва между тем, что мы хотели бы делать, и тем, что мы делаем, авторы предлагают свою концепцию «года, состоящего из 12 недель».Люди и компании мыслят в рамках календарного года. Новый год – важная психологическая отметка, от которой мы привыкли отталкиваться, ставя себе новые цели. Но 12 месяцев – не самый эффективный горизонт планирования: нам кажется, что впереди много времени, и в результате мы откладываем действия на потом. Сохранить мотивацию и действовать решительнее можно, мысля в рамках 12-недельного цикла планирования. Эта система проверена спортсменами мирового уровня и многими компаниями. Она поможет тем, кто хочет быть эффективным во всем, что делает.На русском языке публикуется впервые.

Брайан Моран , Майкл Леннингтон

Зарубежная образовательная литература, зарубежная прикладная, научно-популярная литература