Первая ветеринарная помощь раненым и больным лошадям оказывалась в полковых ветеринарных лазаретах, развертывавшихся обычно в районе полковых складов. Здесь оставались лишь легко раненные и больные лошади, нуждающиеся в лечении не более 7 суток; остальных раненых и больных лошадей направляли в дивизионные ветеринарные лазареты (ДВЛ). В последних проводили лечебную сортировку и оказывали квалифицированную ветеринарную помощь животным, а нуждающихся в лечении более 15 суток эвакуировали в армейские ветеринарные лазареты (АВЛ). Эвакуация из полковых ветеринарных лазаретов осуществлялась их силами и средствами. Иногда она проводилась с помощью дивизионных ветеринарных лазаретов. Эвакуация раненых и больных лошадей в армейские и фронтовые ветеринарные лазареты проводилась эвакуационными ветеринарными лазаретами (ЭВЛ), имевшими автомобильный транспорт. Однако вследствие недостатка транспортных средств 48–55 процентов раненых и больных животных эвакуировалось походным порядком.
Через армейские ветеринарные лазареты за время войны прошло более 680 тыс. лошадей со сроками лечения до 30 суток при коэффициенте выздоравливаемости до 0,94417
. Лечение в этих лазаретах проводилось в специализированных отделениях: хирургическом, терапевтическом и инфекционном. Армия обычно имела один-два АВЛ, размещенных на удалении 50–70 км от переднего края, вблизи станций снабжения или на узлах грунтовых дорог. Каждый АВЛ был рассчитан на 200 лошадей. Он имел свой транспорт (автомобильный и конный) и подразделения обслуживания. АВЛ служили также и учебной базой усовершенствования ветеринарных врачей и ветеринарных фельдшеров. За время войны в АВЛ проведено 333 учебных сбора ветеринарных врачей по вопросам хирургии, 426 — по заразным болезням и 351 — по терапии.Фронтовые ветеринарные лазареты (ФВЛ) служили конечным этапом эвакуации раненых и больных животных. Срок лечения в них не ограничивался. Фронтовой ветеринарный лазарет был рассчитан на 300 лошадей. При необходимости его штат дополнялся личным составом и соответствующими средствами. За время войны во фронтовых ветеринарных лазаретах находилось на излечении более 300 тыс. лошадей. При ФВЛ содержались школы младших ветеринарных фельдшеров и ковочных кузнецов. Размещались фронтовые ветеринарные лазареты в тыловом районе фронта вблизи железнодорожных станций, на направлении эвакуации раненых и больных лошадей из двух-трех армий. Обычно фронты имели от трех до десяти ветеринарных лазаретов. Каждый фронт имел ветеринарный склад и ветеринарную лабораторию, а армия — ветеринарный склад и полевую походную лабораторию.
В начале войны господство в воздухе авиации противника приводило к высоким потерям в конском составе, тем более что войска еще не научились надежно защищать животных от бомбовых ударов и артиллерийского огня противника. Личный состав ветеринарной службы делал все от него зависящее, чтобы защитить и сберечь боевых и транспортных лошадей от поражения огнем противника. В битве под Москвой в 1-м и 2-м гвардейских корпусах генералов П. А. Белова и Л. М. Доватора благодаря настойчивости корпусных ветеринарных врачей М. А. Загороднюка и А. К. Пенякова регулярно принимались меры по маскировке и рассредоточению больших контингентов конского состава в районах сосредоточения и дневок, умело использовались защитные свойства местности, своевременно оборудовались укрытия, что во многом способствовало сохранению конского состава от ударов противника.
В организации ветеринарного обеспечения ударных группировок войск фронтов, участвующих в крупных операциях Великой Отечественной войны, были свои особенности, которые определялись характером операций, временем года, наличием крупных водных преград, условиями местности, эпизоотическим состоянием территории, наличием сил и средств службы и др. Все эти факторы учитывались при планировании, организации и осуществлении ветеринарного обеспечения.
В наступательных операциях осенью 1943 г. по освобождению Левобережной Украины конский состав войск 1-го и 2-го Украинских фронтов был сильно измотан тяжелыми дорожными условиями, чрезмерной эксплуатацией и недостатком фуража. Местных запасов кормов не было, а подвоз их был затруднен из-за большой загруженности железнодорожного транспорта. В результате этого истощенность лошадей достигала в отдельных частях 8 процентов их численного состава. Эти обстоятельства потребовали от ветеринарной службы проведения чрезвычайных мер, направленных на сохранение конского состава и его работоспособности. Особое внимание было уделено разработке и внедрению в практику методов подготовки и скармливания соломы, силоса, веточного корма и др. Наряду с этим создавались специальные пункты лечения и подкормки истощенных лошадей, организация которых отвлекла значительные силы и средства ветеринарной службы.