Несмотря на неудачу в Азии, Априй имел полный успех во внутреннем управлении государством, и Египет процветал так, как это было лишь при его великом деде, основателе Нового царства. Он получал доходы с запада, из области оазисов, и в северном оазисе его чиновник Уахибранофер построил храм. Но трагический конец, откуда нельзя было его ожидать, подстерегал царя посреди его богатств и великолепия. Ему было чрезвычайно трудно сдерживать свои многонациональные войска. Однажды ливийцы, греки и сирийцы сделали попытку дезертировать и переселиться в Нубию, подобно тому как это сделал один отряд в дни Псамметиха I. Невозможно определить, сколько воинов принимало участие в возмущении против Априя. Но их было достаточно много, чтобы возбудить сильное беспокойство царя, и отчет о событии ясно говорит, что «его величество испугался». Когда дезертиры приблизились к первым порогам, губернатору Асуана Несухору, хитрому чиновнику, удалось отговорить их и вернуть к царю, который затем их наказал. Другой случай недовольства среди туземного военного класса окончился не столь удачно. Новое греческое поселение в Кирене развилось в цветущее государство и начало угрожать Ливии, расположенной между Киреной и Египтом. Априй счел благоразумным помешать развитию греческой колонии и послал на помощь ливийцам отряд египетских войск, среди которых, разумеется, не было ни одного греческого наемника. Презирая своих противников, египтяне беспечно подвигались вперед, но киренские греки разбили их и почти уничтожили. Раздраженные своим поражением египтяне пришли в страшный гнев против Априя и решили, что он послал их против Кирены, чтобы от них избавиться. В результате произошло восстание военного класса, принявшее опасные размеры. Априй поручил Яхмосу, или Амасису, как его называет Геродот, родственнику царского дома, успокоить мятежников и склонить их к подчинению. Амасис был камергером, или маршалом, дворца, и кроме этой должности он еще занимал важное судейское положение. Это был человек необычайно хитрый и проницательный, и его назначение как раз в этот момент могло повести как к спасению, так и к гибели Априя. Амасис так искусно использовал положение, что недовольные солдаты вскоре провозгласили его царем, и гонец, посланный Априем к изменнику с приказанием вернуться, был отослан назад с оскорблениями и поношениями. Разъяренный фараон оказался настолько неразумен, что излил свой гнев на несчастного гонца, у которого, несмотря на то что он занимал высокое положение, немедленно были отрезаны нос и уши. Увидев, что их сотоварищ так несправедливо наказан, многие из вельмож и приверженцев Априя покинули его и приняли сторону Амасиса. Геродот рассказывает, что затем произошла битва, во время которой греческие наемники Априя, потерпев большой урон от войск Амасиса, были разбиты, и Априй попал в плен. Возможно, он смешивает эту битву с позднейшей, которая, как нам известно из документа того времени, произошла между войсками обоих соперников. Как бы то ни было, Амасис, хотя и обошелся с Априем очень мягко и не сверг его с престола, наложил сильную руку на скипетр. Он стал соправителем Априя, игравшего с тех пор, несомненно, лишь незначительную роль. До нас дошел памятник, на котором изображены оба правителя вместе. Наряду с картушем, который принял теперь Амасис, он продолжал носить старые титулы, присвоенные его прежним, менее высоким должностям. Но на третий год совместного правления между Амасисом и Априем возобновилась борьба. По словам Геродота, Априй заручился поддержкой греков и с армией греческих наемников в сопровождении флота двинулся с севера на Саис. Амасис быстро собрал свои силы, напал на Априя и, обратив его армию и его самого в бегство, полностью рассеял врагов. Так как они продолжали в течение нескольких месяцев опустошать север и наводняли дороги, живя, разумеется, грабежом, Амасис отправил против них войско. По-видимому, Априй тем временем бежал. Как бы то ни было, он был убит во время преследования грабительских банд в то время, когда укрывался на одном из уцелевших судов своего флота. Амасис похоронил его, как подобает царю, среди его предков в Саисе и установил в честь него посмертные приношения, обеспечив их щедрыми вкладами.