Поставленная перед собравшимися задача о подготовке к открытию Йенского университета первоначально была воспринята не всеми. Президента земли беспокоило то, что часть зданий университета была разрушена, и для их восстановления потребуется много времени. Его некоторые лаборатории были разграблены или полностью вывезены американцами вместе с группой видных профессоров, главным образом физиков и химиков. В. Вольфа и Г. Шнайдера особенно беспокоило то, что среди оставшихся профессоров значительная часть состояла в нацистской партии. Представитель университета к этому добавил, что обучавшиеся в нем студенты почти поголовно являлись членами либо нацистской партии, либо союза гитлеровской молодежи, или же примыкали к одной из многочисленных фашистских организаций. Были и такие, которые служили в вермахте и воевали против Советского Союза.
Одним словом, положение не из утешительных. И все же университет нужно было готовить к открытию. И когда мною был назван срок готовности — октябрь 1945 года, — то даже президент земли доктор Р. Пауль, который всегда соглашался с любыми предложениями, категорически заявил, что названный срок нереален. Помня предложение В. П. Золотухина о том, что нужно назначить президента земли политическим ректором университета, я сказал Паулю, что если он затянет открытие учебного заведения, то потеряет доверие университетской общественности, которая ждет не дождется возрождения вуза.
Мой заместитель по экономическим вопросам А. И. Козлов заверил представителя университета, что наряды на материалы и рабочую силу для скорейшего восстановления разрушенных зданий уже заготовлены и их немедленно можно получить в управлении земли.
В. Вольфу и Г. Шнайдеру пришлось разъяснить, что из Москвы профессора не прибудут и надо отобрать лучших из тех, которые есть в Йене, других землях и провинциях, и готовиться к учебному процессу. Можно пригласить прогрессивных профессоров даже из западных оккупационных зон. Первоочередной же задачей являлось создание мандатных комиссий по отбору студентов и профессоров. В эти комиссии следовало включить представителей магистрата города Йена.
Директору центрального немецкого управления народного образования, президентам провинций и земель, бургомистрам городов на территории советской оккупационной зоны вменялось в обязанность провести подготовку высших учебных заведений к возобновлению занятий и при этом полностью устранить нацистские и милитаристские доктрины в обучении и воспитании студентов и обеспечить подготовку таких кадров, которые были бы способны на практике проводить демократические принципы. Не позже 25 сентября нужно было в отдел народного образования СВАГ представить списки высших учебных заведений с указанием их состояния и наличия при них научно-исследовательских институтов, а также списки личного состава профессоров и преподавателей и научных сотрудников.
Что же представлял собой Йенский университет?
Он был открыт в 1558 году на основе существовавшей академической гимназии. В 1739 году в нем работал профессором Фридрих Шиллер. В его стенах учились и работали известные философы Гегель, Фихте, Шеллинг и другие. Там же начинали свою деятельность философы-материалисты Фейербах и Тибо. При непосредственном участии великого поэта Гёте был создан каталог университетской научной библиотеки. Во второй половине XIX столетия в университете протекала неутомимая деятельность известного дарвиниста Эрнста Геккеля. А в 1841 году творец научного коммунизма Карл Маркс именно в этом университете защитил докторскую диссертацию.
В годы господства фашизма университет утратил свою былую научную славу. Была на нет сведена свобода научного творчества, упразднен принцип самоуправления, ликвидирован Большой сенат, а Малый сенат заполнен нацистами и превращен в послушное орудие нациста-ректора, который, как и деканы факультетов, уже не избирался тайным голосованием членов сената, а назначался властями. Профессора «неарийского» происхождения и подозреваемые в нелояльности к нацизму, независимо от их научной квалификации и педагогического опыта, беспощадно изгонялись.
Подлинная наука в стенах университета заменялась нацистским мракобесием. Для внедрения и распространения нацистских и милитаристских идей были учреждены новые кафедры, семинары, институты, в частности, институты рас и права, наследственной и расовой политики, семинары теории о народах пограничных стран, северной культуры. Учебные программы были заполнены темами нацистского и милитаристского содержания, к примеру, «Немецкий народ и его жизненное пространство», «Моральный взгляд на войну», «Военная история и военная философия».
Стипендия и другие льготы предоставлялись преимущественно активным участникам войны. Рабочих и крестьян среди студентов в 1944 году насчитывалось всего 5 процентов.