На севере страны, в Голландии, Зеландии и Утрехте также происходили значительные изменения. Цеховое производство уступало место капиталистическим мануфактурам. В Лейдене в больших количествах производились шерстяные и льняные ткани. Но ключевой отраслью экономики северных территорий было кораблестроение и связанное с ним рыболовство. В середине XVI в. флот небольшой страны насчитывал 15 тыс. кораблей и 150 тыс. моряков. В процентном отношении флот Нидерландов в общем составлял 75 % мирового флота. Только в двух городах – Амстердаме и Зандаме – насчитывалось около 130 верфей. Интересно, что строительство кораблей обходилось в 1,5–2 раза дешевле, чем, например, в Англии, и во много раз дешевле, чем в других странах Европы. Именно поэтому в Нидерландах строили корабли почти для всех европейских стран. Практически в каждом городе, особенно на севере, существовали канатные, парусные, бумажные, стеклянные, деревообрабатывающие мануфактуры, а также лесопилки. В рыболовстве было занято более 100 тыс. человек, а в море, в среднем, за год выходило до 2 тыс. кораблей.
В сельском хозяйстве Нидерландов также происходили значительные изменения. Во Фландрии и Брабанте на смену цензиве постепенно приходит краткосрочная феодальная аренда. Постепенно распространяется и капиталистическая арена. В среде крестьянства, по большей части свободного, происходило расслоение. Все более динамичное развитие товарно-денежных отношений привело к тому, что увеличивалась масса малоземельных и безземельных крестьян. Более того, лишенные основного средства производства – земли, крестьяне превращались в наемных работников мануфактур, батраков, поденщиков, что значительно меняло социальную структуру нидерландского общества в середине XVI в.
Постепенно менялась и роль дворянства в экономическом развитии страны. Разбогатевшие фермеры и богатые горожане все больше вытесняли представителей аристократии из хозяйственной и политической жизни. Обедневшие дворяне вынуждены были продавать свои земли. Наиболее предприимчивые из них пытались вести хозяйство по новому, по буржуазному образцу, но не все преуспели на этом поприще. Лишь немногие представители дворянства, располагая значительными средствами, заводили на своих землях крупные молочно-животноводческие хозяйства предпринимательского типа.
В целом, утверждение капиталистического уклада привело к подъему сельского хозяйства в Нидерландах. Здесь существовала передовая для своего времени агротехника, в том числе система многопольных севооборотов, происходила товаризация всего сельскохозяйственного производства. В Голландии и Зеландии проводились работы по осушению болот, а с помощью плотин и дамб у моря были отвоеваны тысячи гектаров земли, получившие название польдеры. Эти земли также использовались для нужд сельского хозяйства. В частности, на этих плодородных землях, представлявшие собой замечательные луга, откармливались тысячи быков из Дании, которые потом с выгодой продавались на европейских рынках.
Таким образом, на протяжении XVI в. в недрах феодального общества в Нидерландах сложились буржуазные отношения. Общий объем годового производства в Нидерландах в середине века оценивался суммой около 100 млн гульденов. Примерно половину из них давало сельское хозяйство, половину – торгово-промышленная деятельность. Но ускорение экономического развития вело к усилению региональных диспропорций. Центральные, северные и южные группы провинций развивались крайне неравномерно, что впоследствии и привело к выбору различных путей социально-экономического и политического развития. Мануфактуры Фландрии и Брабанта ориентировались на ввозимое из Испании сырье, и были связаны с традиционно подчиненными испанцами рынками. В этих провинциях крестьянство было все также опутано различными феодальными повинностями, а дворянство сохраняло свое привилегированное положение и политический вес. Городская и сельская верхушка, скупившая земли продолжали обрабатывать землю посредством принуждения крестьян, основываясь на феодальных методах. Кроме того, единый внутренний рынок, в отличие от севера еще не сложился, например, только на речном пути по Маасу от Намюра до устья реки существовало более трех десятков застав, которые взимали пошлину за провоз товаров. На севере даже отсталые сельскохозяйственные провинции были втянуты в товарно-денежные отношения. Дворянство владело сравнительно незначительной частью земли, крестьяне, свободные в своем подавляющем большинстве, владели собственной землей на правах собственности. Наличие мощного торгового флота и ориентация на европейский рынок и Англию в качестве поставщика сырья делали северные провинции независимыми от Испании. Таким образом, на территории Нидерландов образовались два полюса во главе с Антверпеном и Амстердамом, которые так или иначе стали соперниками и имели различную внешнеполитическую ориентацию.