Первый по времени председатель Отдела внешних церковных сношений Московского патриархата (с апреля 1946 г.).
Отец – Дорофей Филофеевич Ярушевич (1860–1930 гг.), потомственный священник белорусского происхождения, протоиерей, настоятель ковенского Александро-Невского собора, энергичный и просвещенный человек, владелец большой библиотеки. Впоследствии законоучитель гимназии в Санкт-Петербурге, на Васильевском острове; в 1920-е годы служил священником в Киевском подворье; скончался 22 сентября 1930 года.
Мать – Екатерина Николаевна Прилуцкая (родилась в 1862 г.), была дочерью причетника Тверской епархии Николая Ивановича Прилуцкого.
Борис Ярушевич окончил в Петербурге гимназию (с золотой медалью). Учился на физико-математическом факультете Санкт-Петербургского университета.
После первого курса перешел в Санкт-Петербургскую духовную академию, которую окончил в 1914 году со степенью кандидата богословия. Слушал лекции на юридическом факультете Санкт-Петербургского университета.
Магистр богословия (1917 г.; тема диссертации «Церковный суд в России до издания Соборного Уложения Алексея Михайловича 1649 г.» (удостоена Макарьевской премии). Подготовил докторскую диссертацию на тему «О бессмертии души», рукопись которой погибла во время блокады Ленинграда. Доктор богословия (1949 г.; за книгу «Слова и речи». Т. 1). Почетный член Ленинградской духовной академии (1952 г.).
Доктор богословия honoris causa богословского евангелического факультета имени Яна Гуса в Праге (1950 г.); Софийской духовной академии (1952 г.); Богословской академии Венгерской реформатской церкви (1953 г.); Православного богословского института в Бухаресте (1954 г.); протестантского Богословского института в Клуже (1955 г.).
23 октября 1914 года пострижен в монашество ректором Академии епископом Анастасием (Александровым), высокообразованным иерархом, оказавшим большое влияние на духовное развитие будущего митрополита. 24 октября 1914 года – иеродиакон; 25 октября – иеромонах.
Вскоре после своего рукоположения в священный сан с именем Николай он выехал на фронт Первой мировой войны, сначала для служения духовником-проповедником в санитарном поезде, а с ноября 1914 года – священником лейб-гвардии Финляндского полка. В 1915 году в связи с тяжелой болезнью (ревматизм с осложнением на сердце) покинул фронт.
С 1915 года – преподаватель литургики, гомилетики, практического руководства для пастырей, церковной археологии, немецкого языка в Петроградской духовной семинарии.
С декабря 1916 года – священник церкви святителя Николая при Николаевской детской больнице.
С декабря 1918 года – и. о. настоятеля Петропавловского собора г. Петергофа.
27 декабря 1919 года стал и. д. наместника Александро-Невской лавры; на следующий день митрополитом Петроградским Вениамином (Казанским) возведен в сан архимандрита.
Под его руководством в лавре издавались «Листки», проводились внебогослужебные беседы, религиозно-философские, богословские и церковно-общественные чтения, действовало Богословско-пастырское училище, в котором архимандрит Николай читал лекции по литургике, гомилетике (церковному проповедничеству).
7 апреля 1922 года в Троицком соборе Александро-Невской лавры был хиротонисан во епископа Петергофского, викария Петроградской епархии. Хиротонию совершили митрополит Петроградский и Гдовский Вениамин (Казанский), епископ Ямбургский Алексий (Симанский), епископ Лужский Артемий (Ильинский) и епископ Кронштадтский Венедикт (Плотников).
Негативно относился к обновленческому движению, официально признанному в 1922 году властями как Православная Российская Церковь. Вместе с другим викарием – епископом Алексием (Симанским) – стоял во главе «Петроградской автокефалии», которая занимала позицию неприсоединения: не подчинялась ни обновленческому Высшему церковному управлению митрополита Антонина (Грановского), ни находившемуся тогда под домашним арестом «бывшему» (по терминологии ВЦУ и властей) патриарху Тихону. После ареста епископа Алексия (Симанского), с октября 1922 года по февраль 1923 года, возглавлял «Петроградскую автокефалию».
В феврале 1923 года был выслан в поселок Усть-Кулом Зырянского края. В это время о. Николай был тяжело болен из-за обострения ревматизма. В ссылке написал акафист Богоматери, который совершал позднее перед Ее иконой, именуемой «Млекопитательница». После окончания ссылки, в начале 1926 года вернулся в Ленинград, поселился в Петергофе (Красный пр., 40), служил в местном Петропавловском соборе.