В первой половине 1584 года Алессандро Фарнезе удалось отрезать мятежный Антверпен с моря. Старинные торговые центры вроде Брюгге и Ипра сразу пошли на мировую, а осада Антверпена продолжалась в течение 13 месяцев и стала одной из самых знаменитых в военной истории. 17 августа 1585 года в то время крупнейший город в Нидерландах и самый богатый город Европы капитулировал.
Теперь под начальством Алессандро Фарнезе находилась обширная территория, впоследствии получившая самостоятельное политическое существование под названием Бельгия.
17 августа пришлось пойти на капитуляцию, которая в основном совпадала с условиями сдачи других городов, если не считать пункта о сроке, предоставленном протестантам для эмиграции или перехода в католичество, который, ввиду значительного количества их, был доведен до четырех лет. Падение Антверпена было апогеем славы Фарнезе. Вся Европа с неослабевающим вниманием следила за перипетиями осады, которая стала знаменитой в истории военного искусства.
Удачливый полководец решил не возвращаться к себе в Италию до тех пор, пока не будет закончено усмирение северных провинций (тем более что его желание в данном вопросе не имело никакого значения, поскольку он был верным слугой Филиппа II). Этим планам не суждено было осуществиться, поскольку Филипп II ввязался в войну с Англией и повелел, чтобы Алессандро Фарнезе готовился к переправе через пролив Ла-Манш. Бесславный конец Непобедимой армады (Armada Invencible) не мог не сказаться на престиже испанского наместника в Нидерландах.
Рана, полученная им во время предыдущего похода, окончательно подорвала его здоровье, и он тщетно искал себе исцеления на водах в Спа. Он еле мог держаться в седле, и все присутствовавшие при его отъезде предчувствовали, что им не суждено увидеть его больше. Несмотря на свою выдержку, он принужден был остановиться в Аррасе. Здесь он и умер 3 декабря 1592 года.
После разгрома Непобедимой армады Алессандро Фарнезе, желая поддержать дело католицизма, в 1590 году вступил с войском во Францию в качестве союзника тамошних католиков против Генриха IV. Но там его успехи остались бесплодными, так как из Испании ему не оказали никакой поддержки. Он был ранен при Кодебеке, тяжело заболел и вскоре скончался.
Что же касается Антверпена, то численность населения города упала со 100 000 жителей в 1560 году до 42 000 в 1590 году. Виллем Оранский, аристократ, потомками которого были все последующие нидерландские монархи, был объявлен Филиппом II вне закона, а 10 июля 1584 года его убил сторонник короля Бальтазар Жерар.
После падения Антверпена Виллем Оранский с семьей перебрался в монастырь в городе Делфт. Там он проходил лечение и продолжал организовывать встречи и приемы. А Бальтазар Жерар был католическим фанатиком из Франш-Конте. Для него была придумана легенда, согласно которой он являлся жертвой испанских репрессий и сторонником политики «оранжистов». Ему сделали фальшивые документы на имя Франца Гюйона, по которым он был принят на военную службу к Виллему Оранскому. 10 июля 1584 года он явился в дом Виллема Оранского с просьбой об аудиенции. Ввиду занятости принца прием ему был назначен на послеобеденное время. Убийца спрятался в темном углу неподалеку от лестницы и, когда принц в окружении двух человек приблизился к нему, сделал выстрел из пистолета с близкого расстояния. После этого нападавший бросился бежать, но был настигнут солдатами. А Виллем Оранский умер практически мгновенно. Согласно преданиям, последними его словами были: «О Боже, сжалься над моей душой… Сжалься над этим несчастным народом…»