В шестнадцатом пункте резолюции говорилось, что постановления конгрессов Коминтерна и ИККИ обязательны для всех партий, входящих в Интернационал. «Устав закреплял за ИККИ право <…> следить за созданием нелегальных коммунистических организаций, а также право создавать в различных странах целиком подчиненные ему технические и иные вспомогательные бюро».
Со второй половины 1920 года ИККИ стал одним из центров по подготовке военно-политических кадров для участия в будущих революциях и специальных операциях. Именно в тот период при Коминтерне была создана первая секретная военно-политическая школа.
В апреле 1920 года в составе Особого отдела, руководство которым осуществлял лично Ф.Э. Дзержинский, создается Иностранное отделение. Его первым руководителем назначен Л.Ф. Скуйскумбре. Аналогичные отделения появляются в особых отделах фронтов и некоторых приграничных губернских ЧК. Их задачей была разведывательная работа на территории сопредельных с РСФСР государств. Двадцатого декабря 1920 года Иностранное отделение было реорганизовано в самостоятельный Иностранный отдел (ИНО), курировавшийся начальником Особого отдела В.Р. Менжинским, что стало датой рождения современной отечественной политической разведки ВЧК. До марта 1922 года Иностранный отдел поочередно возглавляли Я.Х. Давтян (Давыдов), Р.П. Катанян и С.Г. Могилевский. ИНО официально утверждался в качестве партнера Коминтерна в области нелегальной работы за рубежом. Постепенно Иностранный отдел ВЧК становится одной из ведущих структур, обеспечивавших высшее военно-политическое руководство страны разведывательной информацией.
Восьмого августа 1920 года Малое бюро Коминтерна приняло решение создать вместо Особой комиссии по связи ИККИ Секретный отдел; организацию отдела поручили Д.С. Бейко.
Главной задачей Секретного отдела являлось обеспечение конспиративных связей между штаб-квартирой Коминтерна и иностранными компартиями. Отдел осуществлял: переправку секретной корреспонденции (документов, директив и т. п.); нелегальную доставку денег и ценностей; конспиративную переброску партийных функционеров и оружия из страны в страну и другие нелегальные функции.
В большинство европейских стран, а также в Китай (Шанхай), Мексику и Ташкент (для работы в странах Востока) были направлены нелегальные представители ИККИ. Решением Малого бюро от 11 ноября отдел получил название Конспиративный.
В начале января 1921 года была создана секретная лаборатория по изготовлению фальшивых иностранных паспортов, виз и других оперативных документов, находившаяся в подчинении Конспиративного отдела.
Поражение в Польско-советской войне 1919–1921 годов и проведенный анализ событий заставили руководство РКП(б) принять специальное постановление о работе разведки. В нем говорилось: «Слабейшим местом нашего военного аппарата является, безусловно, постановка агентурной работы, что особенно ясно обнаружилось во время польской кампании. Мы шли на Варшаву вслепую и потерпели катастрофу. Учитывая ту сложившуюся международную обстановку, в которой мы находимся, необходимо поставить вопрос о нашей разведке на надлежащую высоту. Только серьезная, правильно поставленная разведка спасет нас от случайных ходов».
В марте 1921 года В. И. Ленин поручил Осипу (Иосифу) Ароновичу Пятницкому (Таршису) наладить работу большого аппарата Исполкома Коминтерна. Необходимо было установить контакты с зарубежными коммунистическими партиями и марксистскими организациями, а также решить целый ряд связанных с ними финансовых, кадровых и множества секретных вопросов. Для решения этих задач создается Отдел международных связей (ОМС), а официально утверждает эту структуру в июле 1921 года III конгресс Коминтерна. С созданием ОМС Конспиративный отдел слился с ним.
Про Пятницкого можно сказать, что он уже в шестнадцать лет увлекся революционным движением, а его первые задания были связаны с перевозкой нелегальной литературы, издаваемой в Швейцарии. После Октябрьской революции он стал председателем ЦК профсоюза железнодорожников, а в 1920 году возглавил Московский комитет РКП(б). Работа Коминтерна и его зарубежного аппарата была крайне эффективной. Пятницкого знали все лидеры международного коммунистического движения, но большая часть его политической деятельности покрыта завесой непроницаемой тайны, и даже сегодня об этой стороне его деятельности известно крайне мало.