Однако, как вскоре стало очевидно, наибольшую активность и, соответственно, озабоченность руководства страны стала вызывать деятельность германской разведки. Этому способствовала не только целеустремленная работа германских разведчиков как военных дипломатов и сотрудников многочисленных германских консульств под прикрытием, но и весьма значительная колония немецких переселенцев, принявших американское гражданство, большая часть из которых была объединена в различные клубы и организации, типа Аусландс-организацион (Организации заграничных немцев), открыто симпатизировавшие нацистскому режиму в Германии. Подлинным руководителем всех этих клубов, или фюрером, как его называли члены данных организаций, был Вальтер Шелленберг, прибывший в США в начале 30-х годов под видом коммерсанта и сумевший сплотить «заграничных немцев», реально возглавить их и, по сути, организовать в США антигосударственную деятельность. Причем в силу опять же слабой проработки американского законодательства в области шпионажа этому в недалеком будущем руководителю внешнеполитической разведки германского нацистского режима удавалось без особого труда обходить препоны контрразведки и лишь в середине июля 1941 года, когда американские власти рассматривали вопрос о его аресте, благополучно выехать в Германию с чувством выполненного долга.
Начиная с середины 30-х годов, в соответствии с соглашением между руководителями разведок стран оси, то есть Германии, Италии и Японии, их представители в США стали координировать свою деятельность и по возможности обмениваться добытой информацией. Все это дало основание Адольфу Гитлеру самоуверенно заявить: «Нет ничего легче, чем организовать фашистский переворот в Соединенных Штатах» [10, с. 47].
Беспрецедентная активизация враждебных разведок на территории США в конце концов вынудила американское руководство еще более ужесточить контрразведывательный режим. Выступая в конце 1938 года на одном из совещаний, президент Ф. Рузвельт заявил: «Наша страна должна быть защищена против этой формы агрессии» [10, с. 194]. 16 июня 1941 года представитель Государственного департамента США на слушаниях в Сенате заявил о том, что «в стране количество иностранных шпионов и диверсантов больше, чем было в годы Первой мировой войны» [10, с. 218]. В этой связи начали приниматься реальные меры в области контрразведывательной борьбы. Число оперативных сотрудников ФБР было увеличено еще на 800 человек. В 1941 году в подчинении руководителя ФБР было уже порядка 150 тыс. агентов.
Решающая роль в оптимизации контрразведывательной борьбы в предвоенные годы, как считают исследователи работы спецслужб США, безусловно принадлежала лично президенту Ф. Рузвельту, который накануне вступления в войну отдал распоряжение о том, чтобы все сведения о шпионаже, контршпионаже, вредительстве и подрывной деятельности направлялись в ФБР. Он же дал санкцию на проведение операций ФБР по прослушиванию телефонных разговоров без соответствующего ордера. К этому времени было выявлено уже порядка 5 тыс. членов влиятельной нацистской организации в США — Германо-американского союза, а также таких пронацистских объединений, как «Гитлеровская молодежь», Ассоциация учителей и др., против которых наконец начали применяться жесткие меры по задержанию и изоляции. Были приняты меры и по принудительному расформированию подобного рода объединений и организаций, а к лету 1941 года и по существенному сокращению, а затем и закрытию всех 22 германских консульств на территории США, небезосновательно подозреваемых в руководстве диверсионными акциями на предприятиях оборонного комплекса. А через некоторое время было арестовано 29 сотрудников консульств, подозреваемых в шпионаже в пользу Германии. С этого момента вся шпионская деятельность в пользу Германии на территории США контролировалась через германское посольство в Вашингтоне. Приблизительно в это же время президент Рузвельт с целью некоторого облегчения бремени ответственности ФБР принял решение о подключении к контрразведывательной работе военного и военно-морского министерств. На военных контрразведчиков была возложена ответственность за профильную работу на армейских базах, в зоне Панамского канала и на Филиппинах. Военно-морские контрразведчики отвечали за безопасность на флотах, на Гавайских островах и на острове Гуам. ФБР по-прежнему занималось борьбой со шпионажем и предотвращением диверсий на всей территории континентальных США, а также в некоторых других зонах американских интересов в Западном полушарии [4]. Однако, по меткому выражению упоминавшегося специалиста в области спецслужб К. Рисса, «американские власти по-настоящему осознали необходимость организации и осуществления контрразведывательной деятельности только тогда, когда Европа уже была объята пожаром новой войны» [10, с. 198]. Тем не менее, указывают критики работы американских спецслужб, власти США даже накануне вступления в войну явно недорабатывали в области контрразведки.