Поэтому дивизия формировалась обычными солдатами-призывниками из Красноярска и Владивостока. Однако несколько матросов в ее составе все же оказались. Причем они сразу же повели себя так, как и должны были вести себя настоящие революционные матросы. Уже 29 марта за советскую пропаганду и призывы к мятежу был арестован и расстрелян стрелок 2-го батальона матрос Милишкевич, причем данный случай был не единичен.
Весной – летом 1919 года, после отступления от Перми, дивизия неудачно участвовала в боях с красными. Разбитая 6 июля под Верхнечусовскими Городками, она потеряла только пленными и перебежчиками 2000 солдат – в основном мобилизованных уфимских татар. Большая часть вооружения и снабжения тоже досталась красным. Несколько десятков британских пулеметов даже не успели достать из ящиков. При этом в конце декабря 1918 года морских стрелков более успешно использовали для подавления восстания в Красноярске. Ну, а затем, во время всеобщего отступления колчаковских армий, в январе 1920 года, в том же Красноярске, один из полков дивизии принял самое активное участие в большевистском восстании и в полном составе перешел на сторону красных. «Они потеряли веру и были разочарованы в белом движении, и хотели сохранить свою жизнь», – констатирует исторический документ. Вместе с морскими стрелками перешел на сторону красных и отряд гидроавиации.
Во время отступления осенью 1919 – зимой 1920 годов остатки морской дивизии находились в арьергарде, влившись в колонны генерал-лейтенанта В. О. Каппеля, и прошли с его войсками весь Сибирский ледовый поход. Отступление было крайне тяжелым. Многие в ходе него погибли, разбежались, остались в госпиталях (особенно много морских стрелков осталось в госпиталях Читы). До Байкала в конце февраля 1920 года из четырех тысяч дошли только 300 морских стрелков. На этом дивизия прекратила свое существование.
Добравшиеся до Владивостока полторы сотни морских стрелков сведены в отдельную роту морских стрелков, которая стала личной гвардией командующего Сибирской флотилией контр-адмирала Г. К. Старка и председателя Временного Приамурского правительства С. Д. Меркулова. При этом оставшиеся морские стрелки (в большей своей части вчерашние гимназисты) были переодеты в матросскую форму – бушлаты, брюки и сапоги. На их бескозырках теперь значилось: «Сибирская флотилия».
В июне 1922 года морские стрелки участвовали в военно-политическом перевороте во Владивостоке и приведении к власти контр-адмирала Г. К. Старка. Морские стрелки Старка поддерживали порядок в городе. Впоследствии некоторая часть морских стрелков ушла на кораблях Сибирской флотилии в эмиграцию, остальные разошлись по домам.
Возможно, наиболее удачной задумкой адмирала А. В. Колчака был образованный в июле 1919 года морской учебный батальон численностью в полторы тысячи человек. Возглавил батальон выдающийся офицер капитан 2-го ранга П. В. Тихменев. Батальон считался неофициальной гвардией Колчака. Верховный правитель любил проводить строевые смотры батальона и лично знал практически всех его офицеров.
Личный состав в морской учебный батальон частично набрали в речных флотилиях. Старых матросов и в этом случае не брали, а только гражданских речников. Разумеется, несколькими десятками речников укомплектовать батальон было невозможно. Поэтому по сибирским городам была организована кампания записи добровольцев. Плакаты гласили: «Граждане! Записывайтесь во флот!» Далее описывались условия службы, уровень зарплаты, рекламировалась морская форма, которую получат добровольцы.
В результате в батальон поступило около тысячи студентов и гимназистов, которых также стали именовать морскими стрелками, а не матросами. Вскоре батальон был отправлен на передовую. В сентябре 1919 года у деревни Полойская учебный батальон понес тяжелые потери от артиллерийского огня красных. Спустя пару недель под селом Дубровное стрелки морского учебного батальона пять раз ходили в штыковые атаки, отбивая наступление красных. В ходе этих боев погибло более 350 стрелков, в том числе и командир батальона капитан 2-го ранга П. В. Тихменев. Впоследствии батальон еще несколько раз пополнялся и хорошо дрался в составе 3-й Сибирской армии. В конце концов от батальона осталось каких-то 200 человек.
В Омске остатки батальона стали основой для формируемого учебного морского полка, в состав которого были включен личный состав 3-го Камского дивизиона речных судов и личный состав Обь-Иртышской речной боевой флотилии. Кроме этого снова набрали добровольцев из числа представителей городского среднего класса, зажиточных крестьян, студентов и гимназистов. Любопытно, что в этом случае в полк были принято и некоторое число мобилизованных бывших матросов Балтийского флота (собранных со всей Сибири), насчет которых распорядился лично адмирал А. В. Колчак. Но серьезно повоевать полку уже не довелось, а балтийские братишки доверия не оправдали.