28-30 нюня дальние бомбардировщики бросили на переправы через Березину. На эти цели направили пять дивизий. летавших не только на ДБ-3. но и на ТБ-3. Вместо массированного удара с четко организованным взаимодействием, подавлением зенитных средств получился вариант «кто в лес. кто по дрова». Самолеты выходили на цели небольшими группами и даже поодиночке, без истребительного прикрытия, удары различных полков не согласовывались по времени. Каждый действовал «сам по себе». Немецким истребителям и зенитчикам было куда удобнее последовательно отражать такие атаки. Много бомбардировщиков сбили у переправ. Из-за повреждений самолеты не смогли дотянуть до своих аэродромов. Героический подвиг совершил экипаж лейтенанта Н. Булыгина. На горящем бомбардировщике он таранил переправу у Борисова.
Для возмещения потерь подтягивали полки из-за Урала. С Дальнего Востока перебросили 22-й дбап. из Забайкальского округа – 4-й (в общей сложности 87 ДБ-3). Но этого явно не хватало.
3 июля директива Ставки ВГК предписала изменить способы применения дальних бомбардировщиков, перейдя на ночные действия и бомбометание с больших высот. Но до начала августа дневные вылеты преобладали (более 70%). В итоге к концу июля на западном направлении осталось всего 75 исправных ДБ-3 – чуть больше одного полнокровного довоенного папка. В таких условиях громоздкая корпусная структура стала не нужна, и корпуса ликвидировали.
Дивизии дальних бомбардировщиков в этот период фактически дополняли фронтовую авиацию, работая в лучшем случае по ближним тылам противника. Бомбили железнодорожные узлы и эшелоны на перегонах, колонны автомашин и танков на дорогах, штабы и аэродромы.
Например. 2 июля, помогая войскам Южного фронта, дальние бомбардировщики обрушились на немецкие и румынские войска, скопившиеся у переправ через Прут. 49 ДБ-3 действовали под прикрытием 18 МнГ-3 и 18 И -153. Несмотря на противодействие вражеской авиации и зенитчиков, противнику удалось нанести значительные потери в танках, артиллерии и живой силе. Всего за лето и осень 1941 г. дальнебомбардировочная авиация уничтожила 2023 танка, 5166автомашин (и еше 587 бензовозов – их учитывали отдельно).
Аэродромы- в основном бомбили ночью. мелкими группами, используя комбинацию фугасных, осколочных и зажигательных бомб. 51 – я дивизия в ходе налетов на Орел в октябре сожгла и повредила не менее 100-150 самолетов. Всего за первые шесть месяцев войны на аэродромах уничтожили около 700 немецких самолетов.
Единственным исключением стали рейды на Берлин, предпринятые в августе 1941 г. Начала их морская авиация, но с 11 августа к ним подключились отдельные экипажи 1-го бак. Эти налеты имели более политическое, нежели военное значение.
ДБ-3 использовались и как дальние разведчики. Поскольку они были более уязвимы, чем более быстроходные Пе-2. то летали в основном по ночам. В частности. эскадрилью ночных разведчиков, оснащенную самолетами Ильюшина, включал 2-й драп ВГК.
Бомбардировщики порой вынужденно использовались и как транспортные самолеты. Так. в середине октября они сбрасывали боеприпасы, продовольствие и медикаменты частям Красной Армии. окруженным пол Вязьмой. ДБ-3 могли нести грузовые мешки ГЩММ и баки ГЩББ на наружных бомбодержателях. Все это могло быть сброшено с парашютами. При возможности сесть в месте назначения груз также укладывали на временном деревянном помосте в бомбоотсеке. Бомбардировщик мог также взять до семи пассажиров.
Всю осень 1941 г. ДБ-3 и ДБ-3Ф активно применялись на фронте, но во все уменьшающемся количестве. Прибытие подкреплений из тыловых округов и поставка самолетов промышленностью не возмещали потерь. Тем не менее общий парк бомбардировщиков Ильюшина оставался внушительным. На 22 сентября в ВВС РККА числились 1135 ДБ-3. Их постепенно подтягивали к фронту. В октябре в состав действующих влилась мощная 26-я дивизия (258 самолетов). Ее разбили на две – 26-ю и 133-ю. С 12 октября они начали совершать боевые вылеты из-под Ярославля и Рыбинска. Еще в августе на фронт бросили группу из 2-й школы штурманов, действовавшую до начала ноября. Кроме того, из школ, с курсов усовершенствования, из НИИ ВВС. НИ ПАВ и резервной авнабригады изъяли 156 ДБ-3 для пополнения частей.
Дтя повышения боевой живучести машины решили прикрыть броней стрелка-радиста. Над этим работали параллельно ОКБ-39 и конструкторы завода № 18. В итоге первые спроектировали оригинальную бронеспинку, а вторые – приспособили спинки пилотских кресел от СБ и ДБ-3Ф. С октября их начали ставить на самолеты на заводах № 126 (вариант ОКБ-39) и № 18 (свои). Но, к сожалению, в связи с эвакуацией заводов и отсутствием запаса спинок эту работу довольно быстро свернули.