До сих пор засекречена значительная часть церковной документации последних восьми столетий, помещенная в Секретном архиве – гигантском спецхране Библиотеки Ватикана, который существует в своем нынешнем виде с XVII века. Этот архив размещается в двухъярусном подземном бункере с бронированными дверями. По находящимся там документам можно консультироваться только с санкции самого Папы. Должность главного распорядителя Секретного архива традиционно занимает кто-то из испанских кардиналов. Среди документов особой важности в строго оберегаемом отсеке этого архива лежит и тайна португальской монахини Лусии, которой в 1917 году явилась Дева Мария и сообщила точную дату конца света: Папа Пий XI уполномочил ее накануне своей неожиданной смерти изложить ему в письменном виде содержание полученного откровения.
Секретностью пропитаны все структуры Ватикана с вершины пирамиды власти до самого ее основания, даже еще глубже. Как в любом государстве, есть там свои спецслужбы – разведки, а соответственно, и контрразведки. Римская церковь, правда, официально в этом не признается. Тем не менее они продолжают действовать.
Так, служба внешней разведки Святого Престола создана еще при Пие V в 1556 году. Произошло это после образования монашеского ордена иезуитов, кои и составили ее основной отряд. Называлась служба «Святой Альянс» (СА) в честь тайного союза Ватикана с шотландской королевой Марией Стюарт. К концу того же века сформировалась структура аппарата разведки и специальных операций в нынешнем виде. Сотрудники СА занимаются также шифрованием документов, направляемых в нунциатуры и поступающих от них, работают в отделе печати и службе радиовещания. Подчиняется разведка только Папе Римскому.
К примеру, сотрудником СА был иезуит Вальтер Сисек, действовавший в СССР под именем Владимир Липинский. Там он устраивал подпольные мессы, вербовал новых адептов католицизма. После ареста и отбытия наказания вернулся в Ватикан делиться опытом с теми, кто намеревался попробовать себя на том же поприще. Дослужился до начальника «русского отдела» СА.
В послужном списке «Святого Альянса» фигурирует тщательно им скрываемое проведение сразу после окончания Второй мировой войны крупномасштабной операции под кодовым названием «Конвент». Агенты СА занимались тогда оформлением через Международный Красный Крест фальшивых паспортов для нацистских военных преступников и французских коллаборационистов. Для укрытия этих лиц в надежных убежищах подальше от Европы были налажены два «коридора». Один: Швейцария – Рим – Генуя – Южная Америка. Другой: Швейцария – Франция – Испания – Марокко – Южная Америка. Так, после получения паспортов и рекомендательных сертификатов Ватикана удалось выехать в Аргентину разыскиваемым повсюду нацистским палачам Менгеле, Эйхману, Барбье и хорватскому диктатору Павеличу. С немецкой стороны операцию координировала тайная организация ветеранов СС «ОДЕССА».
Служба контрразведки именуется «Sodalitium Pianum», или сокращенно «Сапиньер», или еще короче СП. О ее создании распорядился в 1914 году Папа Пий X, от которого произошло и название. Первым главой СП был монсеньер Умберто Бенигни, в распоряжении которого поначалу имелась своя шифровальная машина и личный код, с которыми работали специально назначенные для этого две монашенки. Он поставил перед своими агентами задачу выявлять лиц из римской курии и духовенства в других странах, которые осмеливались отходить хоть чуть-чуть от церковных канонов или разглашать секретную информацию Ватикана. Сотрудниками службы могли являться только лица священнического звания.
Именно СП занималась предварительным расследованием по делу швейцарского теолога и философа Ганса Кюнга. Причиной послужило высказанное им мнение о предвзятом отношении Ватикана к женщине как к «существу ущербному». Кюнг прямо указал на то, что папы римские не всегда свободны от сексуальных комплексов и что обет безбрачия у католических священников приводит к «недостатку в них внутренней свободы». Папу Иоанна Павла II он назвал человеком, «уже причинившим ущерб служительницам церкви своими жесткими заявлениями против контроля над рождаемостью, против абортов и о том, что принятие женщиной священнического сана противоречит воле Божией».