В усугубление сложившейся ситуации, по сообщению из Магадана, 23 января 1946 года заместитель начальника Дальстроя полковник Прун А.Г. «около 8 часов утра у себя на квартире выстрелом в голову смертельно ранил себя» и через несколько часов скончался, о чём Круглов С.Н. после получения этой информации доложил Берия Л.П. Следствие выяснило, что «Прун имел ссоры с женой на семейной почве. Других причин к самоубийству не установлено» [47], но характеризовало общую моральную обстановку в руководящем звене Дальстроя.
Видимо, нервотрепка, связанная с работой любой, а тем более цековской комиссии, сильно повлияла на начальника Дальстроя Никишова И.Ф., и он обратился в НКВД СССР с просьбой о предоставлении ему отпуска для лечения с 15 марта 1946 года «ввиду неудовлетворительного состояния здоровья». Нарком внутренних дел Круглов С.Н. направил на имя Берия Л.П. докладную записку, в которой так откликнулся на эту просьбу: «Тов. Никишов смог бы возвратиться в Дальстрой в первой половине мая с.г. Со своей стороны нахожу необходимым предоставить тов. Никишову отпуск для лечения. Прошу Ваших указаний». В соответствии с полученным «добро» от руководства отпуск Никишов И.Ф. получил с 26 марта по 10 мая 1946 года. Исполнение обязанностей начальника Дальстроя возложили на это время на полковника Гагкаева М.А., которого 4 апреля 1946 года заодно назначили заместителем начальника Главка вместо покончившего с собой предшественника.
В марте месяце 1946 года комиссия ЦК ВКП(б), вернувшаяся из поездки в Магадан, представила доклад с достаточно неожиданным предложением: «В связи с длительным пребыванием в Дальстрое (с 1939 года) начальника Политуправления тов. Сидорова и несработанностью его с начальником Дальстроя, что отрицательно влияет на состояние партийно-политической работы, освободить тов. Сидорова от занимаемой должности и перевести на другую работу». Главк рекомендовалось укрепить новыми кадрами [44]. Начальник Дальстроя вместе с женой оказались вроде бы вообще не при чём.
Приказом МВД СССР от 19 марта 1947 года генерал‑майор Сидоров И.К. был освобождён от занимаемой должности, а на его место получил назначение полковник Шевченко В.Ф., являвшийся до этого ответственным редактором журнала «Пограничник» [47].
Помимо совместного доклада комиссии, инструктор Машков В.И. представил секретарю ЦК Маленкову Г.М., заведовавшему Управлением кадров ЦК ВКП(б), собственную докладную записку, в которой сообщил, что Никишов, возглавляя «сложный коллектив», провёл «большую работу по выполнению важнейших заданий партии и правительства» и зарекомендовал себя «как энергичный, волевой работник и умелый организатор, хорошо освоивший порученный ему участок работы и завоевал заслуженный авторитет среди коллектива Дальстроя». В качестве недостатков отмечалось, что Никишов крайне болезненно реагирует на критику, не терпит возражений и некритичен к подхалимам. Факты, изложенные в анонимном письме, оказались верны, поскольку «он находится под большим влиянием своей жены, которая компрометирует его своим поведением» и «крайне неустойчива в моральном отношении». Гридасова действительно неоднократно премировалась, она же «вмешивалась в расстановку кадров Дальстроя и в депутатские дела Никишова». Далее отмечалось: «Влияние Гридасовой так велико, что даже непосредственные заместители Никишова заявляют, что они могут работать на своих участках до тех пор, пока она к ним благосклонно относится». В качестве вывода рекомендовалось: «Было бы целесообразно указать тов. Никишову на его недостатки и особенно на недостойное поведение его жены».
Однако Маленков Г.М. не успел принять какого-либо решения по этим материалам, поскольку в это время он был освобождён от своих партийных постов, а на его место пришёл Кузнецов А.А. Новый заведующий Управлением кадров ЦК ВКП(б) решил, что в дополнение к уже принятым мерам следовало бы по Дальстрою вынести строгое постановление Секретариата Центрального Комитета партии [44].
Видимо, почувствовав, что руководящее кресло под ним зашаталось и могут последовать крупные неприятности, Никишов И.Ф. 28 октября 1946 года направил на имя Круглова С.Н. следующее письмо:
«Работая в течение семи лет начальником Дальстроя, я все свои силы и всего себя отдал работе, делу. За этот семилетний период, как я работаю начальником Дальстроя, благодаря большой заботе о Дальстрое со стороны Правительства, Центрального Комитета Партии и лично товарища Сталина, Дальстрой вырос в три раза, и эта, когда-то суровая снежная пустыня на далёком Северо-Востоке, превратилась в крупный культурный горно-промышленный край нашей страны.
Работая в течение семи лет в этих тяжёлых суровых климатических условиях, я чувствую, что за последнее время состояние моего здоровья резко ухудшилось, сердечные припадки стали повторяться всё чаще, а также усилился процесс сахарного диабета. Такое состояние моего здоровья не даёт мне возможности бывать часто на приисках, а от этого страдает дело.