Протокол этого заседания не велся и о содержании состоявшегося разговора можно судить лишь по отрывочным конспективным записям заведующего Общим отделом ЦК В.Н. Малина и мемуарам ряда его участников, в частности, П.Е. Шелеста, А.Н. Шелепина, Г.И. Воронова и В.В. Гришина. Все выступавшие члены Президиума и Секретариата ЦК, в частности, М.А. Суслов, А.Н. Косыгин, Г.И. Воронов, Д.С. Полянский, А.Н. Шелепин и другие в резких выражениях стали обвинять Н.С. Хрущева в попрании ленинских принципов коллективного руководства, хамском поведении по отношению к своим коллегам по руководящим органам партии, крупных провалах во внешней и внутренней политике, в недопустимых реорганизациях партийно-государственного аппарата, которые привели к настоящему управленческому хаосу, и т.д. Для Н.С. Хрущева все это оказалось настолько неожиданным, что вначале он вел себя достаточно самоуверенно, постоянно перебивал выступающих, бросал язвительные реплики и т.д. Но вскоре ему стало ясно, что все заранее предрешено, что все члены высшего руководства выступают единым фронтом против него, и он сразу сник. Ситуацию не помогло сгладить даже примиренческое выступление А.И. Микояна, который предложил оставить за Н.С. Хрущевым хотя бы один из занимаемых им постов. Все были решительно настроены на полную отставку Н.С. Хрущева со всех постов. Когда самому Н.С. Хрущеву стало окончательно ясно, что он проиграл, он заявил своим коллегам, что бороться с ними не будет, выступать на Пленуме ЦК тоже не будет, извинился за свою грубость и попросил написать за него заявление об отставке с любой подходящей формулировкой, которое он подпишет.
14 октября 1964 г., всего за пару часов до начала работы организационного Пленума ЦК, было принято постановление Президиума ЦК, в котором говорилось:
После завершения горячей «дискуссии» в конце заседания Президиума ЦК были приняты следующие решения:
• посты первого секретаря ЦК КПСС и председателя Совета Министров СССР впредь не совмещать;
• рекомендовать Пленуму ЦК избрать первым секретарем ЦК КПСС тов. Л.И. Брежнева;
• учредить пост второго секретаря ЦК и назначить на этот пост тов. Н.В. Подгорного;
• рекомендовать Верховному Совету СССР назначить на пост председателя Совета Министров СССР тов. А.Н. Косыгина;
• поручить тов. М.А. Суслову от имени Президиума ЦК сделать доклад на Пленуме ЦК и прений по этому докладу не открывать.
В связи с последним обстоятельством необходимо обратить внимание на тот факт, что по данным ряда историков (Р. Пихоя), в реальности были подготовлены два альтернативных доклада Президиума ЦК, тексты которых сохранились в архиве «секретной папки Политбюро ЦК». Первый доклад, который готовился группой А.Н. Шелепина — Д.С. Полянского, содержал в себе очень подробный и аргументированный перечень всех главных провалов хрущевского экономического курса и волюнтаристской внешней политики, поставившей мир на грань ядерной катастрофы. Другой доклад, который, вероятнее всего, готовился в личном аппарате Л.И. Брежнева или М.А. Суслова, носил не столько политический, сколько эмоционально-психологический характер, где упор делался на личных негативных качествах Н.С. Хрущева. Именно этот доклад и был зачитан на Пленуме ЦК, что, по мнению тех же авторов, красноречиво говорило о том, что в закулисной борьбе за власть победу одержала менее радикальная группировка Л.И. Брежнева — М.А. Суслова, которая затем окончательно обретет всю полноту власти в стране.
Вечером 14 октября 1964 г. начал свою работу Пленум ЦК, который по поручению Президиума ЦК открыл Н.В. Подгорный, объявивший членам ЦК, что на повестку дня поставлен вопрос «О ненормальном положении, сложившемся в Президиуме ЦК в связи с неправильными действиями первого секретаря ЦК КПСС Н. Хрущева». С большим докладом по этому вопросу выступил М.А. Суслов, который повторил, но в более развернутом и аргументированном виде, весь тот набор обвинений, который прозвучал в адрес Н.С. Хрущева на заседании Президиума ЦК.