Именно с желанием Иоахима Флорского свободно излагать в сочинениях пророческие и богословские откровения, которые, по его убеждению, даровались ему Св. Духом, связано его посещение папской курии в 1184 г. Иоахим Флорский отправился к папе Луцию III (1181–1185), находившемуся в то время в г. Вероли, желая получить «дозволение писать о том, что он видел посредством откровения». Причиной этого может быть то, что в соответствии с уставом цистерцианского ордена никакой аббат, монах или послушник не мог ничего писать, если не получил на это дозволения генерального капитула ордена. То, что Иоахим обратился за таким дозволением не к генеральному капитулу, а к папе, объясняется тем, что в это время возглавляемый им монастырь Кораццо формально еще не был принят в цистерцианский орден, но при этом сам Иоахим Флорский стремился следовать цистерцианскому уставу. Существует предположение, что Иоахим Флорский хотел т. о. защититься от возможных обвинений в ереси, тем более вероятных, что в этот период он рассматривал в сочинениях учение о Троице и критически отзывался о ряде тринитарных концепций современных ему богословов.
Согласно Житию, в папской курии Иоахим Флорский произнес пророчество, касавшееся взятия Иерусалима сарацинами. Известно, что по просьбе папы Луция Иоахим Флорский предпринял толкование пророчества, найденного в бумагах скончавшегося незадолго до этого кард. Матфея из Анже; толкование сохранилось в виде трактата «De prophetia ignota» (О неизвестном пророчестве). Папа Луций удовлетворил просьбу и дозволил ему писать сочинения; подтверждением этого служит письмо папы Климента III (1187–1191), где говорится, что Иоахим Флорский начал писать «Толкование на Апокалипсис» и «Книгу согласования Ветхого и Нового Заветов» «по приказу и побуждению блаженной памяти папы Луция».
В 1185 г. святой вернулся в Калабрию; в следующем году он предпринял поездку в Верону, где встретился с новым папой Урбаном III, подтвердившим дозволение на литературную деятельность. После возращения в Кораццо Иоахим Флорский продолжил работу над сочинениями. По-видимому, тяготясь немалыми административными заботами, он большую часть времени проводил не в Кораццо, а в Пьетралата, уединенном месте на горном плато Ла-Сила. Здесь он жил с несколькими монахами (в число которых входили Лука (впоследствии архиепископ), бывший его секретарем, и Райнер Понцский), занимаясь богомыслием и молитвой, а также диктуя сочинения. По-видимому, именно здесь он завершил трактат «Десятиструнная псалтирь» и создал трактат о жизни и учении преподобного Венедикта Нурсийского. К этому времени Иоахим Флорский уже не считал цистерцианский монашеский путь идеальным и задумал создать собственный монашеский устав, более строгий, чем цистерцианский.
В 1188 г. в Риме Иоахим Флорский встретился с папой Климентом III; папа одобрил включение монастыря Кораццо в цистерцианский орден; подтвердил особой буллой данное его предшественниками Иоахиму Флорскому право писать богословские и экзегетические сочинения; освободил Иоахима Флорского от обязанностей аббата, чтобы тот мог целиком посвятить себя духовной жизни и литературной деятельности.
По возвращении из Рима Иоахим Флорский некоторое время жил в Пьетралате, однако вскоре стал искать на том же горном плато более подходящее для уединенной жизни место. Во время странствия по горам Иоахим Флорский со спутниками остановился на месте впадения р. Флос в р. Альбус (ныне р. Арво), которое располагалось между высокими горами. Здесь и было решено основать будущий Флорский монастырь. Поскольку высокогорная местность, избранная для монастыря, отличалась холодным климатом с сильными ветрами, Иоахим Флорский вернулся в Пьетралату и окончательно переселился на место будущего монастыря позднее, когда там было построено несколько хижин, приспособленных для жизни монахов.