1571–1510 годы до н. э. в истории Вавилонии считаются темным пятном. О том, кто тогда занимал трон государства, неизвестно. Как неизвестно и то, что именно творилось в стране. Одно можно сказать точно: Египет и Хеттское государство находились в глубоком кризисе, а Вавилон все еще существовал, и, по всей вероятности, неплохо. Затем, начиная с 1510 года до н. э., когда на трон державы вступил Бурна-Бураш I, Вавилония стала все больше и больше попадать в зависимость сначала от Египта, а с XIV века до н. э. — от Хеттской державы и нового государства Митанни, расположенного в северной Месопотамии. Последнее, кстати, отрезало Вавилонию от основных торговых путей, ведущих в Малую Азию и на побережье Средиземного моря. Приблизительно в 1155 году до н. э. касситская династия прервалась. Вавилония, переживающая очередной виток упадка, в XII–VII веках до н. э. оказывается под властью Ассирии. Тогда же в жизни страны значительную роль стали играть халдеи.
Во время царствования Саргона II ассирийцы не смогли удержать власть над Вавилоном; царю удалось освободить страну от завоевателей и некоторое время противостоять их напору. Тем не менее, в 689 году до н. э., после годичной осады, организованной ассирийским правителем Синанххеррибом, город пал. Победители учинили жесточайшую расправу над уцелевшими жителями. Тогда же часть побежденных была угнана в рабство, а сам Вавилон уничтожен (для верности!) дважды: разрушен до основания, а затем затоплен. Когда на трон Ассирии вступил Асархаддон, он повелел восстановить древний город и вернуть на родину его уцелевших жителей. Вавилония была объявлена вассалом ассирийского монарха; трон некогда могущественного государства занял Шамаш-шум-укин. В 652 году до н. э. он организовал заговор с целью выхода из-под власти Ассирии. В итоге в 648 году до н. э. Вавилон был в очередной раз разрушен, а его население уничтожено…
Следующий этап в истории страны носит название нововавилонского. Последняя династия царей правила Вавилоном в 625–538 годах до н. э. За это время на троне успели смениться шесть правителей, каждый из которых оставил заметный след не только в истории самого государства, но и во всемирной истории. Основателем новой династии стал халдейский вождь Набопаласар, возглавивший вспыхнувшее в 626 году восстание против ассирийского владычества. Набопаласар утвердил свою власть на севере страны, затем, заключив союз с Эламом, провел ряд удачных походов против ассирийцев. Вавилон перешел на сторону халдея в октябре следующего года, а 25 ноября Набопаласар торжественно короновался на царство. Этот правитель стал виновником крушения Ассирийской державы и нового покорения вавилонянами Месопотамии, захвата Сирии и Палестины.
Навуходоносор II, сын Набопаласара, вступил на трон в 605 году до н. э. Он продолжил политику своего предшественника, подчинив себе Северную Аравию. Однако на этот раз против Вавилона восстала Иудея. Подавив мятеж, Навуходоносор II в 597 году до н. э. осадил и взял Иерусалим, перебив часть его населения и захватив с собой в качестве рабов около 3 тысяч иудеев. Спустя восемь лет, после очередного восстания, царь снова завоевал Иерусалим, после чего вообще ликвидировал Иудейское царство, расселив его жителей по всей Месопотамии.
Собственно, период правления Навуходоносора II для Вавилона стал периодом настоящего возрождения и расцвета — как экономического, так и культурного. Библейский город снова обрел статус крупнейшего населенного пункта на Древнем Востоке, а его население увеличилось до 200 тысяч человек. Эсагила (квадратное здание со сторонами длиной 400 метров) и семиэтажный зиккурат — 91-метровая ступенчатая пирамида Этеменанки («Храм краеугольного камня небес и земли») снова действовали. Библейская «Вавилонская башня» была одним из семи чудес света, на ее вершине располагалось святилище Мардука. Кроме того, при Навуходоносоре в столице появилось еще одно чудо света: грандиозные «висячие сады», выстроенные царем для своей жены-мидянки Амитиды, скучавшей по привычным пейзажам. Новый правитель превратил Вавилон в мощную и почти неприступную крепость. Город был обнесен двойной 14-метровой стеной и окружен глубоким рвом с водой.
После смерти Навуходоносора начался период долгой междоусобной борьбы; в результате на трон вступил Набонид (556–539 годы до н. э.). Он являлся членом семьи арамейского вождя и вызвал серьезное недовольство местного жречества тем, что попытался сделать верховным божеством державы Сина. В итоге правитель вынужден был убраться подальше от мстительных служителей культа. Он перенес свою резиденцию в Тейму, а в Вавилоне предоставил править своему сыну, Бел-шар-уцуру, больше известному под библейским именем Валтасар.