На станциях погрузки в один двухосный вагон, оборудованный «под людские перевозки», загружалось несколько семейств с их имуществом, но не более 30 человек и пяти-шести тонн груза. Не допускалась разбивка семей по разным вагонам или эшелонам. Питание переселяемых в пути следования производилось комендантом поезда в специально установленных пунктах за счёт выделенных для этого средств. Каждый эшелон сопровождали конвой войск НКВД численностью 25 человек, врач и две медсестры с необходимыми медикаментами и инструментами, а также оперативный работник. В обязанности прикреплённого к поезду оперработника входило налаживание связи с имевшейся оперативно-осведомительной сетью среди переселяемых и принятие своевременных мер против попыток побегов или антисоветских действий [43].
Операция по депортации чеченцев и ингушей началась 23 февраля 1944 года и была практически полностью завершена в течение пяти дней. В связи со снегопадом и бездорожьем несколько задержалась вывозка переселявшихся из высокогорных аулов. В основной массе было выселено и погружено в 177 железнодорожных составов, имевших по 65 вагонов каждый, 478479 человек, в том числе 387229 чеченцев и 91250 ингушей. Вслед за простыми гражданами отправился и поезд с руководящими работниками и религиозными авторитетами Чечено-Ингушетии, «которые использовались при проведении операции». За время подготовки и проведения депортации было арестовано 2016 человек «антисоветского элемента», изъято огнестрельного оружия 20072 единицы, в том числе 4868 винтовок, 479 пулемётов и автоматов.
В своей докладной записке Сталину И.В. нарком внутренних дел СССР Берия Л.П. сообщил, что «операция прошла организованно и без серьёзных случаев сопротивления и других инцидентов. Случаи попытки к бегству и укрытию от выселения носили единичный характер, и все без исключения были пресечены» [45].
Вместе с тем в настоящее время приводятся данные о том, что не все обстояло так благополучно: в процессе выселения войска совершали преступления, о которых Берия Л.П. предпочитал не докладывать Верховному Главнокомандующему, хотя, как известно, скрыть что-либо от всевидящего ока Сталина, получавшего информацию по разным, независимым каналам, представлялось весьма проблематичным. Так, имеются сведения, что 27 февраля 1944 года в ауле Хайбах Галанчейского района несколько сотен жителей согнали в колхозную конюшню, заперли и подожгли. Инициатор этого деяния вроде бы известен [45, 63]. Кроме того, в дальнейшем прозвучали и огульные обвинения в насилии над населением и массовых, безрассудных расстрелах [10]. В частности, через полтора десятилетия Круглову С.Н. инкриминировали «грубое нарушение социалистической законности» в том, что, «занимаясь в 1944 году выселением чеченцев и ингушей, он допустил произвол по отношению к выселяемым, применял расстрелы невинных людей, больных стариков и женщин с детьми» [75]. Смею утверждать, что это является абсолютной ложью, поскольку как раз Круглов С.Н., вынужденный в силу своего служебного положения производить выселение чеченцев из Гудермесского района, стремился к тому, чтобы в порученном ему оперативном секторе «социалистическая законность» не нарушалась, и людям была обеспечена возможность взять с собой необходимые вещи и продукты. Более того, эшелон со «своими чеченцами» первый зам наркома лично сопровождал до места назначения, что позволило в пути проследить за предоставлением «пассажирам» питания и питьевой воды и тем самым минимизировать страдания переселявшихся людей.
В Казахстане приём и расселение чеченцев и ингушей проходили достаточно организованно. Для контроля за движением эшелонов, планомерным распределением их по областям и организацией проведения разгрузки, на головные железнодорожные станции командировали заместителей наркома внутренних дел, начальников отделов НКВД Казахстана и представителей Управлений внутренних дел принимавших областей республики. За всем ходом работ по обустройству спецпереселенцев лично следил нарком внутренних дел Казахской ССР Богданов Н.К.