4 сентября 1945 года «в связи с окончанием войны и прекращением чрезвычайного положения» решением Политбюро ЦК ВКП(б) будет утвержден проект указа Президиума Верховного Совета СССР об упразднении Государственного комитета обороны. Все дела ГКО передавались Совету народных комиссаров СССР2. В связи с этим 6 сентября Политбюро рассмотрит вопрос об образовании оперативных бюро Совнаркома Союза ССР и утвердит соответствующий проект постановления СНК. Вместо существовавших на тот момент Бюро СНК и Оперативного бюро ГКО были созданы два оперативных бюро СНК. Одно из них – «по вопросам работы НКО, наркомвоенморфлота, сельскохозяйственных и пищевых наркоматов, наркоматов торговли и финансов, а также комитетов и управлений при Совнаркоме СССР». В его состав войдут В.М. Молотов (председатель), Н.А. Вознесенский (заместитель), А.И. Микоян, Н.А. Булганин, Н.М. Шверник. В ведение второго оперативного бюро вошли промышленные наркоматы и железнодорожный транспорт. В состав этого бюро войдут Л.П. Берия (председатель), Г.М. Маленков (заместитель), Н.А. Вознесенский, А.И. Микоян, Л.М. Каганович, А.Н. Косыгин. Функцией этих бюро было решение двух комплексов вопросов. Во-первых, устанавливалось, что оперативные бюро «подготавливают и представляют на рассмотрение Председателя СНК СССР проекты решений по народнохозяйственному плану (квартальному и годовому), по планам материально-технического снабжения, а также по отдельным важным вопросам, требующим решения Совета Народных Комиссаров Союза ССР». Во-вторых, оба бюро должны были принимать «оперативные меры по обеспечению выполнения установленных Совнаркомом планов», осуществлять оперативный контроль над выполнением решений СНК, принимать от имени СНК решения по вопросам текущего оперативного руководства деятельностью наркоматов и ведомств.
Сталин подпишет это постановление Политбюро (причем не в качестве секретаря ЦК, а как председатель СНК СССР) и тем самым оформит круг ближайших соратников. По состоянию на сентябрь 1945 года, разумеется, и не более3. При этом статус Вознесенского и Маленкова до положения своих заместителей Сталин повысит, лично вписав эти должности напротив названных фамилий. Этим, однако, не исчерпывается характеристика неформального статуса Маленкова в кремлевской иерархии. В годы войны он войдет в состав так называемой пятерки – неофициальной руководящей группы. Помимо самого Сталина, волей которого и формировались такие группы, она включала в себя Молотова, Микояна, Берию и Маленкова. Так что вполне уместно будет употребить французское выражение сгёше de la сгёше4 для описания этой фракции внутри Политбюро ЦК ВКП(б)5.
В 1945 году дальнейшее развитие получат работы в рамках «атомного проекта» и смежных с ним сферах науки и производства. 19 января на директора Ленинградского физико-технического института АН СССР академика А.Ф. Иоффе будет возложена персональная ответственность за строительство и ввод в эксплуатацию циклотронной лаборатории, намеченный на 1 января 1946 года6. В конце января «в целях расширения сырьевой базы производства металлического урана» ГКО примет решение об организации в Болгарии поиска, разведки и добычи урановых руд7. 8 марта будет принято решение о создании «в кратчайший срок в СССР сырьевой базы по урану». В связи с этим ГКО предпишет ряду ведомств провести мероприятия по организации геологоразведочных работ по урану в 1945 году8. Проблема кадров также окажется в фокусе внимания советского руководства. 21 февраля «в целях обеспечения высококвалифицированными кадрами» лаборатории № 2 АН СССР и научно-исследовательских учреждений, «работающих совместно с ней», ГКО обяжет Комитет по делам высшей школы при Совнаркоме обеспечить выпуск «физиков по атомному ядру»: в декабре 1945 года -10 человек, 1946-го – 25 человек и в дальнейшем – не менее 30 человек ежегодно. Разнообразные поручения будут даны также Московскому государственному университету, Наркомпросу, Мосгорисполкому, Наркомвнешторгу, Наркомчермету, Наркомцветмету, Наркомавиапрому, Наркомфину, Госплану, Главному управлению трудовых резервов и др.9 15 мая ГКО примет решение (постановление № 8568) демонтировать и вывезти в Советский Союз для лаборатории № 2 Академии наук все оборудование, материалы и библиотеку Института им. Кайзера Вильгельма в Берлине, Берлинского института по ядерной физике Министерства связи, ряда других лабораторий. Отдельным пунктом поручалось «товарищу Берия внести в ГОКО предложение об использовании немецких специалистов… на работе в Советском Союзе»10. В мае ГКО утвердит план научно-исследовательских работ лаборатории № 2 АН СССР на 1945 год11.