Известно, что первое покушение на Императора Александра III готовилось в Петербурге уже в день погребения Царя-Освободителя Александра II, но было предотвращено благодаря бдительности Петербургского градоначальника, генерал-лейтенанта Николая Михайловича Баранова, арестовавшего значительную часть заговорщиков, собиравшихся убить Государя Александра III на Невском проспекте.
По прибытии в столицу Государь Император издал Высочайший манифест, который был зачитан во всех храмах. В нем говорилось:
Истинно Слово Божие:
В память о чуде милости Божией к Царской Семье у места крушения вскоре был устроен скит, названный Спасо-Святогорским. У подножия насыпи был поставлен деревянный Крест с изображением Спаса Нерукотворенного; это то место, на которое ступила Императорская Семья, выйдя невредимой из-под обломков вагона-ресторана. Тут же, в нескольких саженях от насыпи, был сооружён великолепный храм в честь Христа Спасителя Преславного Преображения. Всего же в память чудесного спасения 17 октября в течение 1888–1896 годов в России было построено на народные средства 126 храмов, 32 придела и 320 часовен.
В девяностых годах XIX века в Экспедиции Заготовления Государственных Бумаг трудилось около четырех тысяч человек. Она была одним из самых богатых государственных предприятий в России – имела свою больницу, санаторий, школу, приют-ясли для детей работников Экспедиции (в ясли принимали младенцев и детей от 2 до 6 лет), клуб, дачу для малоимущих рабочих и даже собственный театр.
14 октября 1889 года, в канун годовщины чудесного избавления Государя Императора и Его Августейшей Семьи от опасности, грозившей при крушении поезда у станции Борки, труженики Экспедиции, «движимые верноподданническими чувствами», обратились к Министру финансов с ходатайством о Высочайшем разрешении открыть добровольную подписку, чтобы ознаменовать день спасения Царя каким-нибудь «добрым, богоугодным делом». По почину Управляющего Экспедицией Р. Э. Ленца, они постановили выстроить на свои пожертвования отдельную церковь при Экспедиции. Высочайшее разрешение открыть добровольную подписку на строительство храма было получено 28 октября 1889 года. Во всех подразделениях Экспедиции были заведены подписные листы и установлены кружки для анонимного сбора пожертвований.
Было решено освятить новый храм во имя того святого, чей день памяти приходится на 17 октября, когда произошло чудесное спасение Царской Семьи. В этот день отмечается память нескольких святых. Предпочтение было отдано преподобномученику Андрею Критскому.
О жизни этого страдальца за имя Христово из церковной истории известно немного. Этого святого надо отличать от тезоменного ему Андрея, архиепископа Критского, творца Великого покаянного канона, который жил несколько ранее преподобномученика. Святой Андрей, в честь которого был назван храм при Экспедиции Заготовления Государственных Бумаг, прославился страданием за почитание икон во времена иконоборчества в VIII веке. Избранник Божий при большом стечении народа открыто обличал императора Константина Копронима, который был ревностным иконоборцем. Святой Андрей был подвергнут жесточайшим пыткам и мучениям, а затем убит. По молитвам к преподобномученику исцелялись многие болящие и одержимые нечистыми духами. Вот такого небесного покровителя обрели работники Экспедиции Заготовления Государственных Бумаг.
К маю 1891 года ими было собрано пожертвований для строительства храма на сумму около 32 тысяч рублей. Но оказалось, что на постройку отдельно стоящей церкви этой суммы не хватает, и, кроме того, выяснилось, что Экспедиция не располагает достаточно обширным свободным местом для отдельно стоящей церкви.