Преодоление последствий «великого московского разорения» тормозилось рядом факторов. Россия понесла во время Смуты тяжелые людские и территориальные потери. Немалое тормозящее действие оказывали сложные природно-климатические условия и малоплодородные почвы центральных районов страны, где проживала основная масса населения. Крестьянские хозяйства продолжали носить потребительский характер, были маломощными. Они ориентировались на удовлетворение собственных потребностей (для прокорма и еще чуть-чуть для уплаты налогов), поскольку природно-климатические условия и невысокая плодородность почв делали труд крестьянина крайне тяжелым. Но немалое значение также имела крепостническая и налоговая политика государства, не создававшая у земледельца заинтересованность в увеличении производства. Государство часто не учитывало интересов народа, требуя от него все новых и новых жертв. С увеличением своих потребностей в средствах оно часто изымало у производителей не только прибавочный продукт, но и часть необходимого. Наряду с этим, светские феодалы и церковь увеличивали барщину и оброки.
Немалую роль в том, что крестьянское хозяйство имело потребительский характер, играла православно-общинная традиция, которая ориентировала крестьянина на простое удовлетворение потребностей его самого и его семьи. Расширения производства для получения дохода и обогащения крестьянин не хотел потому, что в его сознании была четко утверждена мысль об аморальности богатства, о том, что оно не приносит душевного покоя, поскольку нажито не по совести, а за счет других. Обладание богатством – это лишние хлопоты, волнение, страх перед Богом («кто малым доволен, тот у Бога не забыт»). Поэтому, по мнению крестьянина, труд должен быть умеренным, труд сверх меры – алчность, а не богоугодное дело. И потому в работе надо знать чувство меры, чтобы было время для удовлетворения других, в основном духовных потребностей («у Бога дней впереди много – наработаемся»).
Более быстро поднималось хозяйство в южных районах, где земли были плодородными. Освоение южных районов, Среднего Поволжья, Сибири вело к подъему земледелия и увеличению производства сельскохозяйственной продукции. Подъем экономики России осуществлялся экстенсивным путем. Масса неосвоенных земель позволяла идти этим путем и не задумываться о совершенствовании методов обработки земли. Зачем трудиться над восстановлением пашни, зачем искать корм скоту, чтобы получить органическое удобрение – навоз, когда можно переходить с места на место в поисках более плодородных земель? Поэтому колонизационные потоки на новые земли были свидетельством экстенсивного развития сельского хозяйства, когда в хозяйственный оборот включалось все больше новых земель.
Земледельческие орудия труда носили рутинный характер. Основными орудиями земледельца по-прежнему были соха, деревянная борона, коса, серп, цеп. Плуг применялся редко, и то в хозяйствах крупных феодалов.
Продолжала господствовать трехпольная система земледелия. Неизменными оставались традиционные для предшествующего времени методы обработки земли. Рутинная сельскохозяйственная техника и агротехника в сочетании с малоплодородием почв и сложными климатическими условиями предопределяли низкую урожайность в Нечерноземье, порядка сам-три (на один посеянный пуд зерна собирали три пуда); в черноземных районах урожайность была вдвое выше.
Главными земледельческими культурами оставались рожь, овес, ячмень, пшеница, гречка, просо, горох. Из технических культур выращивались лен и конопля. Животноводство развивалось в основном в крестьянских хозяйствах. Были многолошадные и многокоровные крестьяне, но были и не имевшие скота крестьяне. Активно развивалось в России садоводство (яблони, груши, слива, вишня, малина, крыжовник) и огородничество (огурцы, морковь, свекла, репа, лук, чеснок, редька).
Медленное восстановление сельского хозяйства наносило удар по экономическому положению мелкого и среднего дворянства и их служебной пригодности. Некоторые дворяне не имели крестьян и земли. Многие из-за бедности оставались холопами богатых землевладельцев, слугами монастырей. Крестьянское и помещичье хозяйства носили в основном натуральный характер.