Вернувшись с деньгами, Елеазар, однако, не смог заложить на Анзере каменный храм, т. к. этого не допустил Соловецкий монастырь, не желавший превращения своего скита в независимую и конкурирующую обитель. Вместо закладки храма, Елеазар оказался (вероятно, ненадолго) в монастырской тюрьме. По преданию, очень популярному среди старообрядцев, Никон поссорился с прп. Елеазаром; Елеазар видел змия, обернувшегося вокруг шеи Никона.
И в ссоре, и в змие можно усомниться, т. к. Никон, вероятно, на всю жизнь сохранил любовь к Анзерской обители и добрые воспоминания о ученичестве у прп. Елеазара. «Некоторые его распоряжения в бытность новгородским митрополитом показывают, что Анзеру он покровительствовал. <…> Это покровительство Анзеру продолжалось и во время патриаршества Никона, что подтверждается двумя его грамотами. <…> Наконец, явно не без вмешательства Никона, в 1654 г. была заложена на Анзере каменная церковь, ради созидания которой Елеазар претерпел столько мучений. Завершения постройки Елеазару не суждено было увидеть. Он скончался 13 января 1656 г. <…> Что касается самого Никона, то внешне его поступки свидетельствуют о благожелательности к Елеазару, который сыграл столь важную роль в его жизни» [47, с. 242]. «Будучи митрополитом Новгородским, Никон писал к Соловецкому архимандриту: “Поберегите Анзерских старцев, строителей и братию”, и предписывал исполнить просьбу старца Елеазара <…>; в 1655 году Патриарх Никон выпросил у царя прибавку свеч, ладану, вина и муки для скита <…> и послал от себя серебряные оклады на иконы и дары скитникам деньгами и рыбою» [145, с. 571–572]. «От Никона в скитскую библиотеку <…> поступило несколько книг <,…> а в казну – священнические ризы и епитрахиль» [153, с. 33–34]. Не исключено, впрочем, что покровительство Новгородского митр. и патр. Никона Анзеру было не вполне искренним, но, скорее, показным, т. к. ему было выгодно напоминать царю Алексею Михайловичу о своей былой близости с прп. Елеазаром.