Холодная война продолжалась. Не прошло и трех месяцев после принятия закона о плане Маршалла, как мир оказался на грани войны из-за противостояния в самом центре Европы — в разделенном Берлине. Экономическое объединение западных зон оккупации Германии и западных секторов Берлина в 1947 г. имело следствием введение в июне 1948 г. новой валюты — западногерманской марки и включение Западного Берлина в сферу ее хождения. Это лишало СССР возможности оказывать экономическое влияние на западную часть города, а поток обесцененной старой марки хлынул в Восточный Берлин, где она продолжала хождение. По распоряжению Сталина 24 июня 1948 г. был введен запрет на передвижение и провоз товаров из западной части Германии в Западный Берлин. Американские власти были застигнуты врасплох. Трумэн выступил с несколькими противоречивыми заявлениями. В конце концов было решено организовать воздушный мост для снабжения Западного Берлина. Под руководством генерала Уильяма Таннера, назначенного руководителем воздушного моста, была разработана операция: созданы были пять уровней (высот) полета, предоставление каждому самолету только одной попытки посадки, пребывание самолета на земле не более 30 минут. Самолеты совершали посадку каждые 3–4 минуты. Помимо продовольствия они везли топливо и другие жизненно необходимые продукты. Трумэн тщательно следил за функционированием воздушного моста, понимая его не только гуманитарное, но и военнополитическое значение, роль в дальнейшем формировании противоположных лагерей. В конце концов ввиду бесплодности конфронтации по указанию Сталина в мае 1949 г. блокада Западного Берлина была отменена, вслед за этим был ликвидирован и воздушный мост.
При непосредственном участии Трумэна был подготовлен документ о создании военно-политического союза западных держав. При этом президент США исходил из того, что в дело коллективной обороны должны вносить посильный финансовый вклад все участники союза. 4 апреля 1949 г. в Вашингтоне представителями 12 стран (10 европейских, США и Канада) был подписан документ о создании Организации Североатлантического договора (НАТО). Главной в документе была статья 5, предусматривавшая, что все страны обязывались защищать каждого участника, на которого было бы совершено нападение. Блок НАТО был ориентирован на противодействие СССР и неизбежно должен был вызвать образование другого военно-политического блока, который был оформлен в 1955 г. под названием Организация Варшавского договора.
В 1948 г. предстояли очередные президентские выборы. Трумэн, который до этого на президентский пост не избирался, колебался, прежде чем согласиться на выдвижение своей кандидатуры. Он сталкивался с оппозицией не только республиканцев, которые выдвинули популярного губернатора штата Нью-Йорк Томаса Дьюи (он проиграл Рузвельту в 1944 г.), но и в своей партии. Демократические лидеры из южных штатов осуждали осторожные выступления президента за гражданские права негров и особенно внешнюю политику, отказ от изоляционизма.
Все же Гарри Трумэн дал себя уговорить и выставил свою кандидатуру на съезде Демократической партии в Филадельфии, который выдвинул его в президенты 15 июля. В качестве кандидата в вице-президенты был определен его бывший коллега по сенату Олбен Баркли.
Избирательная кампания проходила вначале неблагоприятно для Трумэна. Опросы показывали преимущество республиканцев. Они были убеждены в победе своего кандидата и вели кампанию расслабленно. Трумэн же, включившись в гонку, развернул активнейшую кампанию. Был создан специальный поезд, на котором Трумэн за три с половиной месяца объездил всю страну. Поезд останавливался на самых маленьких станциях, вроде бы по требованию собравшихся, но на самом деле остановки были спланированы и подготовлены. Появился, однако, термин «остановки по свистку». В своих выступлениях Трумэн убеждал, что преодоление нужды, увеличение доходов рядовых американцев будут способствовать росту авторитета США за рубежом, все большему доверию, недопущению поворотов новых стран к коммунизму, растущему восприятию Америки как признанного центра мировой цивилизации. Он все больше овладевал положением. Во всех штатах, в том числе на юге, обстановка изменялась в его пользу. Успеху Трумэна благоприятствовало и то, что он активно способствовал образованию государства Израиль в мае 1948 г. Это обеспечило ему поддержку как еврейского населения США, так и влиятельных деловых кругов.
На выборах 2 ноября Трумэн получил 24,1 млн голосов, Дьюи — 21,9 млн. В коллегии выборщиков на стороне Трумэна были 303 человека, за Дьюи стояли 189. Так Трумэн стал законно избранным главой государства.