Предложенный Клодницким план обследования сусликов, в связи с их предполагаемой ролью в эпидемиологии астраханской чумы, на этот раз вызвал уже горячую поддержку со стороны губернатора и профессора Таранухина. Под руководством ветеринарного врача В.Н. Образцова было создано 7 отрядов для ловли сусликов, а в 3 пунктах степи, которые были связаны между собой специально проведенными трактами и где имелся телеграф, открыты бактериологические лаборатории для исследования пойманных грызунов.
В связи с тем, что уже в августе суслики залегают в спячку, было решено выкапывать грызунов из норок и следить за развитием заболевания в лабораторных условиях. План был принят на основании предположения, что суслики залегают в зимнюю спячку уже больными.
Всего в лабораторию было доставлено 450 сусликов, но из этого числа обследованных грызунов лишь в 3 случаях удалось выделить культуры чумных бактерий.
2 октября 1912 г. Деминский впервые выделил культуру палочки чумы из спонтанно заболевшего суслика, но в крайне трагических обстоятельствах.
В конце сентября он потерял уверенность в том, что выделенные им от больных и погибших сусликов и тушканчиков культуры бактерий были возбудителем чумы. Микроскопически он наблюдал отчетливые цепочки, клетки имели ясную полюсность, но их вирулентность вызывала у него сомнения. Инфицированные мыши погибали только при заражении в брюшину. Деминский принял решение выдерживать извлеченных из нор с виду здоровых сусликов в особых закрытых помещениях, т. е. дать развиться смертельной инфекции (септицемии). Эта мысль оказалась верной: 30 сентября был доставлен суслик, павший 2 октября и оказавшийся чумным.
Во время работы Деминский заразился чумой. Это была легочная форма чумы, как она и проявляется в подавляющем большинстве случаев экспериментального заражения. Клодницкий так описывал его болезнь и смерть.