Крестьянской реформой были начаты другие преобразования в империи. В 1863 году была проведена реформа образования, в 1864 – земская и судебная реформы, в 1865 году – цензурная, в 1870 году – городская реформа и закончены преобразования в армии. Теперь крестьян называли мелкими сельскохозяйственными производителями, ведущими индивидуальное хозяйство силами одной семьи. Дворохозяева сельского общества на сходе избирали из своей среды старосту, сборщика податей и представителей на волостной сход, который в свою очередь избирал старшину, и суд, судивший крестьян по мелким уголовным и гражданским делам на основе обычного права. Волостной сход контролировался мировыми посредниками и позднее земскими начальниками.
Мировые посредники разбирали отношения, споры и жалобы крестьян и помещиков, утверждали сельских старост, волостных старшин, отрешали их от должности, занимались потравами и порубками, могли арестовать на семь дней. Мировые посредники, назначавшиеся губернатором и губернским предводителем дворянства из местных помещиков, утверждались Сенатом. Новые отношения в деревне потребовали проведение земской реформы.
В 1864 году было принято «Положение губернских и уездных земских учреждениях». Землевладельцы, горожане и крестьяне на основе большого имущественного ценза выбирали гласных членов земских собраний, которые сформировывали земские учреждения. Раз в три года или ежегодно уездные и губернские собрания во главе с предводителями дворянства, городскими головами и мировыми посредниками на основе самоуправления и самофинансирования избирали уездные и губернские земские управы, контролировали их работу и утверждали бюджет. Земские управы из председателя и трех членов занимались только местными делами строго в пределах территории своей губернии и уезда. Для выполнения работ управы выбирали уполномоченных. По «Положению» 1864 года земские управы занимались устройством и содержанием дорог, мостов, перевозов, больниц, школ, рынков, пожарных команд, приютов, ветеринарных и статистических служб, межевых комиссий и других местных учреждений. Земства несли ответственность за народное образование и здравоохранение, за качество дорог. Постановления земских учреждений вступали в силу только после одобрения губернаторами. Земствам разных губерний и уездов запрещалось самостоятельно вступать в деловые контакты друг с другом.
Выборы гласных членов в земские собрания были сложными. Сельские общества посылали своих представителей на волостной сход, где они избирали выборщиков, которые могли выбрать ограниченное количество гласных. На земства оказывалось давление властей. С 1890 года гласных из крестьянских выборных назначал губернатор. Была создана особая курия дворян-землевладельцев с большими правами. Выбиравшиеся из потомственных дворян земские начальники контролировали сельское и волостное управление, утверждали всех крестьянских должностных лиц.
В 1864 году была проведена судебная реформа, признанная самой последовательной и значительной реформой Александра II. Был введен внесословный, гласный суд с участием присяжных заседателей, адвокатурой и состязательностью сторон. Судебные заседания стали открытыми, хотя это правило нарушалось, их материалы могли помещаться в периодической печати. Виновность или невиновность подсудимых устанавливали присяжные заседатели, меру наказания определяли профессиональные судьи. Решения судов с присяжными объявлялись окончательными. Был создан институт судебных следователей и адвокатура. Вводился принцип несменяемости судей, для всех – высокий образовательный ценз. Из обыкновенного порядка судопроизводства изымались политические дела.
В июне 1870 года было объявлено «Городовое положение», заменившее в пятистах городах империи сословные органы самоуправления всесословными городскими думами и управами, гласные члены которых избирались на четыре года. Городские думы формировались по специальным куриям на основе высокого имущественного ценза, зависящего от размеров выплачиваемых в казну налогов. Городские думы избирали городские управы из городского головы и нескольких членов. Думы и управы городов занимались хозяйственной деятельностью, благоустройством, рынками, ярмарками.
В течение пятнадцати лет в России проводилась военная реформа. Рекрутская повинность была заменена всеобщей воинской, армия была оснащена нарезным оружием, улучшилась боевая подготовка в войсках, были созданы военные округа, юнкерские училища. Вместо двадцатилетней рекрутчины в армию на шесть лет призывались все военнообязанные с двадцати одного года. В мирное время призывался каждый четвертый призывник. Не призывались единственный кормилец в семье, единственный и второй сын, если первый сын отслужил.
В 1864 году был создан ревизионный орган – Государственный контроль, власти пытались ввести гласность бюджета, создан единый Государственный банк. Считалось, что было резко снижено казнокрадство.