Вскоре я попросил Сергея Антоновича освободить меня от должности проректора и разрешить вернуться на должность заведующего кафедрой «Электротехнология и электротехника» с возможностью продолжения работы в качестве директора ООО «НПЦ магнитной гидродинамики». Ректор удовлетворил мою просьбу. В 1996 году кафедра получила лицензию на подготовку специалистов по специальности «Электротехнологические установки и системы» и сделала первый набор студентов. Возросла эффективность работы аспирантуры и докторантуры, увеличились объемы госбюджетных и хоздоговорных работ на кафедре и предприятии.
Сергей Антонович всегда отмечал наши успехи в выступлениях, докладах и отчетах, а взаимодействие кафедры и ООО «НПЦ магнитной гидродинамики» приводил как пример успешной интеграции образования, науки и производства.
На конференции трудового коллектива КГТУ в марте 2006 года Сергей Антонович выступил с докладом «Основные положения отчета ректора С. А. Подлесного за 2001–2005 годы» (газета КГТУ «Политехник на Енисее» № 3–5 (1131–1133), март 2006 года), в котором изложил свое видение системы управления университетом. По его мнению, основой системы является обязательная разработка долгосрочной стратегии, адаптированной к внешней среде с помощью заранее запланированных действий и их актуализации при изменении условий. В качестве инструмента планирования Сергей Антонович называет Комплексную программу развития, разработанную и реализованную в 2001–2005 годах, с принятием ежегодного плана приоритетных работ. Такие планы С. А. Подлесный требовал от всех структурных подразделений университета с указанием мероприятий, сроков исполнения и ответственных.
Перед тем как огласить результаты работы коллектива за отчетный период, Сергей Антонович подчеркнул следующее: «Отчет ректора необходимо рассматривать в органичной связи его личного труда с результатами работы всего коллектива, так как основная составляющая труда ректора — управленческая, реализация которой позволяет достигать поставленные цели». Далее в докладе перечислены успехи вуза в 18 направлениях деятельности. По каждому направлению отмечаются конкретные достигнутые результаты, названия структурных подразделений, кафедр, имена руководителей и выдающихся исполнителей.
Сергей Антонович имел ученую степень кандидата технических наук и ученое звание профессора. Иногда приходилось слышать недовольство, что ректор КГТУ не доктор наук. К тому времени в КГТУ были созданы и успешно работали несколько диссертационных советов, в том числе по радиотехническому профилю. Под руководством С. А. Подлесного были выполнены десятки НИР по заказам Минобразования РФ и администрации Красноярского края, осуществлен большой научный задел по разработке устройств приема и обработки сигналов различных радиотехнических систем. Думаю, что при желании ректору не составило бы большого труда выполнить работу по оформлению и защите докторской диссертации по радиотехническому профилю. Также предлагали открыть диссертационный совет по специальности «Высшая школа». У Сергея Антоновича Подлесного было опубликовано много научных трудов по вопросам повышения качества подготовки специалистов на базе глубокой интеграции учебного процесса, науки и производства.
Насколько мне известно, ректор не предпринимал каких-то действий для защиты докторской диссертации, у него просто не было для этого времени, поскольку он считал управленческую функцию основной составляющей труда ректора, направленной на достижение поставленных целей всего коллектива вуза.
Поздно вечером в канун Нового 2007 года мне позвонил Сергей Антонович и предложил возглавить Политехнический институт, поскольку ему предложили занять должность проректора по учебной работе вновь созданного Сибирского федерального университета (СФУ). Для меня это было неожиданное предложение, я попросил время подумать, и мы договорились встретиться утром на следующий день. При встрече Сергей Антонович сообщил, что вопрос образования СФУ на базе четырех красноярских вузов решен.
Начался этап реорганизации старых вузов, вошедших в состав СФУ, и создания на их основе новых институтов в качестве структурных подразделений.