В сентябре над немецкими позициями довольно редко можно было видеть самолеты. Генерал-майор Фибиг командовал оставшимися бомбардировочными и истребительными подразделениями на южном участке фронта группы армий «Центр». На центральном и северном участках фронта группы армий «Центр» авиации почти не было. Здесь лишь временами появлялись эскадрильи и отдельные самолеты эскадры пикирующих бомбардировщиков ПЭ 2 (оберст-лейтенант Хаген), ИЭ 51 (генерал-майор Бекх) и БЭ 53 (оберст-лейтенант Вайткус).
Больших успехов добился обер-лейтенант Берст, который, к примеру, 6 сентября в районе Смоленска уничтожил мост через Днепр. Тем самым он сорвал прорыв сильной русской группировки из Смоленского котла, за что был награжден Рыцарским крестом. Позднее Берст, один из самых успешных летчиков пикирующих бомбардировщиков люфтваффе, стал обладателем Рыцарского креста с мечами и дубовыми листьями.
Подготовка к операции «Тайфун» (наступление на Москву), завершение сражения в районе Киева и отказ от взятия Ленинграда в конце концов снова привели ранее отправленные на юг и на север подразделения 2-го воздушного флота на центральный участок Восточного фронта.
В конце сентября с ленинградского участка фронта вернулся весь VIII авиакорпус (генерал-лейтенант барон фон Рихтгофен). Ранее располагавшиеся в районе Киева эскадры ПЭ 1 (оберст-лейтенант Динорт), ПЭ 77 (оберст-лейтенант граф Шенборн-Визентайд) и ИБ 26 (оберст Шальк) снова заняли аэродром в районе действия группы армий «Центр».
С их помощью 2-й воздушный флот мог поддержать массированными налетами наступление группы армий «Центр» на Москву. Еще до начала собственно операции «Тайфун» ночью 1 октября самолеты «Легиона Кондор» атаковали военные сооружения в районе Москвы. Атаки повторялись и в следующие ночи, несмотря на усиленную противовоздушную оборону. В течение дня воздушные атаки из-за сильной зенитной обороны были невозможны.
С распространением таких атак, причем оба авиакорпуса добились очевидных успехов в сражениях над Брянском и Вязьмой, аэродромы перемещались на восток. Так, пикирующие бомбардировщики ПЭ 1 и ПЭ 77 вместе со 2-й танковой армией приняли участие в первых больших сражениях нового наступления. ПЭ 2 под руководством VIII авиакорпуса поддерживала 3-ю танковую армию в районе Вязьмы и при наступлении в направлении Калинина. В этих эскадрах, командование которыми в начале октября принял майор Хоццель, один из первых пилотов пикирующих бомбардировщиков люфтваффе, особенно отличились гауптман Купфер и оберлейтенанты Фрейтаг и Ланг.
Генерал-лейтенант барон фон Рихтгофен по мере развития наступления перевел свой командный пункт из Смоленска в Липецк, а оттуда в Емельяново – в 125 км западнее Москвы. Показателен рассказ о состоянии дел в штабе, когда установилась плохая погода:
«Теперь погода становится все хуже, в основном преобладает легкий мороз. Улицы и дороги развезло, их разбили гусеничные машины и тяжелые грузовики. Ситуация с подвозом снабжения критическая. Телефонный кабель дальней связи к фронту доставлялся воздушным транспортом. Ситуация на всем участке от Ржева до Калинина внушает опасения, поскольку на улицах появляется не только советская пехота, но даже танки и артиллерия».
В точности такие же трудности существовали и на южном участке фронта, где размещался II авиакорпус под командованием генерала Лерцера. Штаб располагался в Шаталовке. Связь с летными полями, где были размещены эскадрильи, поддерживалась 32-м авиаполком связи, к которому позже присоединился 12-й авиаполк связи (оберет-лейтенант Эмихен). Но уже в ноябре 12-й полк был отправлен на Балканы.
Генерал Лерцер расположил свой штаб в пригороде Калуги, а генерал-майор Фибиг следовал за своей штурмовой авиацией, которая преимущественно летела перед 2-й танковой армией.
Вскоре установившаяся плохая погода сделала вылеты безуспешными и опасными, снабжение самолетов горючим и боеприпасами застопорилось. Это дало повод генералу Лерцеру сделать представление непосредственно рейхсмаршалу Герингу, который поручил шефу воздушных связистов генералу Мартини лично проследить, чтобы все было как надо.
Шеф воздушных связистов, находясь в Орле, убедился в том, что транспортная ситуация сложилась тяжелая, и той же ночью приказал использовать больше транспортных самолетов Ju-52, которые были переведены из Норвегии и выполнили только первые снабженческие рейсы к застрявшим самолетам воздушного флота. Позже они снабжали остановившиеся дивизии группы армий недостающими продуктами, горючим, боеприпасами и другими грузами.