Согласно опубликованным документам, за неделю пребывание на борту станции «Салют-6» (там в это время работал постоянный экипаж в составе В. Коваленка и В. Савиных) экипаж «Союза-39» провел серию медицинских экспериментов, в т.ч. медицинские обследования, направленные на изучение особенностей адаптации органов человеческого организма к условиям невесомости, а также геофизические исследования оптических характеристик атмосферы с целью выявления погрешностей и атмосферных искажений в фотоизображениях.
Также экипаж «Союза-39» провел ряд экспериментов по космическому материаловедению и фотографирование северо-западных и центральных районов МНР из космоса (официально «с целью изучения геологических объектов и состояния пастбищ»).
После возвращения с орбиты карьера Героя МНР Ж. Гуррагчи сложилась вполне удачно. С 1983 г. он был председателем центрального совета ОСО МНР (уже в 1984 г. ему присвоили звание генерал-майора МНА), в 1992-1996 гг. он был председателем Союза Монгольских Обществ Дружбы, в 1996-1997 гг. стал заместителем командующего ПВО Монголии, в 1997-2000 гг. - начальником штаба ПВО Монголии, а в 2000- 2004 гг. - министром обороны Монголии. Сейчас Ж. Гуррагча на пенсии, является почетным председателем национальной федерации хоккея с мячом.
Жизнь не стоит на месте, и в конце 1980-х гг. началась нормализация отношений между СССР и КНР. Одновременно, поскольку лидеры СССР сочли что эпоха «холодной войны» и военного противостояния с Западом окончательно осталась в прошлом (увы, но М.С. Горбачев жестоко ошибся, явно переоценив степень миролюбия своих заокеанских «партнеров»), начались значительные сокращения вооруженных сил СССР и вывод советских войск из-за рубежа.
Монголия не стала исключением в этом процессе. Уже в 1989 г. был расформирован в рамках сокращения 104-й ИАП, а в 1990 г. - 126-й ИАП, базировавшиеся на территории МНР. А в мае 1989 г. начался процесс полного вывода с территории МНР частей 39-й ОА (или как ее еще принято именовать, «Группы Советских Войск в Монголии»): всего 1816 танков, 2531 бронемашина, 1461 артсистема, 190 самолетов, 130 вертолетов. Полностью вывод войск завершился в декабре 1992 г.
После распада СССР монголы, которые, к тому времени привычно осудили все «перегибы и преступления» своих руководителей и убрали из государственной символики термины «народный» и «социалистический», остались один на один с окружающей реальностью, которая оказалась не слишком оптимистичной.
Например, очень быстро выяснилось, что для небольшой, промышленно неразвитой и сильно зависимой от экономической помощи СССР страны, содержание армии является непосильным финансовым бременем. До этого армия МНР никогда не испытывала проблем с ремонтом и техобслуживанием боевой техники и поставками запчастей, боеприпасов и ГСМ, поскольку все это МНА на протяжении почти пятидесяти лет получала из СССР в рамках двухсторонних соглашений практически бесплатно. А к 1992 г., в эпоху «торжества рыночных отношений» выяснилось, что даже банальный авиационный керосин стоит денег, и немалых.
Именно поэтому уже в середине 1990-х гг. начался процесс «оптимизации» монгольских вооруженных сил. Так, из 370 танков Т-54/55, 50 Т-72, 310 БМП-1, 210 БТР-60/70/80 и 120 БРДМ-2 абсолютное большинство еще с 1990-х гг. числится «на хранении». Изрядная часть этой техники была передана монголам во время вывода 39-й ОА в качестве компенсации за пребывание на территории МНР советских войск (в противном случае технику надо было вывозить в Россию и там утилизировать, а это было невыгодно). При этом, поскольку у монголов не было и нет возможности ремонтировать боевую технику самостоятельно, к началу XXI века более половины этой техники пришло в негодность и была частично либо списана, либо разобрана на запчасти. Фактически, наиболее многочисленным образцом БТТ монгольской армии сейчас является БРДМ-2, а более тяжелую боевую технику, в количестве не более нескольких десятков единиц, ВС Монголии достают с баз хранения только для участия в военных парадах или учениях, но и то и другое для монголов нечастое явление. Аналогичная ситуация сложилась и с артиллерией монгольской армии.
Положение со средствами ПВО в Монголии сложилось куда более тяжелое. До начала 1990-х гг. функции ПВО МНР фактически осуществляли совет- I ские войска, но при их выводе все средства ПВО и РЛС были либо вывезены на территорию РФ, либо утилизированы прямо на месте, после чего монголы остались без какой-либо вменяемой системы ПВО - действующие радары сохранились только в нескольких крупных городах с соответствующими аэродромами, но даже там уже в 1990-е гг. возникли проблемы с поддержанием работоспособности РЛС на должном уровне.