Жан-Батист Бернадотт собрал под Антверпеном армию из 30 000 человек, и сам Луи Бонапарт присоединился к голландским частям. Кроме того, голландские канонерские лодки начали атаковать британские корабли.
8 августа гарнизон под командой генерала Монне совершил высадку, но вынужден был отступить перед превосходящим его в десять раз противником. По итогам сражения французы потеряли 800 человек, а британские потери составили 1500 солдат и офицеров.
13 августа Флиссинген подвергся 42-часовому бомбардированию. Несмотря на это, генерал Монне отверг предложение о сдаче, поэтому 15 августа началось повторное нападение – еще более сильное, чем первое.
На следующий день генерал Монне вынужден был подписать акт о капитуляции, по условиям которой французский гарнизон (4000 человек) был с воинскими почестями отправлен в Англию.
Из завоеванного города британцы попытались продвинуться дальше вверх по Шельде, однако их продвижение было задержано несколькими фортами. Французы привели Антверпен, Берген-оп-Зом и все береговые батареи в повышенную боевую готовность. А вот среди британцев из-за болотистой местности вспыхнула малярия, и ежедневно только от этого у них умирало от 20 до 25 человек. Кроме того, возникли разногласия по поводу дальнейших действий – особенно между морскими и сухопутными офицерами. В итоге военный совет 26 августа пришел к выводу, что дальнейший успех маловероятен.
Остров Валхерен было решено удерживать, но 4 сентября началась эвакуация с острова Южный Бивленд. Сразу после этого французы заняли оставленные позиции.
Тем временем лихорадка усилилась, причем она косила ряды исключительно британцев, так как нидерландских солдат характеризовала малая восприимчивость к этому заболеванию (дело в том, что эта болезнь была сильно распространена в прибрежных районах их родины, поэтому у местных жителей выработалось нечто вроде иммунитета). А вот австрийцы после Ваграма вступили в переговоры о мире, положив тем самым конец Пятой коалиции. Таким образом, экспедиция, стоившая британской казне астрономической суммы в 8 млн фунтов, в сложившихся условиях потеряла всякий смысл.
Недовольный Наполеон заменил впавшего в немилость Бернадотта маршалом Бессьером, но тот уже практически ничего не мог изменить. Он лишь выбил британцев с острова Зюйдбевеланд и попытался блокировать Валхерен. Но к тому времени большая часть британцев уже вернулась домой, а 14 сентября и Джон Питт покинул остров.
Овладевая чужими секретами, британское правительство нередко не могло сохранить свои собственные. В июле 1809 года английский флот появился в устье Шельды, захватив остров Валхерен, базу для своих действий против Бельгии и Голландии, находившихся в руках французов. В Лондоне рассчитывали на то, что главные силы Наполеона сконцентрированы против Австрии. Однако экспедиция окончилась полной неудачей, и в декабре 1809 года Валхерен был очищен от английских войск. Немалую роль в этой неудаче сыграла неспособность достигнуть внезапности. Один из участников экспедиции писал: «Положение было таково: как только министры начали обсуждать вопрос, секрет сразу стал достоянием гласности на континенте, как большинство наших секретных дел в то время. Можно с уверенностью сказать, что почти в каждом случае, когда успех экспедиции зависел от секретности, единственными лицами, не знавшими, в чем дело, были офицеры, которым поручалось командование».
Что же касается французов, то они первоначально планировали захватить британские позиции силой, но предпочли подождать и посмотреть, что будет происходить дальше. Британцы удерживали остров в течение нескольких месяцев, прежде чем правительство приказало войскам вернуться, чтобы спасти то немногое, что осталось от измученных лихорадкой войск. Укрепления Флиссингена и другие военные объекты были разрушены. А 23 декабря 1809 года последние британские войска покинули остров.