Этот вариант самолета явился результатом исследований, проводившихся в Хэтфилде еще в июле 1941 года, когда изучались возможности установки четырех пушек на бомбардировщике «Москито» или подвески бомб у «Москито»-истребителя. Конструкторы «Де Хевилленд» пришли к выводу, что если бы можно было уменьшить длину стандартной 227-кг бомбы с помощью применения телескопического оперения, то две такие бомбы можно было бы уложить за пушками на «Москито» II (вмеето топливных баков). В это же время разработка двигателя «Мерлин» 25 с увеличенной мощностью позволяла поднять вес машины. Было сконструировано модифицированное крыло (известное позднее как базовое), у которого была предусмотрена возможность подвески двух баков по 227 л, стыкуемых по поверхности крыла, или двух 113-кг бомб. Дальнейшие исследования показали, что 227-кг бомба сохраняет удовлетворительные баллистические качества и с укороченным хвостовым оперением, так что удалось избежать применения телескопического оперения. При двух таких бомбах в фюзеляже еще сохранялось место для топливного бака на 227 л. Оказалось также возможным несение двух 227-кг бомб под крылом.
Прототип нового истребителя- бомбардировщика был получен в Хэтфилде переделкой бомбардировщика «Москито» B.Mk.IV. Первый полет был проведен 1 июня 1942 года. Появились шансы выпуска этой новой модификации, названной FB.Mk.VI, в больших количествах. Поставки начались в феврале 1943 года. Первые 113 самолетов (построенных в Хэтфилде и включавшие прототип) составили серию I с моторами «Мерлин» 21 или «Мерлин» 25 и подвеской 1130 кг бомб в фюзеляже и под крыльями. Дальнейшее производство пришлось на FB.Mk.VI серии 2. Их было построено 2192, частично в Хэтфилде, а частично на новом заводе «Стандард Моторс» в Коули; 50 самолетов выпустила фирма «Эйрспид» в Портсмуте. Они могли нести четыре 227-кг бомбы или две бомбы и восемь ракет по 27 кг или два бака по 227 кг на крыле. FB..Mk.VI серии 2 был оснащен двигателями «Мерлин» 25, развивавшими 1620 л.с. на взлете и 1500 л.с. на высоте 2900 м при применении давления наддува 1,2 атм для того, чтобы достигнуть наивысших характеристик на малых и средних высотах. Предлагался вариант истребителя-бомбардировщика FB.Mk.XI с моторами «Мерлин» 61 (с двухступенчатым наддувом), но его разработка была прекращена.
«Москито» FB.Mk.VI сначала попали в эскадрильи, совершавшие рейды на Мк.II – 418-ю в Форде и 23-ю на Мальте в мае 1943 года, а затем, в июле, этими машинами вооружили 605-ю эскадрилью в Кастль-Кэмпсе. По мере нарастания поставок стало возможным выделить истребители эскадрильям недавно сформированных 2-х тактических ВВС. Так, 464-я (австралийская) и 487-я (новозеландская) эскадрильи начали перевооружаться с «Вентур» в августе 1943 года; месяцем позже к ним присоединилась 21-я, образовав крыло Скалтхорпа. Первый боевой вылет был проведен 3 октября 1943 года. После этого «Москито» стал играть еще более важную роль в ударах по тактическим целям в Европе как днем, так и ночью.
К концу 1943 года было проведено много налетов на пусковые установки ракет V-1 в северной Франции. Второе крыло из трех эскадрилий (107-й, 305-й и 613-й) действовало на «Москито» FB.Mk.VI с начала 1944 года. 18 февраля шесть «Москито» из всех трех эскадрилий провели классическую атаку с малой высоты на тюрьму в Амьене. Рухнувшие стены позволили бежать заключенным, некоторым из которых угрожала казнь, причем риск гибели или ранения людей был минимальным. Рейд, проведенный под руководством командира группы П.Пикарда, дал возможность бежать 258 участникам французского Сопротивления. Он стал примером точной атаки с малой высоты на точечную цель, вполне возможной для «Москито». Эта возможность была еще раз продемострирована, когда «Москито» FB.Mk.VI из 613-й эскадрильи уничтожили архивы гестапо, касавшиеся групп голландского Сопротивления, при налете на Гаагу в апреле 1944 года. Эту операцию повторила в марте 1945 года эскадрилья, уничтожившая аналогичный архив в Копенгагене.
Шесть эскадрилий «Москито» FB. Mk.VI из 2-х тактических ВВС были включены в Союзные экспедиционные ВВС, предназначенные для «дня D» в июне 1944 года. Они сыграли жизненно важную роль и в начальных стадиях вторжения и в дальнейший период. За два месяца после «дня D» они совершили 2000 вылетов, хотя и потеряли 26 самолетов.