Еще ничего не зная о бунте (письмо Еропкина прибыло а Петербург только 23 сентября), императрица в качестве особо доверенного лица командировала в Москву своего фаворита графа Григория Орлова, а с ним ряд высших чиновников, доктора Орреуса, штаб-лекаря Тоде и команду солдат из гвардейских полков.
Екатерина II болезненно восприняла известие о бунте в Москве. Она ввела жестокую цензуру на любое сообщение о нем. Все письма, идущие из Москвы, вскрывались на почте, и если в письме упоминалось
бунте, то его сжигали. Вот как императрица писала почт-директору Эку об этих событиях: «Письма, в которых сие происшествие названо бунтом, советую сжечь, а прочие — раздайте».
В другом письме к Эку сказано ею следующее: «Мое мнение таково, чтобы все французские письма, в коих бестолково о московской истории пишут и кои из Москвы сюда присланы с сегодняшнею почтою, отправились в ваш камин».
Поведение графа Салтыкова ее неприятно поразило. В своем письме А.И. Бибикову (1729–1774) от 20 октября она отметила, что «слабость фельдмаршала Салтыкова превзошла понятие». Она считала, что его отъезд спровоцировал бунт.
Орлов выехал в Москву 21 сентября, но из-за распутицы прибыл гуда лишь 26 сентября. На пути, 22 сентября, он узнал о бывшем в Москве мятеже. Отправление графа было обставлено очень торжественно, оно было объявлено даже особым Высочайшим манифестом. Орлову было дано 100 тыс. рублей на расходы, связанные с противочумными мерами, и диктаторские полномочия.
На другой день после своего прибытия в Москву Орлов сообщил Екатерине «об отчаянном состоянии тамошних жителей». После подавления бунта смертность населения от чумы возросла. В конце сентября число ежедневно умирающих доходило до одной тысячи человек. Все «старания для прекращения моровой язвы» были безуспешны.