Однако Гитлер позволил Гиммлеру и дальше заниматься своими историческими «исследованиями». А Гиммлер видел большие возможности для изысканий «Аненербе» в Польше, и члены общества прибыли туда еще до окончания боев. В первую очередь их интересовали археологические коллекции, архивы и памятники, имеющие ценность для исследований. Если грабежам в Австрии — и позднее в Западной Европе — пытались придать хотя бы видимость легитимности, то на востоке грабили в открытую.
СС искала артефакты, подтверждающие культурные связи аннексированных провинций с Германией, которые можно было бы использовать для легитимации аннексии Польши, а также книги, произведения искусства и другие предметы польской и еврейской культуры для расовых исследований «Аненербе». Чтобы возглавить охоту, было создано особое подразделение — зондеркоманда под руководством профессора археологии и офицера СС Петера Паульсена. Он тут же составил список самых важных культурных объектов в Польше, которые его группа планировала посетить.
Всего через неделю подразделение обнаружило «немецкий» национальный шедевр, алтарь Вита Ствоша в Мариацком костеле в Кракове. Этот тринадцатиметровый готический алтарь считается североевропейским шедевром переходного периода между готикой и Ренессансом. На создание двухсот резных позолоченных фигур, при помощи которых излагается житие Девы Марии, у немецкого скульптора Файта Штосса (польская версия имени — Вит Ствош) ушло двенадцать лет (1477–1489).
Большая центральная часть изображает драматическую сцену Успения Богородицы в присутствии двенадцати апостолов. Трехметровые фигуры вырезаны из липы. Немецкое происхождение Вита Ствоша позволяло считать алтарь шедевром немецкой культуры, что поляки отлично понимали и сами. Когда войска вермахта приблизились к Кракову, алтарь успели демонтировать и спрятать створки в тридцати шести разных тайниках в сельской местности. Но Паульсену с помощью спецслужб удалось установить местонахождение всех деталей алтаря. В начале октября 1939 года алтарь, более пятисот лет простоявший в Мариацком костеле, был погружен на поезд в Берлин. В Германии его встретили словно блудного сына. Немецкая пропаганда превозносила алтарь Вита Ствоша как доказательство давнего культурного присутствия Германии в Польше.
В остальном же СС не церемонилась с польскими церквями, монастырями и другими святынями. Католическая церковь считалась очагом сопротивления, исповедь на польском языке и паломничества были запрещены, сотни священников казнены, из церквей конфискованы золотые и серебряные предметы, а сами церковные здания использовались как гаражи для военной техники, склады и солдатские клубы.
Тяжелее всего пришлось тем областям, где Гиммлер отвечал за «германизацию» населения, что, в частности, подразумевало депортацию поляков. Из вещей позволялось взять с собой одну сумку со всем необходимым — остальное доставалось СС. Любые напоминания о том, что область когда-то была польской, уничтожались.
Эсэсовцы прочесывали каждый дом, каждый дворец в поисках ценных предметов. В Познани в одной из церквей устроили склад, на который привезли 2,3 миллиона книг, изъятых из частных библиотек. СС конфисковала огромное множество польских и еврейских произведений искусства, пометив их как «культурный китч». В перспективе готовились пропагандистские выставки наподобие «Дегенеративного искусства», которые продемонстрировали бы низкопробность славянского и еврейского искусства и оправдали бы завоевание Польши.
После успешного захвата алтаря Вита Ствоша группа Паульсена занялась опустошением археологических и естественнонаучных собраний Польши. Одной из первых жертв стал варшавский Археологический музей, из которого были изъяты и переправлены в Германию все экспонаты, представлявшие интерес для нацистов. Витрины и фонды Национального музея, Зоологического музея, Военно-исторического музея и Национальной библиотеки Варшавы были вычищены. Из дымящихся руин Варшавы эсэсовцы вынесли мечи викингов, черепа неандертальцев, ритуальные топоры, чучела нильских крокодилов, масонские регалии, череп носорога ледникового периода и
В октябре 1939 года, в день капитуляции Польши, в Варшаву прибыл австрийский историк искусства Каэтан Мюльман. Он стал свидетелем того, как немецкие офицеры выносят серебряные приборы и мебель из разбомбленных королевских дворцов, а эсэсовцы взламывают витрины городских музеев. Он также узнал, что алтарь Вита Ствоша уже отправлен в Берлин. Казалось, Мюльман опоздал на один день, но ему удалось быстро исправить это недоразумение.