Воскресенский собор – двухэтажный пятиглавый восьмистолпный храм на высоком цоколе, центральный в данной композиции – построен в 1849–1862 гг. по проекту архитектора Н. Е. Ефимова. Собор строили с перерывом в 6 лет. В соборе были устроены пять престолов, два из которых располагались на хорах. В июле 1861 г. митрополит Исидор освятил главный придел, а через год епископ Леонтий – последний придел во имя Всех Святых. Храм расписали А. А. Колчин и Р. Ф. Виноградов, образа исполнили монахини под руководством Г. И. Яковлева. Монахини сами и позолотили купола, при сооружении покрашенные в зеленый цвет. В 1874–1875 гг. архитектор Г. И. Карпов устроил в подвале облицованный белым мрамором придел во имя Святителей Феодосия Печерского и Григория Великого. Значительные средства на сооружение собора были пожертвованы купцами Громовыми. Вся постройка обошлась в 119 440 руб. (кроме иконостасов и клиросов). Фундамент и цоколь сооружены в 1849–1850 гг. на сумму, выданную из казны.
В 1932 г. городские власти передали закрытый собор под устройство универмага.
Монастырские кельи выстроены в два этажа на подвале. Окна келий собраны в группы по три, при этом центральное окно является декоративным «глухим окном». Оконные проемы имеют арочную форму, их наличники служат распорками для стрельчатых арок русского типа, завершающих каждое окно. Западный келейный корпус прерывается двумя церквами, расположенными, соответственно, к югу и к северу от Воскресенского собора: «келейной» церковью Афонской (Ватопедской) иконы Божией Матери (к югу) и церковью Трех Святителей Вселенских (к северу). Живописная Афонская церковь была заложена 10 июля 1850 г. на втором этаже правого корпуса и строилась по проекту Н. Е. Ефимова и Н. А. Сычева, измененному Л. Л. Бонштедтом. 28 июля 1854 г. она освящена митрополитом Никанором в присутствии великой княжны Марии Николаевны во имя Афонской (Ватопедской) иконы Божией Матери «Отрада и Утешение». Архитектором иконостаса церкви был придворный архитектор А. И. Штакеншнейдер, образа написали монахини. Церковь Трех Святителей была построена теми же архитекторами симметрично Афонской в больничном корпусе монастыря. Заложена она была также в 1850 г., достроена и освящена в 1855-м. Она особенно почиталась монахинями за находившуюся там икону Божией Матери «Благоухающий Цвет», привезенную игуменией Феофанией из Горицкого монастыря. Обе церкви пятиглавые, с шатровой одноярусной колокольней. Их луковичные купола позолочены, шестигранные шатры колоколен покрашены в зеленый цвет, завершением шатров является позолоченная луковичная главка с крестом. Фасады церквей, изобилующие арками, завершают полукруглые закомары. На каждой грани шатров прорезаны слуховые окна. В восточной части обеих церквей имеются алтарные апсиды.
В 1892–1895 гг. возведена надвратная четырехъярусная, высотой 75 м, колокольня с Исидоровской церковью (арх. Л. Н. Бенуа, В. П. Цейдлер, не сохранилась), придававшая ансамблю монастыря более традиционный вид.
Последней по времени постройкой на территории монастыря стал сооруженный в 1907–1918 гг. большекупольный каменный храмусыпальница во имя иконы Божией Матери «Утоли моя печали» (Казанская, арх. В. А. Косяков, худ. Ф. Р. Райлян) рядом с первой деревянной Казанской церковью, службы в которой проводились до 1920 г. Проектирование и возведение каменной Казанской церкви по времени совпало со строительством Морского собора в Кронштадте (1902–1913 гг.), и для их создания Косяков изучил архитектуру главной святыни христианского востока, как тогда говорили, «чуда и славы века» – собора Св. Софии (532–537). Результатом поездки архитектора в Константинополь стал ряд архитектурных зарисовок, а также усвоение некоторых особенностей строительного мастерства. Строительство началось практически сразу после одобрения проекта Священным синодом 15 апреля 1907 г. В течение 1907 г. сделан бетонный фундамент, цоколь будущего здания облицован серым гранитом, также устроены и 350 двухъярусных склепов из железобетона. Из него же соорудили и склепы снаружи будущей усыпальницы. Для Казанской церкви приобрели во Франкфурте специальный облицовочный кирпич. 8 июня 1908 г. при большом стечении духовенства, очень торжественно состоялась закладка церкви. Уже спустя два года ее строительство было закончено.
Пятиугольный трехпридельный храм покрыт красной глазурованной черепицей, также привезенной из Германии. Барабан центральной и малых глав украшен орнаментом из майолики. Важным декоративным элементом в общем «узоре» здания служит кирпичная кладка. Три портала декорированы резьбой, выполненной по бетону с использованием мозаичных вставок. Здесь можно увидеть символические изображения евангелистов, виноградной лозы, птиц. К работе в храмах Косяков обычно привлекал мастерские и художников, уже ему известных. Среди них – керамическая мастерская П. К. Ваулина – О. О. Гильдвейна и мозаичная мастерская Фроловых.