В иных случаях пневмония была лобулярная, сливная. В своем отчете об эпидемии в Текебай-Тубеке И.Ф. Рапчевский писал следующее: «оплотневшие части легких оказывались непроходимыми для воздуха, на разрезе центр оплотнения серовато-красного цвета, иногда пронизан геморрагиями, периферия оплотнений более красного цвета, поверхность разреза слегка зернистая, с ней соскабливается обильное количество вязкой студенистой красноватой жидкости. При ближайшем рассмотрении оплотнения оказывались состоящими из отдельных, отчасти сливающихся между собою, фокусов. В соседстве с оплотнением легочная ткань сильно гиперемирована». В одном случае профессором Левиным была найдена пневмония, состоявшая из многочисленных рассеянных узлов оплотнения темно-красного цвета, достигавших величины лесного ореха (протокол вскрытия Сагиры Беркалиевой). Почти во всех случаях к пневмонии присоединялся фибринозный плеврит. На плевре в нескольких случаях были найдены мелкие геморрагии. Бронхиальные лимфатические железы в иных случаях были увеличены, имели геморрагии; в других — не представляя настоящих бубонов, были иногда несколько увеличены и гиперемированы, большей же частью макроскопически казались совершенно нормальными. В одном случае наблюдалось увеличение брыжеечных и забрюшинных лимфатических желез.
Несколько раз были найдены кровоизлияния на околосердечной сумке, в печени, на слизистой оболочке желудка. Селезенка и печень большей частью были умеренно увеличены, в состоянии гиперемии. Почки также немного увеличены, полнокровны. В одном случае слизистая оболочка лоханки усеяна мелкими кровоизлияниями. В другом случае при вскрытии черепной кости твердая и мягкая оболочки мозга оказались налитыми кровью.
Бактериологическое исследование трупов дало положительный результат, несмотря даже на то, что два трупа были вскрыты через месяц после смерти; впрочем, трупы лежали в нетопленых землянках, были совершенно замерзшими и не представляли никаких признаков разложения. Для исследования из органов были сделаны мазки, посевы на питательные среды, и полученные культуры проведены через животных (морских свинок и мышей).
«Кроме посевов, — писал Виноградов, — были сделаны микроскопические препараты — мазки из гепатизированной части легкого, из околобронхиальных лимфатических желез, из крови сердца, из селезенки, печени и почек. Окрашенные метиленовой синькою или фуксином препараты эти представили между клеточными элементами многочисленные, мелкие овальные и палочкообразные биполярные бактерии, какие находятся при человеческой чуме. В гепатизированной части легкого они встречались массами, много их было в мазках из бронхиальных желез и селезенки, меньше из печени, крови и почек. По способу Грамма они не красились. Несколько менее ясными, но все-таки достаточно хорошо сохранившимися представлялись те же бактерии и на срезах, сделанных из уплотненных в спирте органов и окрашенных тио-нином. В гепатизированной части легких они массами наполняли собой легочные альвеолы вместе с продуктами крупозного воспаления: с лейкоцитами и волокнами фибрина и изредка с отслоившимися эпителиальными клетками. Некоторые из этих клеток содержали в протоплазме бактерии, другие были без ядер, в состоянии некроза. Бактерии наполняли также щели и соединительные ткани легочных альвеол и их промежутков; встречались также, хотя и в меньшем количестве, в кровеносных сосудах альвеол. По форме они отличались, как и на мазках, разнообразием — одни имели шаровидную (кокки), другие — овальную и более вытянутую палочкообразную форму, с закругленными концами, попадались палочки длинные в виде нитей, шаровидные и овальные тельца нередко располагались рядами в виде цепей; овальные тельца и короткие палочки часто являлись окрашенными только на концах».
Посевы на искусственных средах дали положительный результат. К.Н. Виноградов так описывал рост колоний на агаре: «Посев из крови сердца. На другой день к вечеру, по косой поверхности агара найдены многочисленные, мельчайшие, полупрозрачные, сероватые, круглые зернышки в виде бисера. На третий день в 10 час вечера зернышки увеличились и получили желтоватый оттенок». Полученные из органов умерших культуры были привиты морским свинкам и мышам. Животные пали, и на вскрытии найдена типичная картина бубонной чумы; посевы из органов дали культуру чумы. Всего было подвергнуто полному бактериологическому исследованию 14 трупов, часть из них на месте в Текебай-Тубеке, а часть в лаборатории на форте «Александр I».