При выполнении сделки имелись большие отступления от контракта, так как компенсация за невыполнение заказа не предусматривалась, чем и воспользовались шведы. Хотя в дальнейшем сделка получила название «паровозной аферы», но в конце 1920 г. Ленин хотел назначить официально беспартийного Ломоносова на пост наркома путей сообщения, но при возражении Дзержинского и Красина отказался от этой идеи.
Благодаря усилиям Ломоносова шведская фирма «Нидквист и Хольм», собственником которой был Гуннар Андерсон, должна была построить для Советской России 1000 паровозов и закупить для нас в Германии, у поставщика «Виктор Бер», 100 паровозов. Договор со шведской фирмой был чрезвычайно интересен. Дело в том, что фирма «Нидквист и Хольм» не имела ничего похожего на производственные мощности для выполнения советского заказа и более 40 паровозов в год никогда не строила.
Ломоносов до самой смерти Великого пролетарского вождя жил в Европе, а в 1927 г. уехал в Англию и стал невозвращенцем. Вскоре он стал гражданином Британии и умер в 1952 г., не имея никаких проблем с СССР. Его не пытались украсть, убить, отравить, как это было с другими невозвращенцами. Нельзя сказать, что Ломоносов украл паровозные деньги. Просто он был посредником между большевиками и кем-то, с кем большевики за что-то расплачивались.
Есть основания предполагать, что никто не позволил бы одному человеку украсть четверть золотого запаса страны. Конечно, немало денег к Ломоносову прилипло, но лишь потому, что дело было слишком тонкое и деликатное. Никакого контроля за деятельностью Ломоносова доверить было нельзя ни Красину, ни даже Дзержинскому. Юрий
Владимирович выполнял прямые директивы Ленина. Какие именно, можно лишь строить гипотезы. Вполне возможно, деньги шли на подготовку революции в Германии – в 1923 г. большой мятеж все-таки удастся спровоцировать. Но нельзя исключать и какие-то иные варианты. Например, расчёт с американскими банкирами, которые субсидировали революцию в России. Основанием этому может служить недавно вышедшая монография А. П. Шемякина «Кто готовил развал СССР». Удивительно, что Ломоносову дали спокойно эмигрировать и не трогали до самой смерти.
В советской историографии Ю. Ломоносов представлен как первый создатель советского тепловоза, выполненного по прямому указанию Ленина. Действительно, в августе 1923 г. по заказу Советского правительства на заводе «Эсслинген» в Германии неподалеку от Штутгарта приступили к сооружению тепловоза под руководством профессора Ю. В. Ломоносова. На постройку тепловоза было выделено 1750000 шведских крон из сбережений Российской железнодорожной миссии. Проектирование велось при непосредственном участии советских инженеров Н. А. Добровольского, В. Б. Меделя и других. Как инженер, Ломоносов взял на себя конструирование холодильника и общей компоновки тепловоза. Но холодильник оказался неудачным, ввиду отсутствия опыта проектирования подобных систем. Машина в теплое время года перегревалась. Новый тепловоз Ю. Ломоносов комплектовал из элементов, доказавших свою жизнеспособность. Прежде всего, использовался дизель завода MAN типа 6V 45/42, зарекомендовавший себя на германских подводных лодках, и швейцарские тяговые электродвигатели, бытовавшие на швейцарских и японских электровозах.
В Москву тепловоз прибыл в январе 1925 г. После серии опытных поездок был включен в список действующего подвижного состава. Конструкция холодильного тендера у тепловоза Ю. В. Ломоносова оказалась не вполне удовлетворительной. Она причиняла немало хлопот по его обслуживанию и ремонту. Поэтому в 1928 г. холодильное устройство коренным образом переделали. После доработки вполне законченный локомотив обслуживал грузовые поезда на безводной Среднеазиатской железной дороге и эксплуатировался до 1954 г. Появление нового тепловоза Ээл 2 стало мировой технической сенсацией и многократно описывалось в мировой технической литературе. Он послужил толчоком для возникновения мирового тепловозостроения как отрасли.
Чтобы представить суммы реальных расходов на «паровозную аферу» достаточно привести выступление Ломоносова 31 октября 1922 г. на заседании СНК с докладом о деятельности Железнодорожной миссии. Было решено: «…для выполнения обязательств по новому (уменьшенному) договору на шведские паровозы и на их перевозку внести следующие золотые кредиты Народного комиссариата путей сообщения РСФСР (НКПС) на квартал октябрь – декабрь 1922 г. – 8000000 зол. руб., в смету на январь – сентябрь 1923 г. – 5000000 зол. руб. и в смету на 1923–1924 бюджетный год (с 1 окт. 1923 г. по 30 сент. 1924) – остальные 2775000 зол. руб., т. е. всего пятнадцать миллионов семьсот семьдесят пять тысяч золотых рублей».