Перед началом операции из-за растяжки коммуникаций расстояние между армейскими и фронтовыми этапами эвакуации было очень большим. Потребовались значительные усилия ветеринарной службы, чтобы подтянуть часть фронтовых ветеринарных лазаретов ближе к войскам. Основной особенностью организации и осуществления ветеринарного обеспечения войск фронтов, участвующих в Берлинской наступательной операции, как и в других крупных наступательных операциях завершающего периода войны, являлось освоение огромного количества трофейных лошадей, а также бесхозных продовольственных животных, брошенных населением в ходе отступления немецко-фашистских войск. Сбор трофейных лошадей и бесхозных животных производился ветеринарными лазаретами войскового и армейского тыла, а также командами, созданными военными комендатурами в крупных населенных пунктах. Использование трофейных лошадей и бесхозных продовольственных животных допускалось только после их карантинирования и тщательного обследования, в особенности на сап, бруцеллез, туберкулез и др. Для ветеринарной обработки трофейных лошадей были созданы специальные ветеринарные лазареты (ТВЛ), куда трофейные лошади поступали со сборных пунктов. Для их обслуживания привлекалось местное население и использовались местные запасы фуража.
Необходимость выделения сил и средств для сбора, содержания и обработки трофейных лошадей и продовольственных животных за счет ветеринарных лазаретов вызвала их перегрузку, снизила маневренность, усложнила проведение профилактических мероприятий и резко увеличила в них численность раненых и больных лошадей. Между тем на территории фашистской Германии были сильно распространены чесотка, инфекционная анемия лошадей, ящур, бруцеллез и туберкулез крупного рогатого скота. Ветеринарной службе пришлось усилить проведение противоэпизоотических мероприятий в своих войсках и с особым вниманием отнестись к осуществлению ветеринарно-санитарного надзора за довольствием личного состава войск мясными и молочными продуктами. Во избежание использования больных животных на мясо убой их в войсковых частях, где отсутствовал ветеринарный состав, запрещался.
Ветеринарное обеспечение заготовок продовольственных животных из местных ресурсов, проводимых полевыми конторами «Заготскот» Наркомата молочной и мясной промышленности СССР, осуществлялось ветеринарной службой фронтов, которые выделяли для этих целей ветеринарных врачей. Строгое осуществление ветеринарно-санитарного надзора за довольствием личного состава войск позволило избежать появления заразных заболеваний и пищевых отравлений личного состава.
Потери в конском составе в ходе Берлинской операции, равно как и в других наступательных операциях 1945 г., были минимальными. Это объясняется безраздельным господством в воздухе нашей авиации, переходом конноартиллерийских частей на мехтягу, насыщенностью войск танками и артиллерией, возросшим мастерством и опытом личного состава войск и ветеринарной службы по защите лошадей от боевых поражений. Несмотря на отвлечение значительных сил и средств ветеринарной службы армий и фронтов на ветеринарное обслуживание трофейных и бесхозных продовольственных животных, лечебно-эвакуационная работа велась в полном объеме, с большой эффективностью. Выздоравливаемость животных достигала 90 процентов раненых и больных. Такой высокий процент зависел от большого опыта, накопленного личным составом ветеринарной службы за время войны, возросших организаторских способностей ее начальствующего состава, использования эффективных лечебных средств и ряда других факторов. Высокой оперативностью отличалась ветеринарная служба 1-го Белорусского фронта, начальник которой генерал-лейтенант ветеринарной службы Н. М. Шпайер за умелую организацию и осуществление ветеринарного обеспечения войск в ряде наступательных операций, в том числе и Берлинской, наряду с другими орденами был награжден орденом Богдана Хмельницкого. Под его руководством и непосредственном участии ветеринарной службой фронта было издано пять сборников научно-практических работ ветеринарного состава, где всесторонне освещался опыт лечебно-эвакуационной, профилактической и противоэпизоотической работы. Такие же сборники были изданы ветеринарной службой других фронтов. Кроме того, Ветеринарное управление Советской Армии разработало и издало во время войны пять сборников, десятки монографий, инструкций, руководств, справочников, сыгравших важную роль в повышении квалификации личного состава ветеринарной службы, в распространении передового опыта организации и осуществления ветеринарного обеспечения войск в ходе проводимых операций.