Когда Наполеон собрался нанести решающий удар, введя в бой молодую гвардию, Кутузов вырвал у него инициативу. Во время отражения восьмой атаки Семеновских флешей он направил корпуса М.И. Платова и Ф.П. Уварова для удара по левому флангу французских войск. Выполняя приказ Кутузова, Уваров внезапно атаковал дивизию Орнано у Беззубова, а Платов, выйдя южнее Беззубова, произвел панику в тылу французских войск. Неожиданное появление русской кавалерии в тылу и на левом фланге французской армии заставило Наполеона прекратить атаки в центре и направить для отражения русских войск значительные силы. Так, контрудар Кутузова изменил весь ход сражения. Наполеон выпустил инициативу из своих рук и потерял время, Кутузов же превосходно использовал это время для перегруппировки своих сил.
Между 14 и 16 часами Наполеон провел еще ряд атак против русских войск, но достиг некоторого успеха лишь в центре, заняв батарею Раевского, которую трудно было удержать после потери Семеновских флешей.
После 16 часов обе стороны до наступления темноты вели сильный артиллерийский огонь. Русская артиллерия заставила замолчать французскую, после чего, доносил Кутузов, вся неприятельская пехота и кавалерия отступили. К вечеру активные действия русских войск в центре и на левом фланге принудили Наполеона отвести свои войска за реку Колочу. Русские войска, отбросив французов, снова заняли свои позиции.
Исход сражения определили не те частные временные тактические успехи, которые были достигнуты Наполеоном в ходе боя, а отказ его от продолжения боя и отход на первоначальные позиции. Победителем в Бородинском сражении была русская армия, возглавляемая гениальным полководцем М.И. Кутузовым.
В донесении Александру I Кутузов писал, что русские войска «сражались с неимоверной храбростью… и кончилось тем, что неприятель нигде не выиграл ни на шаг земли с превосходными своими силами». Кутузов сообщал, что «урон неприятельский… должен весьма наш превосходить». Действительно, французская армия потеряла убитыми и ранеными 58 000 человек из 135 000, а русская армия – 38 500 человек из 120 000. Моральный дух наполеоновской армии, впервые потерпевшей столь крупное поражение, был сильно подорван. Очевидцы единодушно отмечают общее уныние, господствовавшее во французской армии после Бородинского сражения. Русская же армия сохранила бодрость духа и волю к продолжению борьбы.
В Бородинском сражении русский народ показал невиданные примеры героизма, стойкости и самоотверженности; его воля и военное искусство победили военное искусство Наполеона.
Наполеоновский план разгрома русской армии в генеральном сражении провалился. Наоборот, стратегический план Кутузова, заключавшийся в том, чтобы измотать противника в оборонительных сражениях с тем, чтобы в дальнейшем перейти в контрнаступление, полностью оправдал себя.
Выдающееся военное искусство Кутузова как полководца сказалось и в выборе и оборудовании позиции для боя, и в группировке сил, и в искусном маневрировании в ходе боя, и в умелом использовании резерва. Кутузов обеспечил прочность обороны, создав глубокий боевой порядок, опорой которого были укрепленные артиллерийские пункты, повышавшие стойкость пехоты.
Артиллерия группировалась для массированного огня. Взаимодействуя с ней, пехота и конница осуществляли успешные контратаки. Кутузов умело наносил врагу в ходе сражения контрудары (например, удар конницы Платова и Уварова). Таким образом, в оборонительное сражение он вложил идею высокой активности.
Активному характеру действий русской армии соответствовал и избранный Кутузовым способ управления. Бородинское сражение уже не являлось единым актом по месту и времени. Армия не могла здесь действовать как один большой батальон, а полководец не мог сразу обозревать все поле боя. Сражение распадалось на ряд отдельных участков. Поэтому Кутузов предоставил командующим армиями широкую инициативу в рамках своего замысла. В то же время он связал все действия войск единой мыслью и волей, предварительно разъяснив свой замысел командующим, и лично руководил их действиями в ходе боя. Ни один из важных моментов боя не обошелся без его решительного вмешательства.
Победа Кутузова на Бородинском поле подорвала наступательную мощь французской армии. Однако немедленный переход в контрнаступление был еще невозможен. На следующий день после Бородинской битвы великий русский полководец писал: «…Намерение мое, хоть баталия и совершенно выиграна …состоит в том, чтобы притянуть к себе столько способов, сколько можно получить из Москвы». После получения резервов Кутузов намеревался дать второе сражение, которое должно было еще больше ослабить французов и позволить начать контрнаступление еще до подхода врага к Москве.