Дикий рев, барабанный бой, предсмертные крики людей заполнили город. Баграт со своей свитой отошел в главную крепость и продолжил борьбу в обреченных условиях окружения. Поэтому отказаться от предложения Тамерлана сдаться было бессмысленно. Пленного Баграта V долго и настойчиво уговаривал Тамерлан принять мусульманскую веру. Оценив сложившуюся обстановку, для временной передышки своего народа, возможной только при его свободе, Баграт V «согласился» — он прикинулся иноверцем.
Расчет Тамерлана был ясен. Впервые столкнувшись с христианами, он понял все трудности и их принципиальное отличие от сравнительно просто покоряемых, а главное, покорных мусульманских народов. Известная веками непоколебимость христианской веры Грузии сделала несбыточным подчинение ее любым формам насилия, зверства и устрашений. Поэтому через согласие царя и его свиты на омусульманивание, Тамерлан рассчитывал при их помощи изменить веру всему народу.
Со своей стороны, Баграт, догадываясь об этих планах Тамерлана, попросил его о вызволении из плена, разрешения вернуться со своей семьей и свитой для царствования в Грузию, а для выполнения главного плана — омусульманивания народа, попросил дать ему значительные воинские силы. Тамерлана вполне устраивали эти предложения, тем более что сам царь Грузии оказывался под контролем его военной машины. Он выделил 12 000 воинов, и Баграт V с ними и со своей свитой тронулся в путь.
Выполнение своей сокровенной тайны о перехвате в надлежащем месте для полного уничтожения татарского отряда Баграт поручил верному азнауру из своей свиты — Егнаташвили. В письме к сыну Георгию он обращал его внимание на тщательный выбор местности с целью надежного перекрытия головной и тыловой частей татарских войск. Всё было исполнено четко. Баграт завел войско татар в узкое ущелье и собранные его сыном грузинские отряды зарубили в сабельной схватке всех до единого.
Эта достойная месть и небывалое для Тамерлана поражение взбесили его. Весной 1387 года он организовывает новый поход на Грузию своими главными силами. К нему примыкают мусульманские силы изменившего Грузии Ширван-шаха, образуя многократное превосходство над грузинскими войсками, наскоро собранными Багратионом и Георгием. Для спасения, народ с равнинных мест был выведен в горы и труднодоступные места. В разыгравшемся страшном бою первых эшелонов одолели грузинские войска, но остатки татар дрались с ожесточением обреченных, ибо за ними стоял заградительный отряд специальной конницы, готовый зарубить любого отступающего.
Однако, видя поражение своих войск и располагая огромными силами, Тамерлан сам возглавил атаку, и, несмотря на большие потери, сила массы одолела меньшую численность. Начались тамерлановские погромы, грабежи. К счастью, большая часть народа укрылась в горах, куда враг не посмел напасть. Орды Тамерлана вдоволь поглумились над церквями, сожгли в монастыре священнослужителей и с награбленным добром удалились.
В 1393 году Тамерлан вторгся в пределы Грузии четырьмя десятитысячными колоннами и, ломая упорное сопротивление, разорил Самцхе, Карскую область, Кола, разрушил и сжег Ахалцихе и другие крепости. Ввиду непрекращающегося противодействия во всех оккупированных областях, основные силы Тамерлана покинули Грузию.
В 1394 году Тамерлан вновь вторгается в пределы Грузии, строго нацеливая действие огромных масс войск к Дарьяльским воротам, через Арагвское ущелье. Этот военный поход он предпринял для упреждения вторжения войск Золотой Орды через Дарьял и Грузию в Иран.
Однако полученные данные оказались ложными: предводитель Золотой Орды — Тохтамыш удар нанес через Дербент. В свою очередь, арагвийцы оказали настолько упорное сопротивление, втягивая основные силы в кровопролитные бои, что Тамерлану не удалось ни прорваться к Дарьяльским воротам, ни успеть с трудом выведенными войсками перехватить уже возвратившегося через Дербент Тохтамыша с награбленным добром.
В 1398 году Георгий VII возглавил освободительное движение против Тамерлана, занятого дальним походом на Индию. Грузинские войска, вместе с силами Осетии, переходят к главным действиям на азербайджанском направлении. Разгромив ряд встречных отрядов, войска Георгия в Нахичевани подошли к мощной крепости Алинджа, которая была окружена безуспешно действующими вот уже 10 лет силами Тамерлана.
Крепость оборонял героический гарнизон под командованием Тахира Джалайриана, отец которого Ахмед, остро поиздевался над Тамерланом, сказав: «