После получения «добро» от руководства и партийной инстанции Кузнецова И.К. назначили первым заместителем начальника Дальстроя и присвоили ему звание «инженер-полковник». Участие заместителя министра внутренних дел Завенягина А.П., курировавшего атомный проект, в этом назначении было связано с тем, что опытный специалист направлялся на работу по добыче урана для советской атомной бомбы.
Помимо произведенных ещё ряда назначений, произошли и смещения руководителей. Заместителя начальника Дальстроя по строительству Поспелова М.Л. освободили от занимаемой должности «как не обеспечившего надлежащего руководства порученным ему делом». Другой заместитель начальника Дальстроя Иноземцев К.Д. был снят «за необеспеченность порученного участка работы», а материалы ревизионной комиссии о его неудовлетворительной деятельности, принесшей убытки Дальстрою, передали в Особую инспекцию для расследования. Не прижившегося на Северо-Востоке генерал‑майора Семенова И.П. из первого заместителя перевели на должность заместителя начальника Дальстроя, а затем он был откомандирован в Управление кадров МВД СССР для получения нового назначения.
В ряду отрицательных явлений 18 июля 1949 года Круглов С.Н. подписал приказ МВД СССР, в котором сообщалось о том, что к 1 июля 1949 года Дальстрой был обязан ввести в действие обогатительную фабрику № 14-бис Омсукчанского комбината. В отчётах, поступавших со строительства, докладывалось о готовности фабрики к установленному планом сроку. Произведенной же проверкой было установлено, что «никаких зданий для фабрики не построено», а выполнены лишь нижняя обвязка и каркас отдельных цехов. «За антигосударственную практику и очковтирательство в строительстве предприятий Дальстроя» указанным приказом был снят с должности начальника Управления капитального строительства майор Ахундов М.Д. [47].
Получило продолжение и дело, в котором была замешана жена бывшего «хозяина Колымы» Никишова И.Ф. В конце 1949 года новый начальник УМВД по Дальстрою полковник Кольцов И.И. направил на имя Круглова С.Н. сообщение о том, что арестована группа работников Магаданского ИТЛ МВД «за систематическое присвоение и растранжиривание государственных денежных средств». По этому делу проходили: старший лейтенант Гридасова А.Р., в недавнем прошлом являвшаяся начальником этого лагеря, военный прокурор Дальстроя полковник юстиции Дмитриев и ряд других ответственных работников Главка. «В целях быстрейшего окончания следствия по делу» Кольцов И.И. просил, во-первых, направить в Магадан работника Особой инспекции МВД СССР для расследования фактов злоупотребления служебным положением упомянутыми лицами. Во-вторых, «считал бы целесообразным под благовидным предлогом командировать Гридасову (проживавшую в это время в Москве) в г. Магадан и на месте решить вопрос о её аресте». В-третьих, всех арестованных по данному делу предлагал направить в тюрьму УМВД Хабаровского края, где и вести следствие [47].
Интересную информацию о недостаточном, видимо, режиме секретности в отношении работ, производившихся в Колымском крае, сообщил заместитель министра внутренних дел СССР Чернышов В.В. 29 июня 1949 года он направил Петренко И.Г. «для сведения» перевод из иностранного журнала статьи «Советский Союз — величайшая в мире страна по добыче золота». В сопроводительном письме указал: «Как видите, сведения о Дальстрое как-то проскальзывают в иностранные журналы». Впрочем, империалисты, в отличие от нас, всегда умели считать деньги и потому прекрасно вычислили, какими средствами расплачивался Советский Союз за поставлявшиеся ему товары, а отсюда легко определили и запасы постоянно пополнявшегося золотого фонда страны. Шило, а тем более золото, выходящее на международный рынок, в мешке не утаишь.
В соответствии с решением правительства «в целях повышения производительности труда заключённых и обеспечения выполнения производственных планов Дальстроя», 21 июня 1949 года совместным приказом МВД и Генерального прокурора была введена в действие Инструкция о зачёте рабочих дней заключённым, содержавшимся в колымских лагерях. Согласно этой инструкции, право на зачёты рабочих дней имели все работавшие заключённые, в том числе и осуждённые к каторжным работам, независимо от установленного для них срока наказания, статьи осуждения и времени пребывания в лагере. При условии «соблюдения лагерного режима» (то есть хорошей дисциплины) зачёты устанавливались в следующих размерах: за один день работы при выполнении нормы выработки за месяц от 100 до 110 процентов — 1,5 дня срока наказания; от 111 до 120 % — 1,75 дня; от 121 до 135 % — 2 дня; от 136 до 150 % — 2,5 дня; от 151 % и выше — 3 дня срока наказания [47].