Однако России не удалось осуществить в полной мере свои планы по ремилитаризации Аландов, хотя, несмотря на сопротивление Швеции, она добилась косвенного согласия других держав на их укрепление. После интенсивных переговоров 23 апреля 1908 г. по инициативе России, стремившейся укрепить свои северо-западные границы и добиться ликвидации Конвенции 1856 г. об Аландах, в Петербурге с представителями Германии, Дании и Швеции была подписана декларация о сохранении статус-кво в бассейне Балтийского моря. В ней провозглашалось намерение подписавших держав сохранить в неприкосновенности свои права на владения, омываемые Балтикой. В случае угрозы территориальному статус-кво расположенных в этом регионе государств стороны соглашались вступать в переговоры о мерах по его сохранению. По настоянию российской дипломатии одновременно был подписан меморандум, где указывалось, что содержание декларации не касается права держав свободно использовать суверенную власть на принадлежавших им территориям.
Противоречия на Балканах и Боснийский кризис нарастали. С 1907–1908 гг. сотрудничество между российской и австро-венгерской дипломатией в поддержании статус-кво на Балканах начало давать сбои. 28 сентября 1907 г. в Вене министрами иностранных дел России и Австро-Венгрии А. П. Извольским и А. Эренталем было подписано соглашение, предусматривавшее реализацию Мюрцштегской программы вплоть до 1914 г., для чего Турции предлагалось продлить полномочия военных и гражданских чинов европейской администрации в трех вилайетах еще семь лет. Однако уже на следующий год Австро-Венгрии удалось заключить с Турцией соглашение о постройке ею железной дороги от столицы Боснии Сараева через санджак Новый Пазар с выходом на Салоники, что практически сводило на нет соглашение с Россией 1907 г. Серьезный сдвиг в положении дел на Балканах вызвала начавшаяся 3 июля 1908 г. младотурецкая военная революция в Османской империи, заставившая Абдул-Гамида II восстановить конституцию и созвать парламент.
Для великих европейских держав, увидевших в этой революции дальнейшее ослабление Турции, было естественным воспользоваться ею для укрепления своих позиций на Балканах. Так, в Австро-Венгрии милитаристские круги стали помышлять о дальнейшей экспансии в этом регионе, в частности в направлении Сербии и Салоник. Вена окончательно приняла давно вынашиваемое решение об аннексии Боснии и Герцеговины, оккупированных еще в 1878 г. В сентябре 1908 г. Извольский прибыл в Австро-Венгрию, где в замке Бухлау (Чехия) встретился со своим коллегой Эренталем. Между ними было достигнуто устное предварительное секретное соглашение по балканским проблемам, которое предусматривало, что Австро-Венгрия не будет противиться изменениям международно-правового режима Босфора и Дарданелл и согласится на предоставление России права проводить свои военные суда через Проливы поодиночке. Взамен Россия соглашалась на присоединение к Австро-Венгерской империи Боснии и Герцеговины. Была достигнута договоренность и об эвакуации австро-венгерских войск из Нови-Пазарского санджака, о согласии на провозглашение полной независимости Болгарии, о передаче Греции острова Крит и о допуске Сербии и Болгарии в Дунайскую комиссию прибрежных держав. Однако Извольский стал настаивать на созыве общеевропейской конференции для окончательного решения балканских проблем, поставив одновременно вопрос о территориальных компенсациях Сербии и частичном пересмотре в пользу Черногории ограничительных статей Берлинского договора 1878 г.
Младотурецкая революция 1908 г. стала поводом для новой перестройки политической карты Балкан. Болгарский князь Фердинанд Кобургский по договоренности с Австро-Венгрией провозгласил 5 октября 1908 г. полную независимость Болгарии, а через два дня, 7 октября, Австро-Венгрия в одностороннем порядке объявила об аннексии Боснии и Герцеговины, что вызвало острый международный кризис, и прежде всего серьезно ухудшило отношения с Россией. В октябре 1908 г. российское правительство официально расторгло устное соглашение, достигнутое только что в Бухлау. Правительство Турции заявило протест против аннексии Боснии и Герцеговины, но, не имея поддержки великих держав и испытывая внутренние затруднения, подписало с Австро-Венгрией 26 февраля 1909 г. соглашение, признав аннексию. В качестве компенсации Турция согласилась принять под видом выкупа вакуфных земель 2,5 млн ф. ст., что было платой за отказ от своего суверенитета над Боснией и Герцеговиной.