В интервью газете «Вечерняя Москва» Патриарх сказал: «Мы не навязываем военнослужащим Православия, но считаем, что православные военнослужащие должны иметь возможность встретиться со священниками, равно как и другие, исповедующие, например, ислам, должны иметь возможность встретиться со своим духовным наставником».
«Воинская служба сопряжена с риском для жизни, с важным нравственным выбором личности, с решением непростых моральных проблем. Поэтому воины нуждаются в особом попечении со стороны Церкви. В каком-то смысле армейский уклад нам особенно близок. Как и в Церкви, в Армии служат. Дух служения Отечеству – это то общее, что делает возможным наше сотрудничество. Церковь благословляет воинов на вооружённую защиту Отечества, чтобы восторжествовало добро и справедливость, чтобы беззащитные и слабые не были обездолены, унижены и оскорблены. За мир и безопасность в нашем испорченном грехом мире надо бороться. Вот почему верующие воины всегда были одновременно и частью Церкви, и частью Армии».
Выступая 5 октября 2005 года, Патриарх говорил: «Сближение Церкви и Армии приносит добрые плоды, способствует пробуждению в душах военнослужащих идеалов русского воинства, которые так редки в наш век прагматизма и секуляризации». При этом он предупреждал, что Армия не может быть полем миссионерского соперничества. «Институт военного духовенства повышает моральный дух в Армии и способствует созиданию межрелигиозного мира среди военнослужащих. Однако это возможно при условии, что Армия не рассматривается как поле для миссионерской деятельности, на котором различные религии борются за привлечение новых последователей. Следовательно, в армейской среде должны работать среди своих последователей только те религиозные объединения, члены которых несут военную службу».
Всей своей деятельностью Патриарх Алексий II фактически сам явил образ военного священника, который, естественно, проявился в его делах на уровне Предстоятеля Церкви – архипастыря всего воинства Российского.
В июле 2009 года глава государства Д. А. Медведев принял решение об учреждении штатного института военного духовенства в Вооружённых Силах Российской Федерации. Произошло это по инициативе Патриарха Московского и всея Руси Кирилла, который как лидер Межрелигиозного совета России подготовил Совместное обращение к Президенту Российской Федерации по этому вопросу и первым подписал его. В обращении, в частности, отмечалось, что взаимодействие религиозных объединений с органами военного управления стало реальностью. Исторический опыт Российской армии и современная практика показывают востребованность в Вооружённых Силах института военных священников. Реализация этого предложения позволит повысить морально-психологическое состояние военнослужащих, особенно в соединениях и частях постоянной боевой готовности, а также реально выполняющих боевые задачи.
Президент Российской Федерации Дмитрий Анатольевич Медведев 21 июля 2009 года дал поручение министру обороны поэтапно ввести в Вооружённых Силах Российской Федерации институт военного духовенства.
Седьмого июня 2022 года Священный Синод постановил возродить существовавшую до 1918 года должность протопресвитера военного и морского духовенства.
С самого начала спецоперации в 2022 году в Новороссии военные священники направились в места боёв. Никто из них не был в штате воинских подразделений, участвовавших в спецоперации. Они направлялись туда по зову сердца, несмотря на то что эти командировки были смертельно опасными.
Уже через месяц, 24 марта, при обстреле приграничного села Журавлёвка в Белгородской области погиб военный священник протоиерей Олег Артёмов. Одиннадцать лет батюшка служил настоятелем в храме преподобного Сергия Радонежского в посёлке Комсомолец на Ставрополье. Морской офицер, терский казак, участник нескольких морских походов. В качестве корабельного священника дважды участвовал в кругосветном плавании и водном крестном ходе в честь адмирала Фёдора Ушакова. Много раз его жизнь, как говорится, висела на волоске, но была спасаема по молитвам.
Но у войны свои законы. Смертельный осколок «нашёл» свою жертву в нескольких километрах от линии фронта, в воинском подразделении, находящемся в тылу.
Похоронен протоиерей Олег в военно-морском мемориале Серафимовского кладбища в Санкт-Петербурге.
Президент России В. В. Путин подписал указ о награждении военного священника Олега Артёмова орденом Мужества.
Девятого сентября погиб иерей Анатолий Григорьев, настоятель храма Богоявления Господня села Исаково Зеленодольского района в Татарстане. Воинскую службу он тоже проходил на флоте, в Севастополе, и закончил её в звании старшего сержанта.
Отец Анатолий понимал, что его помощь необходима военнослужащим: «Без Бога там будет сложно, воинам нужна наша поддержка. Именно они дают уверенность в завтрашнем дне. Если наши солдаты делают добро, то в первую очередь для защиты людей, стариков и детей».